UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C47C12.2C47C12.21.0000000000000001e-23chrX 7,754,107
2str-18T23D5.6n/achrV 15,741,213C. elegans STR-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3srg-22Y25C1A.10n/achrII 3,092,472C. elegans SRG-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
4D1044.4D1044.4n/achrIII 5,521,831
5F20D1.7F20D1.7n/achrX 14,989,294contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR007110 (Immunoglobulin-like)
6clec-127W10G11.5n/achrII 3,568,702C. elegans CLEC-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
7str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8srx-112T24E12.8n/achrII 3,764,010C. elegans SRX-112 protein ;
9F40G12.4F40G12.4n/achrV 14,268,178contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
10M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
11pqn-62T03G11.1n/achrX 5,200,980The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
12F52E1.3F52E1.3n/achrV 8,395,551
13ZK1037.1ZK1037.1n/achrV 15,311,784contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
14ZC196.6ZC196.6n/achrV 8,727,690contains similarity to Mycoplasma genitalium Protein P200.; SW:Q49429
15srd-51F15A2.3n/achrX 13,483,631C. elegans SRD-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16C44H9.2C44H9.2n/achrV 12,832,016contains similarity to Antirrhinum majus ACC synthase 2 (Fragment).; TR:Q9ZT10
17srt-61T27C10.1n/achrI 10,905,441C. elegans SRT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18T26E4.1T26E4.1n/achrV 15,780,361contains similarity to Pfam domain PF01030 (Receptor L domain)
19C47F8.1C47F8.1n/achrI 12,335,819This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
20C08B11.3C08B11.3n/achrII 8,025,126contains similarity to Pfam domain PF01388 ARID/BRIGHT DNA binding domain contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR016024 (Armadillo-type fold), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type), IPR001606 (AT-rich interaction region)
21nhr-111F44G3.9n/achrV 16,123,891nhr-111 encodes a member of the nuclear receptor superfamily; by homology, NHR-111 is predicted to function as a ligand-dependent transcriptional regulator, but as loss of nhr-111 activity via large-scale RNAi screens does not result in any abnormalities, the precise role of NHR-111 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; an nhr-111 reporter construct is expressed in embryos and early larvae in a pair of neurons in the ventral ganglion of the head and in two cells that may be the somatic gonad precursors.
22srw-55T05G11.6n/achrV 15,939,538C. elegans SRW-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
23lgc-9C04C3.2n/achrIV 3,417,455C. elegans LGC-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
24C14E2.6C14E2.6n/achrX 1,828,107contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
25srx-19T05A12.1n/achrIV 6,874,033C. elegans SRX-19 protein ;
26W04B5.2W04B5.2n/achrIII 2,425,901contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR005386 (EDG-8 sphingosine 1-phosphate receptor)
27srg-16F15A4.4n/achrII 12,468,465C. elegans SRG-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
28srx-93F59B1.3n/achrV 3,620,070C. elegans SRX-93 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
29tax-2F36F2.5n/achrI 9,023,241tax-2 is orthologous to the human gene ROD PHOTORECEPTOR CNG-CHANNEL BETA SUBUNIT (CNGB1; OMIM:600724), which when mutated leads to disease.
30srw-113ZK1037.9n/achrV 15,333,837C. elegans SRW-113 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
31fbxb-108F08D12.6n/achrII 2,766,099This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
32srh-228C35D6.1n/achrIV 16,340,479C. elegans SRH-228 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33T27E7.5T27E7.5n/achrIV 14,537,655contains similarity to Bacillus stearothermophilus D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase precursor (EC 3.4.16.4) (DD-speptidase) (DD-carboxypeptidase) (CPase) (PBP5).; SW:DACA_BACST
34ZK816.3ZK816.3n/achrX 3,348,370
35str-204F10D2.1n/achrV 7,160,334C. elegans STR-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36srh-291Y94A7B.3n/achrV 17,807,015C. elegans SRH-291 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37elks-1F42A6.9n/achrIV 3,346,268elks-1 encodes the C. elegans homolog of the vertebrate ELKS (glutamine, leucine, lysine, and serine-rich) proteins; although loss of elks-1 activity results in no obvious developmental or behavioral abnormalities, the ELKS-1 C-terminus interacts with the PDZ domain of UNC-10/RIM in vitro, and in vivo each protein appears to play a nonessential role in localizing the other to the presynaptic active zone; in addition to the active zone, ELKS-1 also localizes to the pharyngeal basal lamina.
