UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sru-37C50C10.10chrV 9,806,002C. elegans SRU-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
2str-8T23D5.11n/achrV 15,755,686C. elegans STR-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3T24C4.4T24C4.4n/achrIII 873,063contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR008368 (Voltage-dependent calcium channel, gamma subunit), IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
4F53E10.4F53E10.4n/achrV 2,593,813
5sre-26Y57A10C.4n/achrII 12,419,774C. elegans SRE-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
6F28A10.4F28A10.4n/achrII 844,685contains similarity to Interpro domain IPR009061 (Putative DNA binding)
7C30A5.4C30A5.4n/achrIII 8,222,929contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
8C38H2.1C38H2.1n/achrIII 10,369,054contains similarity to Pfam domains PF00566 (TBC domain) , PF02759 (RUN domain) contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR004012 (RUN)
9B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
10C43C3.2C43C3.2n/achrX 9,695,245contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11T22B11.1T22B11.1n/achrIV 4,694,800
12str-27T23D5.1n/achrV 15,734,895C. elegans STR-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13C18G1.1C18G1.1n/achrV 4,779,553
14ssu-1Y113G7A.11n/achrV 20,126,167ssu-1 encodes, by alternative splicing, two isoforms of a cytosolic alcohol sulfotransferase that interacts in the ASJ amphid neurons with the stomatins UNC-1 and UNC-24; the longer SSU-1 isoform is required for normal anesthetic sensitivity and unc-1 phenotypes; ssu-1(fc73) suppresses the anesthetic sensitivity and uncoordinated phenotypes of unc-1 and unc-24 mutants; ssu-1(fc73), along with daf-12, suppresses the synthetic constitutive dauer-formation phenotype of fc83;unc-24(e138) mutants; ssu-1 suppression is rescued by transgenic expression of SSU-1 in the ASJ neurons alone, implying that sulfation is required for an endocrine function; SSU-1 protein sulfates 4-nitrophenol and 2-naphthol substrates, and bisphenol A, but not monoamines or hydroxysteroids; SSU-1 is cytosolic, but its activity is not detectable in cytosolic extracts; ssu-1 is strongly expressed in embryos, growing larvae, and dauer larvae; ssu-1 expression is increased in daf-2; by homology with other sulfotransferases, SSU-1 may link sulfates to the alcohol group of small molecules as part of detoxification or signal transduction.
15C53A5.5C53A5.5n/achrV 14,541,386contains similarity to Pfam domains PF02888 (Calmodulin binding domain) , PF03530 (Calcium-activated SK potassium channel) , PF07885 (Ion channel) contains similarity to Interpro domains IPR004178 (Calmodulin-binding), IPR015449 (Potassium channel, calcium-activated, SK), IPR011996 (Potassium channel, calcium-activated, SK, conserved region), IPR003931 (Potassium channel, calcium-activated, SK, conserved region, subgroup), IPR013099 (Ion transport 2)
16Y43F8C.15Y43F8C.15n/achrV 19,705,582
17ZK697.3ZK697.3n/achrV 1,729,883contains similarity to Interpro domain IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
18Y116A8A.6Y116A8A.6n/achrIV 16,826,929contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
19scrm-6F46A8.10n/achrI 11,254,608scrm-6 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); scrm-6(RNAi) animals have no obvious phenotype.
20tag-272C34B2.1n/achrI 10,689,540C. elegans TAG-272 protein ;
21sng-1T08A9.3n/achrX 7,328,590sng-1 encodes the C. elegans synaptogyrin ortholog, a vertebrate integral membrane synaptic vesicle protein; loss-of-function mutations in sng-1 result in no obvious defects in synaptogenesis or neuronal activity, suggesting that SNG-1 is likely required for more subtle neuronal functions; SNG-1::GFP reporters are expressed throughout the nervous system in neurons in the dorsal and ventral nerve cords, as well as the anterior nerve ring; SNG-1 colocalizes with the synaptic vesicle component SNT-1.
22ace-1W09B12.1n/achrX 16,370,244ace-1 encodes a class A acetylcholinesterase that functions redundantly with ACE-2 with respect to total class A acetylcholinesterase activity, and that genetically interacts with ace-2 and ace-3; ace-1 is expressed in the body wall muscle, sphincter muscle, head neurons, a few pharyngeal muscle cells, and the diagonal and spicule muscles of the male.
23exp-1H35N03.1n/achrII 6,159,051exp-1 encodes an excitatory, cation-selective GABA receptor; EXP-1 activity is essential for the enteric muscle contractions that are the third in a series of three independent muscle contractions controlling defecation, and when expressed in Xenopus oocytes, EXP-1 is capable of forming a cation-selective GABA receptor; a rescuing EXP-1::GFP reporter fusion is expressed in the intestinal and anal depressor muscles, where it localizes to regions consistent with the positions of neuromuscular junctions; expression is also observed in neurons, including PDA, RID, ADE, and SABD.
24clec-99ZK39.8n/achrI 11,157,780C. elegans CLEC-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25K03H6.5K03H6.5n/achrIV 1,531,807contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26F28H7.6F28H7.6n/achrV 10,755,523contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
27clec-158R13F6.8n/achrIII 6,859,120C. elegans CLEC-158 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
28str-162E03H12.1n/achrIV 4,993,123C. elegans STR-162 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29Y4C6B.3Y4C6B.3n/achrIV 5,335,043contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
31T27D1.3T27D1.3n/achrIII 3,684,552contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32AC7.3AC7.3n/achrIV 5,112,248
33clec-135C16A11.8n/achrII 4,257,930C. elegans CLEC-135 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
34F09C6.3F09C6.3n/achrV 16,879,465contains similarity to Saccharomyces cerevisiae DNA damage-responsive protein, expression is increased in response to heat-shock stress or treatments that produce DNA lesions; SGD:YMR173W
35clec-175R08C7.6n/achrIV 4,424,420C. elegans CLEC-175 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36T26E4.3T26E4.3n/achrV 15,783,606contains similarity to Pfam domain PF01531 (Glycosyl transferase family 11)
37E02H9.9E02H9.9n/achrIII 2,467,742
38C32B5.15C32B5.15n/achrII 971,803This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
39fbxa-99F36G9.14n/achrV 15,982,244This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
40srw-71F18E3.6n/achrV 7,430,329C. elegans SRW-71 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
41M28.9M28.9n/achrII 10,641,581contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000024599
42str-4C50B6.10n/achrV 13,338,836C. elegans STR-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43srw-140C03A7.3n/achrV 5,166,467C. elegans SRW-140 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
44F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
45clec-193Y116A8A.3n/achrIV 16,805,692C. elegans CLEC-193 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
464R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
47R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
48F58E6.1F58E6.1n/achrV 9,742,698n/a
49H32C10.1H32C10.1n/achrIV 5,935,928contains similarity to Interpro domains IPR006353 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, CECR5), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA)
50srh-74C45B11.4n/achrV 11,047,962C. elegans SRH-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)