UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srw-124C44C3.10chrV 2,977,215C. elegans SRW-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
2srh-60W10G11.9n/achrII 3,585,242C. elegans SRH-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3srt-59C18H7.8n/achrIV 601,062C. elegans SRT-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR006058 (2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
4F47B7.5F47B7.5n/achrX 3,768,291contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
5jkk-1F35C8.3n/achrX 5,370,204jkk-1 encodes a member of the MAP kinase kinase superfamily that affects synaptic vesicle localization and is required in type-D motor neurons for normal locomotion; can function in the Hog1 MAP kinase pathway I in yeast as an activator of JNK and is expressed in most neurons
6F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
7str-38T23D5.2n/achrV 15,731,518C. elegans STR-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8R05G6.5R05G6.5n/achrIV 7,509,013contains similarity to Pfam domain PF05186 Dpy-30 motif contains similarity to Interpro domains IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core), IPR007858 (Dpy-30)
9R08C7.1R08C7.1n/achrIV 4,451,940
10old-1C08H9.5n/achrII 9,867,626old-1 encodes a receptor protein tyrosine kinase; old-1 activity is required for stress resistance and regulation of adult lifespan: old-1 mRNA expression is upregulated in response to stress and in daf-2 and age-1 mutant backgrounds; likewise, overexpression of old-1 in wild-type animals extends lifespan and increases resistance to heat and UV irradiation; an OLD-1::GFP fusion protein is expressed in the anterior region of worms, in neuronal, hypodermal, and pharyngeal tissues, as well as in the proximal region of the male gonad; expression is visible in young adults and appears to increase as animals age and in response to heat, starvation, or UV irradiation.
11Y57A10B.6Y57A10B.6n/achrII 12,391,276contains similarity to Pfam domain PF07149 Pes-10 contains similarity to Interpro domain IPR009819 (Pes-10)
12gcy-23T26C12.4n/achrIV 3,286,107gcy-23 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-18, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-23 functions redundantly with gcy-8 and gcy-18, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, loss of gcy-23 activity via RNAi results in lifespan extension; GCY-23 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
13str-196T01G6.3n/achrV 492,687C. elegans STR-196 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
14B0207.2B0207.2n/achrI 5,955,959
15clec-20T07H3.5n/achrII 1,594,363C. elegans CLEC-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
16F22D6.8F22D6.8n/achrI 7,099,204
17C08H9.11C08H9.11n/achrII 9,858,792contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
18F26A1.7F26A1.7n/achrIII 4,819,598
19C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
20nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
21unc-3Y16B4A.1n/achrX 14,778,472The unc-3 gene encodes a protein with homology to immunoglobulin (Ig) domain-containing transcription factors such as OLF-1 or SU(H).
22F46B3.2F46B3.2n/achrV 20,594,388contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
23F56C3.7F56C3.7n/achrX 1,370,660
24col-9F54B11.1n/achrX 13,590,542col-9 encodes a collagen protein.
25F10A3.11F10A3.11n/achrV 16,163,213contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
26srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27nas-16K03B8.1n/achrV 11,392,697nas-16 encodes an astacin-like metalloprotease.
28clec-198C49C3.13n/achrIV 17,349,079C. elegans CLEC-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29F14H8.4F14H8.4n/achrV 15,024,402contains similarity to Clostridium acetobutylicum Protein containing a domain related to multimeric flavodoxin WrbAsfamily.; TR:Q97H25
30F55D12.1F55D12.1n/achrI 7,884,957contains similarity to Brachydanio rerio Hypothetical protein.; TR:Q803L4
31Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
32tbx-9T07C4.6n/achrIII 10,340,812C. elegans TBX-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
33hot-7Y48B6A.9n/achrII 14,212,173hot-7 encodes a predicted membrane-associated protein that is a member of the Ly-6 superfamily of glycosylphosphatidylinositol (GPI)-linked signaling proteins and is homologous to ODR-2, a neuronally expressed protein required for olfaction; as loss of hot-7 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of HOT-7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
34F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
35nhr-268K06B4.6n/achrV 15,690,903C. elegans NHR-268 protein
36Y48E1B.11Y48E1B.11n/achrII 13,596,085
37fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
38hlh-27C17C3.10n/achrII 5,540,531C. elegans HLH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
39str-257C01B4.1n/achrV 2,519,650C. elegans STR-257 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40C55A1.9C55A1.9n/achrV 15,626,819contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
41F41E6.8F41E6.8n/achrV 8,600,475contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
42srw-4F37B4.83e-24chrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
43F49D11.2F49D11.2n/achrI 10,922,443contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
44C35A11.3C35A11.3n/achrV 5,374,943contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MUC5AC (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000371671
45C06B3.7C06B3.7n/achrV 13,910,615contains similarity to Streptococcus agalactiae Tn5252, relaxase.; TR:Q8DZ67
46C44H4.6C44H4.6n/achrX 14,597,741contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
47F53G12.11F53G12.11n/achrI 145,479contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
48Y44A6B.3Y44A6B.3n/achrV 20,633,182contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
49F38B6.7F38B6.7n/achrX 6,697,033contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
50C17D12.3C17D12.3n/achrI 11,618,529contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)