UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C43E11.11C43E11.110chrI 4,251,319contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Conserved oligomeric Golgi complex component 5; ENSEMBL:ENSP00000334703
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3R02F11.4R02F11.4n/achrV 4,814,781contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR008378 (Ubiquitous surface protein), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR009053 (Prefoldin)
4trxr-1C06G3.7n/achrIV 7,014,256C06G3.7 encodes an homolog of the mammalian thioredoxin reductase isozymes TR1 and TR2; like its mammalian homologs, C06G3.7 has a TGA-encoded C-terminal penultimate selenocysteine (Sec) residue; labelling of C. elegans with selenium-75 demonstrates that TR-Se is the major naturally occurring selenoprotein in C. elegans, and computational analysis indicates that it is probably the only selenoprotein encoded by the genome; the 3'-untranslated region of this gene contains a selenocysteine insertion sequence that is functional in mammalian cell culture; by phylogenetic profiling, C06G3.7 protein is predicted to be mitochondrial.
5F55F8.9F55F8.9n/achrI 5,671,663contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
6ing-3Y51H1A.4n/achrII 13,879,211Y51H1A.4 is orthologous to the human gene P33ING1B (ING1; OMIM:601566), which when mutated leads to disease.
7T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
8clec-128W10G11.6n/achrII 3,570,162C. elegans CLEC-128 protein; contains similarity to Interpro domains IPR003566 (T-cell surface glycoprotein CD5), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
9F48C1.4F48C1.4n/achrI 5,313,536
10Y4C6B.5Y4C6B.5n/achrIV 5,322,131contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
11sru-42C55A1.8n/achrV 15,651,414C. elegans SRU-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR002208 (SecY protein), IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
12acr-8ZC504.2n/achrX 10,414,628acr-8 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR); ACR-8 falls into the 'ACR-8' class of nAChR subunits, which includes ACR-12 and ACR-13.
13C46F11.4C46F11.4n/achrIII 3,661,086contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014014 (RNA helicase, DEAD-box type, Q motif), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
14mtm-5H28G03.6n/achrX 5,239,010C. elegans MTM-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF06602 (Myotubularin-related) , PF02893 (GRAM domain) , PF02141 (DENN (AEX-3) domain) , PF03456 (uDENN domain) , PF03455 (dDENN domain) contains similarity to Interpro domains IPR005112 (dDENN), IPR010569 (Myotubularin-related), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR005113 (uDENN), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding), IPR001194 (DENN), IPR004182 (GRAM)
15F54E7.6F54E7.6n/achrIII 5,660,439
16sru-38R07B5.4n/achrV 9,835,226C. elegans SRU-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
17str-28F25E5.12n/achrV 7,472,264C. elegans STR-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18Y54E2A.6Y54E2A.6n/achrII 14,768,030contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) (2), PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) (2), PF02889 (Sec63 Brl domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR004179 (Sec63), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
19his-55F54E12.1n/achrIV 11,338,029his-55 encodes an H3 histone; by homology, HIS-55 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-55 is a replication-dependent histone locus that resides in a histone gene-rich region on chromosome IV.
20C27B7.7C27B7.7n/achrIV 8,911,257contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) (6)contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR003962 (Fibronectin, type III subdomain), IPR013151 (Immunoglobulin)
21AH9.3AH9.3n/achrX 2,259,841contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
22srd-40F17A2.12n/achrX 12,324,508C. elegans SRD-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23ced-6F56D2.7n/achrIII 5,596,872ced-6 encodes an Src homology (SH) 3 and phosphotyrosine-binding (PTB) domain-containing adaptor protein, orthologous to human CED-6/GULP, that is required for cell corpse engulfment during apoptosis; CED-6 is bound by the phosphotyrosine binding motif in the cytoplasmic tail of the transmembrane protein CED-1, and and within phagocytic cells this interaction may be part of a signal transduction pathway that promotes apoptotic cell engulfment.
24F41C3.4F41C3.4n/achrII 4,740,995contains similarity to Pfam domain PF04178 Got1-like family contains similarity to Interpro domain IPR007305 (Got1-like protein)
25F38B2.3F38B2.3n/achrX 11,283,730contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
26F53H2.3F53H2.3n/achrV 20,399,182contains similarity to Interpro domain IPR006034 (Asparaginase/glutaminase)
27W09D6.5W09D6.5n/achrIII 11,089,923contains similarity to Saccharomyces cerevisiae cell wall integrity and stress response component 1; SGD:YOR008C
28F53F8.1F53F8.1n/achrV 20,682,534The F53F8.1 gene encodes a homolog of human WT1, which when mutated leads to Wilms tumour (OMIM:194070).
29F46C8.1F46C8.1n/achrX 7,550,722
30ceh-2C27A12.5n/achrI 6,048,670ceh-2 encodes a homeodomain protein homologous to Drosophila empty spiracles (EMS) and the vertebrate EMX1 and EMX2 proteins (OMIM:600034, 600035); although the exact biological role of CEH-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, expression in pharyngeal neurons and muscle, as well as vulval cells (vulB1, vulB2, and vulC) at late stages of development suggests that CEH-2 may play a role in terminal differentiation events in diverse cell types.
31H10E21.2H10E21.2n/achrIII 10,398contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32F56A6.4F56A6.4n/achrI 622,086
33C17H11.5C17H11.5n/achrX 8,183,262
34T05C1.5T05C1.5n/achrII 4,490,625contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
35M03F4.4M03F4.4n/achrX 4,957,667
36T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
37nhr-78F36A4.14n/achrIV 4,276,441C. elegans NHR-78 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38R01H10.4R01H10.4n/achrIII 10,255,933contains similarity to Sus scrofa Outer dense fiber protein.; SW:ODFP_PIG
39nhr-271T03E6.3n/achrV 16,579,462C. elegans NHR-271 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
40R04A9.5R04A9.5n/achrX 386,590
41srgp-1F12F6.5n/achrIV 11,574,575C. elegans SRGP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00620 (RhoGAP domain) , PF00611 (Fes/CIP4 homology domain) contains similarity to Interpro domains IPR001060 (Cdc15/Fes/CIP4), IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
42str-166T08B6.6n/achrIV 4,885,569C. elegans STR-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43W03F11.5W03F11.5n/achrI 2,217,759n/a
44srd-46F17A2.10n/achrX 12,332,621C. elegans SRD-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45K04D7.4K04D7.4n/achrIV 10,189,101contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) (3), PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR003962 (Fibronectin, type III subdomain), IPR013151 (Immunoglobulin)
46srsx-8F52F10.5n/achrV 1,552,074C. elegans SRSX-8 protein ;
47F58G1.6F58G1.6n/achrII 12,941,277contains similarity to Pfam domain PF02752 Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal)
48F55C5.1F55C5.1n/achrV 12,263,644contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
49C06C3.3C06C3.3n/achrII 9,370,697contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
50B0261.7B0261.7n/achrI 5,270,246