UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C46F11.3C46F11.36e-173chrIII 3,649,797contains similarity to Interpro domain IPR006578 (MADF)
2sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
3set-25Y43F4B.3n/achrIII 13,288,364set-25 encodes a putative histone H3 lysine-9 methyltransferase, with a C-terminal SET domain but no obvious non-nematode orthologs; SET-25 is required both for normal axonal guidance during development, and for a normally low somatic mutation rate; set-25(RNAi) animals have defective DD/VD motoneuron commissures, and also display an elevated somatic mutation rate, but are otherwise normal.
4F28D1.1F28D1.1n/achrIV 12,373,435contains similarity to Pfam domains PF08149 (BING4CT (NUC141) domain) , PF00400 (WD domain, G-beta repeat) contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR012952 (BING4, C-terminal), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
5fbxa-43T20H9.2n/achrIII 2,258,234C. elegans FBXA-43 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
6D2030.3D2030.3n/achrI 7,579,667contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
7F44F4.9F44F4.9n/achrII 10,915,378contains similarity to Toxoplasma gondii Membrane skeletal protein IMC1.; TR:Q962H9
8pstk-1Y49E10.22n/achrIII 12,467,328C. elegans PSTK-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF08433 Chromatin associated protein KTI12 contains similarity to Interpro domain IPR013641 (Chromatin associated protein KTI12)
9F16H6.9F16H6.9n/achrV 18,219,656contains similarity to Mus musculus Calpain 6.; SW:CAN6_MOUSE
10C56A3.5C56A3.5n/achrV 13,552,624contains similarity to Ureaplasma parvum Hypothetical protein UU346.; TR:Q9PQE5
11uri-1C55B7.5n/achrI 6,495,201uri-1 encodes a molecular chaperone orthologous to the unconventional prefoldin RPB5 (RNA polymerase subunit 5) interactor, URI; in C.elegans, URI-1 activity is required for suppressing endogenous genotoxic DNA damage and thus, is essential for maintenance of genome integrity (DNA stability) and progression through the mitotic and meiotic cell cycles, particularly during germ cell development; URI-1 activity is also required for development of some somatic structures, such as the vulva, and for RNA interference; uri-1 mRNA is germline-enriched.
12ZC513.5ZC513.5n/achrV 8,037,288contains similarity to Pfam domain PF03901 Alg9-like mannosyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR005599 (Alg9-like mannosyltransferase)
13spe-42B0240.2n/achrV 11,735,328C. elegans SPE-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF07782 DC-STAMP-like protein contains similarity to Interpro domain IPR012858 (DC-STAMP-like)
14str-244C50H11.9n/achrV 3,058,396C. elegans STR-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15nhr-258C26B2.4n/achrIV 8,045,986C. elegans NHR-258 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
16W06E11.1W06E11.1n/achrIII 643,797contains similarity to Pfam domain PF04801 Sin-like protein conserved region contains similarity to Interpro domain IPR006886 (Sin-like protein conserved region)
17W01D2.5W01D2.5n/achrII 14,813,623contains similarity to Interpro domain IPR005178 (Protein of unknown function DUF300)
18K11H12.1K11H12.1n/achrIV 652,824contains similarity to Pfam domain PF01722 BolA-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002634 (BolA-like protein)
19nhr-59T27B7.1n/achrV 2,277,137C. elegans NHR-59 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
20nhr-177F16B4.1n/achrV 1,611,519C. elegans NHR-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
21Y54G11A.1Y54G11A.1n/achrII 14,262,654contains similarity to Mesocricetus auratus Nucleolin (Protein C23).; SW:NUCL_MESAU
22C04H5.1C04H5.1n/achrII 14,534,610contains similarity to Pfam domain PF03966 Trm112p-like protein contains similarity to Interpro domain IPR005651 (Protein of unknown function DUF343)
23W09C3.4W09C3.4n/achrI 4,705,213contains similarity to Pfam domain PF05158 RNA polymerase Rpc34 subunit contains similarity to Interpro domains IPR016049 (RNA polymerase Rpc34-like), IPR007832 (RNA polymerase Rpc34)
