UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C47F8.7C47F8.79.999999999999999e-87chrI 12,326,720
2ugt-18ZC443.5n/achrV 12,821,489C. elegans UGT-18 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
3Y106G6H.16Y106G6H.16n/achrI 10,475,167contains similarity to Salmonella typhimurium Putative cytoplasmic protein (STMF1.42 protein).; TR:Q9L9K2
4H12D21.4H12D21.4n/achrV 14,892,420contains similarity to Pfam domain PF00581 Rhodanese-like domain contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR001307 (Thiosulphate sulphurtransferase, conserved site)
5R09D1.1R09D1.1n/achrII 9,442,815contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
6R07C3.9R07C3.9n/achrII 912,522
7hot-6C13G3.2n/achrV 11,021,972C. elegans HOT-6 protein ;
8W02D7.8W02D7.8n/achrV 8,305,769
9ZK177.1ZK177.1n/achrII 5,527,848
10W07A12.6W07A12.6n/achrII 9,158,925contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
11B0563.8B0563.8n/achrX 9,174,023
12F59F5.4F59F5.4n/achrX 10,543,156contains similarity to Brugia malayi Hypothetical protein (Fragment).; TR:P90701
13tag-40R02C2.3n/achrV 249,183C. elegans TAG-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
14col-165F14H12.1n/achrX 4,354,189C. elegans COL-165 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
15B0416.4B0416.4n/achrX 9,279,335contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000956 (Stathmin), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
16D1022.3D1022.3n/achrII 7,455,664contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
17cut-6M142.2n/achrIII 10,913,915C. elegans CUT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00100 (Zona pellucida-like domain) , PF00092 (von Willebrand factor type A domain) contains similarity to Interpro domains IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
18R07C3.2R07C3.2n/achrII 942,067
19W07B8.4W07B8.4n/achrV 1,131,011contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
20W06D11.2W06D11.2n/achrX 12,296,301
21F58H7.7F58H7.7n/achrIV 911,281This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
22T22C8.4T22C8.4n/achrII 8,623,075contains similarity to Interpro domains IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
23T09E11.10T09E11.10n/achrI 12,346,532contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
24C09G9.5C09G9.5n/achrIV 8,887,547contains similarity to Interpro domain IPR008992 ()
25F55G7.2F55G7.2n/achrX 11,930,695contains similarity to Pfam domain PF08123 Histone methylation protein DOT1 contains similarity to Interpro domain IPR013110 (Histone methylation DOT1)
26fbxb-68F09C3.3n/achrI 14,286,378This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
27C17H1.2C17H1.2n/achrI 13,102,913contains similarity to Apple stem grooving virus Genome polyprotein [Contains: RNA replicase (EC 2.7.7.48); Helicase;sCoat protein].; SW:POLR_ASGVP
28Y32B12A.5Y32B12A.5n/achrV 16,487,248contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
29B0334.4B0334.4n/achrII 11,496,096contains similarity to Pfam domain PF04707 PRELI-like family contains similarity to Interpro domain IPR006797 (MSF1)
30btb-10K02E7.9n/achrII 1,060,263C. elegans BTB-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
31F26D2.15F26D2.15n/achrV 16,438,363contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
32Y6E2A.4Y6E2A.4n/achrV 15,713,920contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
33F53F4.4F53F4.4n/achrV 13,596,162contains similarity to Candida albicans Chitinase 3 precursor (EC 3.2.1.14).; SW:CHI3_CANAL
34Y38H6C.19Y38H6C.19n/achrV 20,548,064contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
35srw-48F26D2.9n/achrV 16,421,858C. elegans SRW-48 protein ; contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MPHOSPH1; ENSEMBL:ENSP00000377830
36F55H2.5F55H2.5n/achrIII 9,512,031contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
37C54A12.3C54A12.3n/achrII 5,261,141
38K01H12.1K01H12.1n/achrIV 9,707,386K01H12.1 encodes a small protein conserved in diverse eukaryotes, with a CSL motif (a probable zinc finger, sometimes found associated with the N-terminal domain of DnaJ protein); K01H12.1 is probably a small subunit or ancillary protein of RNA polymerase II Elongator or of a hypothetical diphthamide synthase complex; K01H12.1 is orthologous to to mammalian DESR1 (diphtheria toxin and Pseudomonas exotoxin A sensitivity required gene 1) and S. cerevisiae KTI11; DESR1, and probably KTI11, enables the first step in posttranslational modification of histidine to dipthamide; K01H12.1 has no obvious function in mass RNAi assays.
39K06H6.6K06H6.6n/achrV 584,556contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
40F26D11.6F26D11.6n/achrV 7,955,880
41fbxb-16ZC204.10n/achrII 1,651,202fbxb-16 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; FBXB-16 also contains a C-terminal type 2 F-box-associated domain of presently unknown function.
42nhr-2C32F10.6n/achrI 5,819,797nhr-2 encodes a member of the nuclear hormone receptor family that is required for embryonic viability and morphogenesis; expressed during embryogenesis.
43F08H9.3F08H9.3n/achrV 14,462,384F08H9.3 encodes a heat shock protein (HSP) of the HSP16 class; unlike most HSP16s in C. elegans, it is specifically expressed in a particular tissue (the larval pharynx and the anterior adult pharynx), and its expression is not strongly induced by heat shock; however, F08H9.3 expression is increased by heat shock (with adult expression in the full pharynx) and probably aids heat shock resistance, since F08H9.3(RNAi) animals have sensitivity to heat shock that is sporadically higher than normal; in general, HSP16 proteins are thought to act as passive ligands for unfolded proteins that keep them safe from aggregation until the proteins can be refolded by a large (ATP-consuming) HSP.
44B0281.6B0281.6n/achrII 2,301,816contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR000210 (BTB/POZ-like)
45T15D6.7T15D6.7n/achrI 12,387,268contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
46C43F9.4C43F9.4n/achrIV 10,588,322
47bath-10Y49F6C.4n/achrII 3,375,923C. elegans BATH-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
48F57E7.2F57E7.2n/achrV 16,482,980contains similarity to Psilotum nudum Hypothetical protein.; TR:Q8WHW9
49T12A2.3T12A2.3n/achrIII 6,241,137
50T24C4.2T24C4.2n/achrIII 868,674