UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C53D6.5C53D6.52.0000000000000002e-76chrIV 9,026,997contains similarity to Enterococcus hirae V-type sodium pump subunit F (EC 3.6.3.14) (Na(+)-translocating ATPasessubunit F).; SW:P43437
2F13H8.6F13H8.6n/achrII 6,285,852
3C18H2.1C18H2.1n/achrIII 7,667,218contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) (2), PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
4ZC190.8ZC190.8n/achrV 8,687,699contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
5bath-25T27C10.4n/achrI 10,877,883C. elegans BATH-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00036 (EF hand) (2), PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
6C02H7.2C02H7.2n/achrX 734,085contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7C29F9.5C29F9.5n/achrIII 118,236contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR003101 (Coactivator CBP, KIX), IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
8mps-3T06A4.2n/achrI 761,378mps-3 encodes a single-pass transmembrane protein that is related to the vertebrate KCNE proteins, also known as MinK-related peptides (MiRPs) that associate with, and regulate, pore-forming ion channels; mps-1 is required for the normal function of several neurons and thus for normal body touch sensation, chemotaxis to select molecules, osmotic avoidance, and nose-touch; when coexpressed in tissue culture cells with C. elegans KVS-1, MPS-3 is able to alter the activity of this potassium-selective channel, suggesting that MPS-3 functions in vivo to regulate KVS-1 activity in neurons in which the two proteins are coexpressed; in addition, activity of MPS-2, MPS-3, and KVS-1 coexpressed in culture suggests that these three proteins can form a functional ternary complex that genetic analyses indicate likely plays a role in regulating responsiveness to sodium; MPS-3 reporter fusions are expressed in the ADF amphid sensory neuron, the PVC and PVN neurons, and two neurons in the anterior bulb of the pharynx.
9R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
10R01H2.2R01H2.2n/achrIII 7,057,468contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
11R11.2R11.2n/achrX 16,184,757contains similarity to Homo sapiens Chromosome-associated kinesin KIF4A; ENSEMBL:ENSP00000262784
12ZK418.6ZK418.6n/achrIII 7,076,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13K06B4.3K06B4.3n/achrV 15,672,799contains similarity to Saccharomyces cerevisiae mRNA binding protein; SGD:YPR042C
14R05D7.2R05D7.2n/achrI 12,166,865contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
15Y6B3B.7Y6B3B.7n/achrI 13,748,017contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
16skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
17srt-44M199.1n/achrIV 15,105,017C. elegans SRT-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18T23G4.2T23G4.2n/achrIV 13,688,527contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
19srd-58E04F6.13n/achrII 7,204,421C. elegans SRD-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20srh-61T21B4.8n/achrII 12,515,614C. elegans SRH-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
21Y49A3A.4Y49A3A.4n/achrV 14,357,603contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
22ndx-2W02G9.1n/achrV 2,664,041ndx-2 encodes a NUDIX hydrolase; by sequence comparison, NDX-2 is predicted to be orthologous to human NUDT5 which, in vitro, possesses ADP-sugar diphosphatase activity; in C. elegans, loss of ndx-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, consistent with the proposed nonessential roles for Nudix proteins in eliminating potentially toxic nucleotide metabolites from cells and modulating levels of metabolic intermediates by shuttling them into alternative biochemical pathways.
23nhr-119K12H6.1n/achrII 2,799,024C. elegans NHR-119 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
24nlp-25Y43F8C.1n/achrV 19,607,891C. elegans NLP-25 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000817 (Prion protein)
25F28C10.4F28C10.4n/achrX 539,044
26F56F4.3F56F4.3n/achrI 6,142,912contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR002208 (SecY protein), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
27clec-139F35D11.10n/achrII 4,620,939C. elegans CLEC-139 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
28F21F8.5F21F8.5n/achrV 8,265,454
29W01B6.5W01B6.5n/achrIV 10,077,459contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
30Y116A8A.2Y116A8A.2n/achrIV 16,813,605contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
31sri-36F33H12.5n/achrII 2,584,688C. elegans SRI-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32Y43F8A.1Y43F8A.1n/achrV 19,370,930contains similarity to Rhizobium sp Probable conjugal transfer protein trbD.; SW:TRBD_RHISN
33C55B7.10C55B7.10n/achrI 6,502,907contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
34Y49E10.24Y49E10.24n/achrIII 12,486,416contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
35srd-71C13B7.4n/achrV 2,424,746C. elegans SRD-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001614 (Myelin proteolipid protein PLP), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
36R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
37T05A7.3T05A7.3n/achrII 4,676,002contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
38nhr-195F59E11.10n/achrV 8,971,529C. elegans NHR-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39F36D1.6F36D1.6n/achrI 11,270,696contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
40Y54E2A.5Y54E2A.5n/achrII 14,756,797
41F22D3.4F22D3.4n/achrII 6,925,039
42ZC155.2ZC155.2n/achrIII 5,219,635contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR009072 (Histone-fold)
43ins-37F08G2.6n/achrII 13,835,294ins-37 encodes an insulin-like peptide.
44Y113G7B.11Y113G7B.11n/achrV 20,209,977contains similarity to Naja atra Cardiotoxin 10 precursor.; TR:Q9W6W6
45F39G3.4F39G3.4n/achrV 4,725,680contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
46Y40B1A.3Y40B1A.3n/achrI 13,356,226contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region)
47kin-31B0523.1n/achrIII 8,672,572kin-31 encodes a predicted tyrosine protein kinase expressed in the nucleus and cytoplasm of body-wall muscle cells; the expression of kin-31 was experimentally verified by RT-PCR.
48Y7A5A.3Y7A5A.3n/achrX 15,783,069
49W03F11.4W03F11.4n/achrI 2,238,497contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
50Y113G7A.12Y113G7A.12n/achrV 20,140,914