24R52.6R52.6n/achrII 2,112,662contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
25srh-239T26H5.3n/achrV 15,446,542C. elegans SRH-239 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26C25G6.1C25G6.1n/achrX 1,271,143contains similarity to Pfam domain PF03803 Scramblase contains similarity to Interpro domain IPR005552 (Scramblase)
27C34E10.8C34E10.8n/achrIII 5,251,598contains similarity to Leishmania major strain Friedlin Proteophosphoglycan 5.; TR:Q4FX62
28bath-19F59H6.1n/achrII 2,037,587C. elegans BATH-19 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) (3), PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
29dod-18C54G4.6n/achrI 8,020,275dod-18 encodes a Maf-like protein required for normally short lifespan; dod-18 is repressed in daf-2 mutants and induced in daf-16 mutants, and dod-18(RNAi) lengthens lifespan by 30%; MAF-like proteins are ubiquitous among eukarya, bacteria, and archaea; DOD-18 is orthologous to the N-terminal ~200 residues of human ASMTL (OMIM:300162), and to Bacillus subtilis Maf (Multicopy Associated Filamentation) protein, which inhibits septum formation; while the specific biochemical function of Maf-like proteins is unknown, the tertiary structure of B. subtilis Maf is consistent with its binding nucleic acid.
30agt-2F09E5.13n/achrII 5,372,696agt-2 encodes a paralog of the DNA repair enzyme O6-Alkylguanine DNA-alkyltransferase (AGT); AGT-2 has AGT biochemical activity and is expressed at all developmental stages.
31srz-94F49H6.11n/achrV 17,034,553C. elegans SRZ-94 protein ;
32srg-4T12A2.12n/achrIII 6,261,094C. elegans SRG-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
33F45F2.5F45F2.5n/achrV 8,531,457contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
34ZC239.16ZC239.16n/achrII 3,225,022contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
35T23B12.1T23B12.1n/achrV 8,469,517contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
36ggr-3F09C12.1n/achrII 5,131,702ggr-3 encodes a predicted member of the GABA/ glycine receptor family of ligand-gated chloride channels; expressed in the AVA, AVB, SMDD, DVA, SIAD, and in some other neurons of the nerve ring.
37F41G4.1F41G4.1n/achrX 16,841,928contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus 33 kDa inner dynein arm light chain, axonemal (p33).; SW:Q26630
38ZK858.7ZK858.7n/achrI 9,143,169contains similarity to Pfam domain PF04189 Gcd10p family contains similarity to Interpro domains IPR007316 (Eukaryotic initiation factor 3, gamma subunit), IPR017423 (tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase, non-catalytic TRM6 subunit)
39F54D11.3F54D11.3n/achrV 4,636,257
40ZC302.3ZC302.3n/achrV 10,739,944contains similarity to Adoxophyes honmai nucleopolyhedrovirus Hypothetical protein.; TR:Q80LN9
41Y116A8C.8Y116A8C.8n/achrIV 16,932,518contains similarity to Interpro domain IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
42srh-141T08G3.5n/achrV 16,444,803C. elegans SRH-141 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43crn-5C14A4.5n/achrII 10,593,065C. elegans CRN-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01138 3' exoribonuclease family, domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001247 (Exoribonuclease, phosphorolytic domain 1)
44mdt-27T18H9.6n/achrV 9,210,879C. elegans MDT-27 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003983 (Leukotriene B4 type 1 receptor)
45F54D12.4F54D12.4n/achrII 1,368,200
46srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47str-84F59E11.13n/achrV 8,980,200C. elegans STR-84 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48T05A8.2T05A8.2n/achrII 2,710,658
49ZK1236.5ZK1236.5n/achrIII 8,431,825ZK1236.5 encodes a protein with no obvious non-nematode homologs; either ZK1236.9, or ZK1236.5, or both proteins weakly inhibit DHC-1 in vivo; likewise, either ZK1236.5, or ZK1236.9, or both proteins are required in mass RNAi assays for normal osmoregulation and normally rapid growth.
50F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270