UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C46E10.5C46E10.50chrII 3,712,130
2F28B4.1F28B4.1n/achrX 3,205,615
3glb-11C36E8.2n/achrIII 3,990,752glb-11 encodes a globin; glb-11 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-11 has no obvious function in mass RNAi assays; glb-11 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background.
4T05A7.9T05A7.9n/achrII 4,684,669contains similarity to Pfam domain PF01744 GLTT repeat (6 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008164 (Repeat of unknown function XGLTT)
5H36L18.1H36L18.1n/achrX 12,650,135contains similarity to Pfam domains PF00413 (Matrixin) , PF00045 (Hemopexin) (3)contains similarity to Interpro domains IPR000585 (Hemopexin), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR001818 (Peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin)
6T02H6.8T02H6.8n/achrII 681,180
7flp-4C18D1.3n/achrII 10,054,913C. elegans FLP-4 protein ;
8F16C3.2F16C3.2n/achrI 10,152,680contains similarity to Clostridium acetobutylicum DNA repair protein recN, ATPase.; TR:Q97HD9
9pqn-84Y41C4A.5n/achrIII 11,701,451The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
10F10D11.5F10D11.5n/achrI 8,443,821contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
11srsx-30C51E3.5n/achrV 10,159,536C. elegans SRSX-30 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12str-129F58G4.5n/achrV 8,091,709C. elegans STR-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
14F02D10.3F02D10.3n/achrX 13,461,339contains similarity to Escherichia coli;Escherichia coli O6;Escherichia coli O157:H7 Hypothetical protein yeaG.; SW:YEAG_ECOLI
15Y116A8C.33Y116A8C.33n/achrIV 17,113,736contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
16F21D9.4F21D9.4n/achrV 19,255,280contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
17F49C12.1F49C12.1n/achrIV 9,295,603contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
18Y53C10A.5Y53C10A.5n/achrI 12,000,702contains similarity to Interpro domain IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)
19Y48A6B.1Y48A6B.1n/achrIII 10,993,565contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
20R10E4.3R10E4.3n/achrIII 4,286,638contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YIL149C
21R10F2.4R10F2.4n/achrIII 2,921,110contains similarity to Interpro domain IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
22php-3Y75B8A.1n/achrIII 12,075,804C. elegans PHP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
23W02B8.2W02B8.2n/achrII 13,911,962contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00780 (CNH domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001180 (Citron-like), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
24Y7A5A.6Y7A5A.6n/achrX 15,798,435contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Putative transcriptional regulatory protein, phd finger.; TR:Q9HDV4
25Y7A5A.2Y7A5A.2n/achrX 15,772,148contains similarity to Aquifex aeolicus Hypothetical protein AQ_372.; SW:Y372_AQUAE
26R02F11.2R02F11.2n/achrV 4,795,145
27Y81G3A.4Y81G3A.4n/achrII 13,092,774contains similarity to Guillardia theta 60S acidic ribosomal protein P0.; TR:Q98S65
28R13A1.1R13A1.1n/achrIV 7,220,097
29zig-8Y39E4B.8n/achrIII 13,126,726zig-8 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-8::gfp reporter fusion is expressed in the PVT neuron and in pharyngeal muscle.
30srt-2Y45G12C.5n/achrV 2,545,033C. elegans SRT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31W03F9.4W03F9.4n/achrV 149,461contains similarity to Pfam domain PF00755 Choline/Carnitine o-acyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR000542 (Acyltransferase ChoActase/COT/CPT), IPR001644 (C3A-anaphylatoxin receptor)
32K09D9.3K09D9.3n/achrV 4,020,029
33srt-26C24B9.2n/achrV 2,716,136C. elegans SRT-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
34nhr-204R02C2.4n/achrV 256,479C. elegans NHR-204 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35F14H12.6F14H12.6n/achrX 4,357,251
36T05C1.2T05C1.2n/achrII 4,482,363
37E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
38T11F1.3T11F1.3n/achrII 2,955,703
39C31E10.3C31E10.3n/achrX 13,987,732contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
40srxa-15Y44A6B.2n/achrV 20,638,710C. elegans SRXA-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
41unc-9R12H7.1n/achrX 13,214,484unc-9 encodes an innexin, an integral transmembrane channel protein that is a structural component of invertebrate gap junctions; UNC-9 is required for normal forward locomotion and egg-laying and also plays a role in the response to antihelminthics and volatile anesthetics; UNC-9 may form a functional pair with UNC-7, another C. elegans innexin, as mutations in unc-7 result in defects nearly identical to those in unc-9 mutant animals.
42F23H11.7F23H11.7n/achrIII 918,259
43F55G7.1F55G7.1n/achrX 11,925,643contains similarity to Galleria mellonella Sericin-2 (Silk gum protein 2) (Fragment).; SW:SER2_GALME
44F16G10.11F16G10.11n/achrII 2,392,784contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
45dmd-4C27C12.6n/achrX 14,859,502C. elegans DMD-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00751 (DM DNA binding domain) , PF03474 (DMRTA motif) contains similarity to Interpro domains IPR005173 (DMRTA motif), IPR001275 (DM DNA-binding)
46C33E10.5C33E10.5n/achrX 17,276,148contains similarity to Interpro domain IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
47F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
48Y54E2A.2Y54E2A.2n/achrII 14,750,101contains similarity to Interpro domain IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
49T07A5.3T07A5.3n/achrIII 10,301,759contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
50T28F12.1T28F12.1n/achrV 4,514,448