38scl-21Y43F8B.5n/achrV 19,495,187C. elegans SCL-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
39C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
40age-1B0334.8n/achrII 11,523,196age-1 encodes the C. elegans ortholog of the phosphoinositide 3-kinase (PI3K) p110 catalytic subunit; AGE-1, supplied maternally and embryonically, is a central component of the C. elegans insulin-like signaling pathway, lying downstream of the DAF-2/insulin receptor and upstream of both the PDK-1 and AKT-1/AKT-2 kinases and the DAF-16 forkhead type transcription factor, whose negative regulation is the key output of the insulin signaling pathway; in accordance with its role in insulin signaling, AGE-1 activity is required for regulation of metabolism, life span, dauer formation, stress resistance, salt chemotaxis learning, fertility, and embryonic development; although the age-1 expression pattern has not yet been reported, ectopic expression studies indicate that pan-neuronal age-1 expression is sufficient to rescue life-span defects, while neuronal, intestinal, or muscle expression can partially rescue dauer formation, and neuronal or muscle expression can rescue metabolic defects.
41mdf-1C50F4.11n/achrV 9,542,977mdf-1 encodes a coiled-coil domain-containing protein that is orthologous to the Saccharomyces cerevisiae mitotic spindle checkpoint protein Mad1p; consistent with a role as a checkpoint protein, MDF-1 is required in C. elegans for mitotic genome stability and hence, long-term survival and fertility; in vitro, MDF-1 interacts with MDF-2, the C. elegans Mad2p ortholog.
42F19B10.6F19B10.6n/achrII 3,663,696
43D1053.2D1053.2n/achrX 11,728,445contains similarity to Pfam domain PF08123 Histone methylation protein DOT1 contains similarity to Interpro domain IPR013110 (Histone methylation DOT1)
44T27A10.5T27A10.5n/achrX 3,573,294
45F14F9.3F14F9.3n/achrV 5,139,826contains similarity to Interpro domain IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
46ugt-6ZC455.4n/achrV 12,796,799C. elegans UGT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
47xnp-1B0041.7n/achrI 4,668,742xnp-1 encodes an ATP-dependent DNA helicase of the SNF2 family that is orthologous to human XNP/ATR-X, which is associated with a number of X-linked mental retardation syndromes; in C. elegans, xnp-1 activity is required at high temperatures for embryogenesis, somatic gonad development, fertility, and vulval morphogenesis; in addition, animals doubly mutant for xnp-1 and lin-35/Rb, hpl-2/HP1, or nucleosome remodelling and histone deacetylase (NuRD) complex members such as lin-53 and let-418, display larval arrest with growth cessation but continued cell proliferation; xnp-1 is also required, with lin-35/Rb and hpl-2/HP1, for proper regulation of transgene expression; xnp-1 mRNA, detectable in embryos and the germline by in situ hybridization, is expressed at highest levels in embryos with decreasing levels seen in successive larval stages; xnp-1 transcriptional reporter fusions exhibit strong expression beginning at mid-embryogenesis but fading by embryonic morphogenesis; at hatching, expression is observed in all dividing cells including the P lineage, and at later larval stages expression is observed in the vulval precursor cells.
48C30G12.3C30G12.3n/achrII 7,275,917
49srz-53Y102A5C.23n/achrV 16,977,768C. elegans SRZ-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50C54C8.5C54C8.5n/achrI 12,454,277contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)