UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C49G7.10C49G7.102.0000000000000002e-159chrV 4,041,191contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3F53E10.4F53E10.4n/achrV 2,593,813
4F08G2.5F08G2.5n/achrII 13,833,272contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
5srw-71F18E3.6n/achrV 7,430,329C. elegans SRW-71 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
6T24C4.4T24C4.4n/achrIII 873,063contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR008368 (Voltage-dependent calcium channel, gamma subunit), IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
7T22B11.1T22B11.1n/achrIV 4,694,800
8M163.1M163.1n/achrX 14,503,087contains similarity to Mus musculus Adapter-related protein complex 3 beta 1 subunit (Beta-adaptin 3A)s(AP-3 complex beta-3A subunit) (Beta-3A-adaptin).; SW:A3B1_MOUSE
9C55A6.6C55A6.6n/achrV 11,514,222contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
10M7.12M7.12n/achrIV 11,097,281contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
11sng-1T08A9.3n/achrX 7,328,590sng-1 encodes the C. elegans synaptogyrin ortholog, a vertebrate integral membrane synaptic vesicle protein; loss-of-function mutations in sng-1 result in no obvious defects in synaptogenesis or neuronal activity, suggesting that SNG-1 is likely required for more subtle neuronal functions; SNG-1::GFP reporters are expressed throughout the nervous system in neurons in the dorsal and ventral nerve cords, as well as the anterior nerve ring; SNG-1 colocalizes with the synaptic vesicle component SNT-1.
12C18G1.1C18G1.1n/achrV 4,779,553
13Y47H9A.1Y47H9A.1n/achrI 11,624,828contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
14fbxa-99F36G9.14n/achrV 15,982,244This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
15Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
16F18G5.5F18G5.5n/achrX 9,256,665
17arf-1.1F45E4.1n/achrIV 7,635,253arf-1.1 encodes a member of the ADP-ribosylation factor family.
18ZK697.3ZK697.3n/achrV 1,729,883contains similarity to Interpro domain IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
19R06C1.6R06C1.6n/achrI 11,950,040contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CCR4 Associated Factor 120 kDa; SGD:YNL278W
20C38H2.1C38H2.1n/achrIII 10,369,054contains similarity to Pfam domains PF00566 (TBC domain) , PF02759 (RUN domain) contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR004012 (RUN)
21F28A10.4F28A10.4n/achrII 844,685contains similarity to Interpro domain IPR009061 (Putative DNA binding)
22clec-158R13F6.8n/achrIII 6,859,120C. elegans CLEC-158 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
23R13A1.5R13A1.5n/achrIV 7,191,489
24F37A4.4F37A4.4n/achrIII 6,715,740contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
25F46F5.4F46F5.4n/achrII 805,580contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
26fbxa-129F59A1.8n/achrV 17,656,084C. elegans FBXA-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
27F44G4.6F44G4.6n/achrII 9,001,316contains similarity to Interpro domain IPR001209 (Ribosomal protein S14)
28sul-2D1014.1n/achrV 8,158,775sul-2 is orthologous to the human gene ARYLSULFATASE A (ARSA; OMIM:250100), which when mutated leads to metachromatic leukodystrophy.
29ttr-28R90.3n/achrV 12,904,670C. elegans TTR-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
30srw-141H27D07.2n/achrV 2,937,953C. elegans SRW-141 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
314R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
32B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
33aqp-3Y69E1A.7n/achrIV 10,962,555aqp-3 encodes an aquaglyceroporin whose expression in Xenopus oocytes increases water or glycerol permeability five- to seven-fold; loss of AQP-3 activity via mutation or RNAi results in no obvious defects; however, AQP-3, in conjunction with AQP-2, AQP-4, and AQP-8, is weakly required for recovery from hypotonic stress; AQP-3 is expressed in the intestine, excretory cell, seminal vesicle, and vas deferens.
34gab-1ZC482.1n/achrIII 12,775,682gab-1 encodes a gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor beta-like subunit with both the neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding and transmembrane domains; gab-1 can form a GABA-responsive channel when co-expressed with alpha/gamma type subunits in a heterologous expression system; experiments with gab-1 indicate that GABA receptors are involved in the mechanism of resistance to the widely used broad-spectrum anthelmintic drug Ivermectin.
35Y62H9A.8Y62H9A.8n/achrX 11,891,763contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IEC0
36F37E3.3F37E3.3n/achrI 6,430,598contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
37ins-30ZC334.2n/achrI 14,035,617ins-30 encodes an insulin-like peptide.
38Y39A3A.4Y39A3A.4n/achrIII 2,074,752contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
39tsp-1C02F5.8n/achrIII 8,238,638C. elegans TSP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
40F09E8.1F09E8.1n/achrIV 13,141,838contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domains IPR011052 (Proteinase and amylase inhibitor), IPR002593 (Protein of unknown function DX)
41C26F1.6C26F1.6n/achrV 7,772,218C26F1.6 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C26F1.6 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
42nhr-6C48D5.1n/achrIII 3,576,162nhr-6 encodes a nuclear receptor of the NR4A4 subfamily that is orthologous to the mammalian NGFI-B receptors and the Drosophila HR38 nuclear receptor (DHR38) that has been implicated in molting and metamorphosis; by homology, NHR-6 likely functions as a transcription factor that, based upon RNAi experiments, is required for normal ovulation and/or spermathecal development or function; an nhr-6 reporter fusion is expressed primarily in the anterior and posterior spermatheca during L3 and L4 larval stages, with some weak and variable expression also observed in two chemosensory neurons; nhr-6 mRNA is expressed in an oscillating manner throughout larval development, in a pattern that is slightly irregular with respect to the timing of larval molts and that exhibits consistently lower expression at the times when these molts actually occur.
43C18H7.6C18H7.6n/achrIV 590,772contains similarity to Interpro domain IPR000817 (Prion protein)
44R05G6.1R05G6.1n/achrIV 7,539,920
45F33E2.6F33E2.6n/achrI 12,589,287contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
46F39G3.4F39G3.4n/achrV 4,725,680contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
47sol-1C15A11.3n/achrI 7,392,485C. elegans SOL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
48flp-17C52D10.11n/achrIV 17,191,022C. elegans FLP-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
49C32B5.15C32B5.15n/achrII 971,803This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
50C01B12.4C01B12.4n/achrII 7,948contains similarity to Interpro domain IPR005178 (Protein of unknown function DUF300)