UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1djr-1.2C49G7.116e-103chrV 4,054,635C. elegans DJR-1.2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01965 DJ-1/PfpI family contains similarity to Interpro domains IPR006287 (DJ-1), IPR002818 (ThiJ/PfpI)
2F21D9.3F21D9.3n/achrV 19,257,632contains similarity to Hepatitis B virus Large S protein (Major surface antigen).; TR:Q8JXA0
3ZC196.3ZC196.3n/achrV 8,737,532contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
4dct-14Y38H6C.3n/achrV 20,495,572C. elegans DCT-14 protein ; contains similarity to Rhizopus oryzae FK506-binding protein 4 (EC 5.2.1.8) (Peptidyl-prolyl cis-transsisomerase) (PPIase) (Rotamase).; SW:P0C1J6
5F46B3.9F46B3.9n/achrV 20,621,052contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
6cnc-7F53H2.2n/achrV 20,389,778C. elegans CNC-7 protein ;
7srr-7T01G5.4n/achrV 15,129,054C. elegans SRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domain IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species)
8fipr-21F41E7.5n/achrX 10,304,659C. elegans FIPR-21 protein ; contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG8157-PA;; FLYBASE:CG8157
9far-4F15B9.2n/achrV 12,999,023far-4 encodes a fatty acid and retinol-binding protein, paralogous to FAR-3 and FAR-5 and distantly homologous to FAR proteins of parasitic nematodes; FAR-4 binds lipids in vitro; far-4 is transcribed at highest levels in the fourth larval stage, and is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi assays.
10clec-101F15D3.2n/achrI 11,562,502C. elegans CLEC-101 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
11nhr-282F54B8.2n/achrV 15,812,667C. elegans NHR-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
12sru-23F36G9.6n/achrV 15,971,479C. elegans SRU-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
13srh-100C46E10.10n/achrII 3,713,935C. elegans SRH-100 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14C18H7.9C18H7.9n/achrIV 603,317contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
15F16B4.6F16B4.6n/achrV 1,588,179contains similarity to Pfam domain PF00550 Phosphopantetheine attachment site contains similarity to Interpro domains IPR006163 (Phosphopantetheine-binding), IPR009081 (Acyl carrier protein-like), IPR003231 (Acyl carrier protein (ACP))
16R04E5.9R04E5.9n/achrX 8,808,513contains similarity to Homo sapiens Triadin; ENSEMBL:ENSP00000333984
17clec-116K04H8.1n/achrI 14,251,698C. elegans CLEC-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
18spp-12T22G5.7n/achrV 13,890,091C. elegans SPP-12 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
19M01E10.3M01E10.3n/achrIII 2,054,148contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
20C34D1.4C34D1.4n/achrV 13,258,178
21F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659
22srx-43T10C6.3n/achrV 16,018,889C. elegans SRX-43 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
23F26A10.1F26A10.1n/achrX 7,627,709
24ZK822.2ZK822.2n/achrIV 11,922,736contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
25R102.3R102.3n/achrIV 10,691,049contains similarity to Broad bean wilt virus 2 210kDa protein.; TR:Q9E933
26fbxa-163C08E3.6n/achrII 1,610,019This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
27Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
28ZK643.6ZK643.6n/achrIII 8,958,109contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
29Y42A5A.3Y42A5A.3n/achrV 11,095,685contains similarity to Bacillus subtilis Hypothetical protein yhen.; TR:O07596
30F22E5.7F22E5.7n/achrII 2,642,443
31R03H10.5R03H10.5n/achrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
32C13A2.7C13A2.7n/achrV 7,266,655
33M04C7.3M04C7.3n/achrI 8,546,387contains similarity to Brucella melitensis Exopolyphosphatase (EC 3.6.1.11).; TR:Q8YCD4
34spp-9T25C12.2n/achrX 11,487,901C. elegans SPP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03489 Saposin-like type B, region 2 contains similarity to Interpro domains IPR008138 (Saposin-like type B, 2), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
35Y45F3A.4Y45F3A.4n/achrIII 10,573,829contains similarity to Interpro domain IPR008967 ()
36srd-47F17A2.11n/achrX 12,334,389C. elegans SRD-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37F15H10.5F15H10.5n/achrV 10,418,359contains similarity to Borrelia burgdorferi Hypothetical protein BB0170.; TR:O51192
38F44B9.9F44B9.9n/achrIII 8,030,412contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
39F11A5.13F11A5.13n/achrV 16,226,353contains similarity to Clostridium acetobutylicum MDR-type permease.; TR:Q97D15
40srz-19F56D6.4n/achrIV 3,920,703C. elegans SRZ-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41F35B3.3F35B3.3n/achrX 17,013,662
42T22B2.2T22B2.2n/achrX 3,922,438
43C08D8.1C08D8.1n/achrV 8,347,824contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44clec-211F19F10.6n/achrV 7,560,915C. elegans CLEC-211 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
45B0546.3B0546.3n/achrIV 3,380,351contains similarity to Pfam domain PF03226 Yippee putative zinc-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004910 (Yippee-like protein)
46T28A11.4T28A11.4n/achrV 3,274,213
47F40E3.5F40E3.5n/achrI 2,646,674contains similarity to Interpro domain IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
48srr-5C13D9.2n/achrV 5,009,463C. elegans SRR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domains IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species), IPR000146 (Inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase)
49Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
50C10C6.3C10C6.3n/achrIV 11,464,370contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Putative glycosidase of the cell wall, may have a role in cell wall architecture; SGD:YGR189C