UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C54A12.3C54A12.33.9999999999999994e-19chrII 5,261,141
2nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
3Y32B12A.5Y32B12A.5n/achrV 16,487,248contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
4C01B7.3C01B7.3n/achrV 8,783,769
5C33F10.4C33F10.4n/achrII 4,796,475
6T10E10.3T10E10.3n/achrX 6,313,109contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7C08A9.6C08A9.6n/achrX 17,095,336contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
8ZC239.2ZC239.2n/achrII 3,218,443contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
9Y73C8C.4Y73C8C.4n/achrV 3,101,079contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
10clec-227F08H9.5n/achrV 14,473,432C. elegans CLEC-227 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
11F26D2.15F26D2.15n/achrV 16,438,363contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
12R13.2R13.2n/achrIV 10,826,996contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
13B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
14F27C1.13F27C1.13n/achrI 5,445,369contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
15sra-39T21H8.4n/achrX 13,902,169C. elegans SRA-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
16T23F2.4T23F2.4n/achrX 5,514,897contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
17C31B8.1C31B8.1n/achrV 2,932,269
18C44H9.2C44H9.2n/achrV 12,832,016contains similarity to Antirrhinum majus ACC synthase 2 (Fragment).; TR:Q9ZT10
19srx-95F41G3.11n/achrII 6,753,887C. elegans SRX-95 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003915 (Polycystic kidney disease type 2 protein)
20ZK795.1ZK795.1n/achrIV 12,551,089contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
21F39F10.5F39F10.5n/achrX 16,913,317
22srz-78C09G12.3n/achrIV 3,492,493C. elegans SRZ-78 protein ;
23F58D12.1F58D12.1n/achrV 14,052,371contains similarity to White spot syndrome virus Wsv359 (WSSV418).; TR:Q8VAP2
24B0205.5B0205.5n/achrI 10,740,393
25M163.6M163.6n/achrX 14,463,353contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7SZA3
26ZK994.6ZK994.6n/achrV 8,503,564
27C06E4.1C06E4.1n/achrIV 7,283,548
28srd-32T19H12.5n/achrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
29ubc-21C06E2.3n/achrX 8,870,667C. elegans UBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00179 Ubiquitin-conjugating enzyme contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR009060 (UBA-like), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
30C07E3.5C07E3.5n/achrII 10,364,567contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
31srz-58F31E9.5n/achrV 17,318,799C. elegans SRZ-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32sre-20ZC455.7n/achrV 12,783,819C. elegans SRE-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
33clec-12T27F6.2n/achrI 12,477,625C. elegans CLEC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34sulp-5K12G11.2n/achrV 11,881,591sulp-5 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-5 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-5::GFP fusion is expressed in punctate structures irregularly distributed along the apical membrane of excretory cell canals and is also expressed weakly in adult seam cells.
35srg-7C18F10.8n/achrIII 6,267,278C. elegans SRG-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
36T22E5.3T22E5.3n/achrX 6,386,631contains similarity to Pfam domains PF01682 (DB module) , PF00041 (Fibronectin type III domain) contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR002602 (Protein of unknown function DB), IPR007110 (Immunoglobulin-like)
37flp-27C25H3.5n/achrII 5,681,799C. elegans FLP-27 protein ;
38srd-33T19H12.4n/achrV 4,873,237C. elegans SRD-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39T04C12.1T04C12.1n/achrV 11,058,930n/a
40srh-227C35D6.2n/achrIV 16,343,304C. elegans SRH-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41ZK1240.6ZK1240.6n/achrII 2,322,661contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
42lgc-6F17E9.8n/achrIV 8,341,064C. elegans LGC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
43R02D5.6R02D5.6n/achrV 14,513,495contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44str-44C42D4.4n/achrIV 7,177,788C. elegans STR-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45H01M10.2H01M10.2n/achrX 2,585,134contains similarity to Interpro domain IPR006220 (Anthranilate synthase component II/delta crystallin)
46M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
47nhr-188F47C10.7n/achrV 3,857,080C. elegans NHR-188 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48F25E5.9F25E5.9n/achrV 7,437,693
49C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
50F19B10.6F19B10.6n/achrII 3,663,696