UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1C42D4.2C42D4.20chrIV 7,181,781contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F47G9.3F47G9.3n/achrV 11,315,117contains similarity to Pfam domains PF00100 (Zona pellucida-like domain) , PF00024 (PAN domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
4his-43F08G2.2n/achrII 13,827,426his-43 encodes an H2A histone.
5K09H11.1K09H11.1n/achrV 5,749,898contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF01636 (Phosphotransferase enzyme family) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) contains similarity to Interpro domains IPR011945 (Predicted HAD-superfamily phosphatase, subfamily IA/Epoxide hydrolase, N-terminal), IPR005833 (Haloacid dehydrogenase/epoxide hydrolase), IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR006402 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR002575 (Aminoglycoside phosphotransferase)
6gpdh-1F47G4.3n/achrI 14,077,014gpdh-1 encodes one of two C. elegans glycerol 3-phosphate dehydrogenases; although loss of gpdh-1 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious defects, gpdh-1 mRNA expression is upregulated in response to hypertonicity, suggesting that GPDH-1 does play a role in osmotic stress adaptation in C. elegans.
7his-57F54E12.5n/achrIV 11,340,574his-57 encodes an H2A histone.
8his-61F55G1.10n/achrIV 7,485,966his-61 encodes an H2A histone.
9T17H7.7T17H7.7n/achrIII 756,721
10C46H3.1C46H3.1n/achrX 1,210,043
11col-113C34D4.15n/achrIV 7,151,565C. elegans COL-113 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR009143 (Wnt-6 protein), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
12F56A12.2F56A12.2n/achrV 14,377,560contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13his-33F17E9.13n/achrIV 8,335,508his-33 encodes an H2A histone; by homology, HIS-33 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-33 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS5 cluster on chromosome IV.
14ZK899.3ZK899.3n/achrX 9,454,242contains similarity to Homo sapiens C10ORF6; ENSEMBL:ENSP00000238961
15T15D6.11T15D6.11n/achrI 12,397,457contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
16F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
17T06D8.10T06D8.10n/achrII 11,244,135contains similarity to Pfam domain PF03098 Animal haem peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR001007 (von Willebrand factor, type C)
18T07G12.3T07G12.3n/achrIV 10,535,145contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
19F45H10.2F45H10.2n/achrII 13,492,421contains similarity to Pfam domain PF02939 UcrQ family contains similarity to Interpro domain IPR004205 (UcrQ)
20R07B7.10R07B7.10n/achrV 12,085,340contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
21M195.2M195.2n/achrII 8,362,076contains similarity to Pfam domain PF02363 Cysteine rich repeat
22sri-17F15H9.3n/achrI 12,145,482C. elegans SRI-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23C09F9.2C09F9.2n/achrII 14,708,961contains similarity to Pfam domains PF01390 (SEA domain) , PF01826 (Trypsin Inhibitor like cysteine rich domain) (3), PF07974 (EGF-like domain) , PF03351 (DOMON domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR005018 (DOMON related), IPR002919 (Protease inhibitor I8, cysteine-rich trypsin inhibitor-like), IPR000082 (SEA), IPR008960 (Carbohydrate-binding family 9/cellobiose dehydrogenase, cytochrome), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013050 (DOMON)
24T20H9.6T20H9.6n/achrIII 2,247,987contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
25R10E4.9R10E4.9n/achrIII 4,302,001contains similarity to Pfam domain PF04387 Protein tyrosine phosphatase-like protein, PTPLA contains similarity to Interpro domain IPR007482 (Protein-tyrosine phosphatase-like, PTPLA)
26F13H10.5F13H10.5n/achrIV 10,992,558contains similarity to Pfam domain PF01663 Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR002591 (Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase/phosphate transferase), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
27C08F11.7C08F11.7n/achrIV 13,637,874contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domains IPR006570 (SPK), IPR002398 (Peptidase C14, caspase precursor p45)
28C42C1.6C42C1.6n/achrIV 12,294,581contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG16970-PA; FLYBASE:CG16970-PA
29T07C4.10T07C4.10n/achrIII 10,323,248contains similarity to Interpro domains IPR002957 (Keratin, type I), IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin)
30K09H11.7K09H11.7n/achrV 5,752,981contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA), IPR006349 (2-phosphoglycolate phosphatase, eukaryotic), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
31R07E3.2R07E3.2n/achrX 10,336,549contains similarity to Homo sapiens MYST histone acetyltransferase 3; ENSEMBL:ENSP00000265713
32K07E3.2K07E3.2n/achrX 8,105,875
33K09F6.8K09F6.8n/achrII 2,295,399
34T21C9.9T21C9.9n/achrV 10,591,537contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
35srxa-2F56D5.10n/achrIV 9,423,882C. elegans SRXA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
36C33G3.4C33G3.4n/achrX 14,073,660C33G3.4 is orthologous to the human gene BETA-MANNOSIDASE (MANBA; OMIM:248510), which when mutated leads to disease.
37H06O01.2H06O01.2n/achrI 7,012,174H06O01.2 encodes a large (1,461-aa) putative chromodomain helicase DNA-binding protein that inhibits DHC-1 in vivo; H06O01.2 is orthologous to budding yeast CHD1, human CHD1 (OMIM:602118), and human CHD2 (OMIM:602119); H06O01.2(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that H06O01.2 negatively regulates dynein; H06O01.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
38C18B10.6C18B10.6n/achrV 7,480,150contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
39C49A9.3C49A9.3n/achrIV 6,223,512contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domains IPR000711 (ATPase, F1 complex, OSCP/delta subunit), IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
40T19B10.3T19B10.3n/achrV 11,224,368The T19B10.3 gene encodes an ortholog of the human gene GALACTOSIDASE, BETA 1 (GLB1), which when mutated leads to gangliosidosis type I (OMIM:230500).
41F22G12.4F22G12.4n/achrI 13,157,287contains similarity to Pfam domains PF01363 (FYVE zinc finger) , PF00023 (Ankyrin repeat) (17)contains similarity to Interpro domains IPR000306 (Zinc finger, FYVE-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002110 (Ankyrin), IPR017455 (Zinc finger, FYVE-related), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
42C15H9.3C15H9.3n/achrX 6,116,887contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43C25F6.1C25F6.1n/achrX 5,487,263
44K01D12.5K01D12.5n/achrV 12,398,255contains similarity to Interpro domain IPR003980 (Histamine H3 receptor)
45T23F6.1T23F6.1n/achrIV 12,720,397contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
46drr-1F45H10.4n/achrII 13,495,384C. elegans DRR-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR008253 (Marvel)
47T06E4.8T06E4.8n/achrV 9,622,529contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
48T20G5.10T20G5.10n/achrIII 10,211,438contains similarity to Pfam domain PF06320 GCN5-like protein 1 (GCN5L1) contains similarity to Interpro domain IPR009395 (GCN5-like 1)
49tre-1F57B10.7n/achrI 6,556,662C. elegans TRE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01204 Trehalase contains similarity to Interpro domains IPR001661 (Glycoside hydrolase, family 37), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
50his-48B0035.8n/achrIV 11,324,941his-48 encodes an H2B histone; by homology, HIS-48 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-48 is a replication-dependent histone locus that resides in a histone gene-rich region on chromosome IV.