UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ilys-1C45G7.19.999999999999999e-92chrIV 2,470,894C. elegans ILYS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
2ZC13.2ZC13.2n/achrX 881,854
3C10E2.2C10E2.2n/achrX 16,746,897This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
4C38H2.2C38H2.2n/achrIII 10,383,431C38H2.2 encodes a core 1 UDP-Gal:GalNAcalpha1-Ser/Thr beta1,3-galactosyltransferase (core 1 beta3-Gal-T or T-synthase, EC2.4.1.122); C38H2.2 protein is predicted to be primarily extracellular, with an N-terminal transmembrane domain; C38H2.2 shares 6 conserved cysteine residues with all known T-synthases, and is ubiquitously expressed; enzymatically active C38H2.2 can be generated from insect but not mammalian cells, suggesting that invertebrate-specific chaperones are required for its activity.
5F07C4.11F07C4.11n/achrV 7,642,685contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
6nhr-278ZK6.1n/achrV 409,173C. elegans NHR-278 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7srd-12C39H7.6n/achrIV 5,629,500C. elegans SRD-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001073 (Complement C1q protein)
8srv-36F57G8.8n/achrV 16,324,110C. elegans SRV-36 protein ;
9C34D10.1C34D10.1n/achrX 8,030,420contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
10F45C12.3F45C12.3n/achrII 1,731,227contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
11K10C3.4K10C3.4n/achrI 9,861,391contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 98.; SW:Q6INX1
12C07C7.1C07C7.1n/achrIV 9,184,575contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_0790.; TR:Q98RD0
13F34H10.1F34H10.1n/achrX 9,626,427contains similarity to Homo sapiens ubiquitin and ribosomal protein S27a precursor; ENSEMBL:ENSP00000272317
14sru-12Y45F10B.5n/achrIV 13,583,783C. elegans SRU-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
15K01A6.5K01A6.5n/achrIV 11,743,140contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q14202 Zinc finger protein 261; ENSEMBL:ENSP00000322845
16pes-1T28H11.4n/achrIV 5,004,039C. elegans PES-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00250 Fork head domain contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR001766 (Fork head transcription factor)
17C48C5.1C48C5.1n/achrX 8,982,602contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18C04A11.1C04A11.1n/achrX 13,661,662contains similarity to Sorghum bicolor Extensin precursor (Proline-rich glycoprotein).; SW:EXTN_SORBI
19C46G7.3C46G7.3n/achrIV 6,007,411contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
20C05G5.5C05G5.5n/achrX 14,758,374contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000360931
21F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
22W04E12.3W04E12.3n/achrV 19,737,520contains similarity to Bacillus subtilis Nuclease sbcCD subunit C.; SW:SBCC_BACSU
23ZK822.2ZK822.2n/achrIV 11,922,736contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
24F23C8.3F23C8.3n/achrI 2,440,875
25C04E6.3C04E6.3n/achrV 5,920,241
26F47B10.4F47B10.4n/achrX 10,891,428contains similarity to Cyanophage P60 Thioredoxin C3.; TR:Q8W710
27C18A11.2C18A11.2n/achrX 8,067,797
28T21B6.4T21B6.4n/achrX 10,934,829contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
29fbxb-6F07E5.1n/achrII 2,066,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
30W04B5.6W04B5.6n/achrIII 2,434,376
31Y53C12B.2Y53C12B.2n/achrII 9,740,855contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
32cfi-1T23D8.8n/achrI 9,997,318cfi-1 encodes a DNA-binding protein containing an AT-rich interaction domain (ARID) that affects differentiation of the URA sensory neurons, AVD, and PVC interneurons; acts downstream of UNC-86 and LIN-32 in controlling URA and IL2 cell fate, and is expressed in some neurons and muscle cells.
33F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
34T21E12.3T21E12.3n/achrI 4,403,989contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
35K04F10.2K04F10.2n/achrI 6,362,454contains similarity to Interpro domain IPR008979 (Galactose-binding like)
36F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
37T03F1.7T03F1.7n/achrI 3,856,739contains similarity to Pfam domain PF00398 Ribosomal RNA adenine dimethylase contains similarity to Interpro domains IPR001737 (Ribosomal RNA adenine methylase transferase), IPR016861 (Mitochondrial dimethyladenosine transferase 2, mitochondrial precursor)
38T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675
39clec-101F15D3.2n/achrI 11,562,502C. elegans CLEC-101 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
40fbxa-163C08E3.6n/achrII 1,610,019This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
41clec-31F49A5.2n/achrV 16,857,086C. elegans CLEC-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
42W04D2.5W04D2.5n/achrV 12,493,975contains similarity to Pfam domain PF00411 Ribosomal protein S11 contains similarity to Interpro domain IPR001971 (Ribosomal protein S11)
43F37E3.2F37E3.2n/achrI 6,427,369contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
44sri-14M01G12.1n/achrI 12,135,356C. elegans SRI-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45fbxb-99Y8A9A.5n/achrII 3,792,968This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
46srg-26C10G8.1n/achrV 5,332,145C. elegans SRG-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
47F01G10.7F01G10.7n/achrIV 10,240,539contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
48T27F6.8T27F6.8n/achrI 12,498,624This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
49T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
50exc-9F20D12.5n/achrIV 7,940,302exc-9 encodes a LIM domain-containing protein; exc-9 activity is required for proper development and morphogenesis of the excretory cell canal.