UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1C38C6.5C38C6.50chrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
2C07G1.6C07G1.6n/achrIV 8,209,489
3rnh-1.1ZK1290.6n/achrII 7,526,915C. elegans RNH-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00075 RNase H contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
4C34D4.3C34D4.3n/achrIV 7,153,905contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
5F59B2.5F59B2.5n/achrIII 9,001,107contains similarity to Pfam domain PF01399 PCI domain contains similarity to Interpro domains IPR013143 (PCI/PINT associated module), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR000717 (Proteasome component region PCI)
6C28A5.6C28A5.6n/achrIII 4,426,610contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
7R155.3R155.3n/achrIII 1,973,361contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
8F59A3.7F59A3.7n/achrI 5,517,931
9F53G12.8F53G12.8n/achrI 114,244contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
10F22D6.9F22D6.9n/achrI 7,100,795contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
11F42G8.9F42G8.9n/achrIV 8,117,087
12F26H9.8F26H9.8n/achrI 9,322,465contains similarity to Pfam domains PF01501 (Glycosyl transferase family 8) , PF06427 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR009448 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase), IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
13C37A2.3C37A2.3n/achrI 6,785,976contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
14F58F12.3F58F12.3n/achrII 6,390,234
15ZK262.4ZK262.4n/achrV 18,424,010contains similarity to Arabidopsis thaliana Similarity to salt-inducible protein.; TR:Q9LVA2
16Y39A1A.18Y39A1A.18n/achrIII 10,692,438contains similarity to Methanosarcina mazei Transcriptional regulator, MerR family.; TR:Q8PSB2
17C17G10.3C17G10.3n/achrII 5,583,865
18C55C3.3C55C3.3n/achrIV 5,686,761contains similarity to Trypanosoma cruzi Trans-sialidase, putative.; TR:Q4E0H9
19F26A3.5F26A3.5n/achrI 7,669,167contains similarity to Clostridium tetani Conserved protein.; TR:Q890T1
20ttr-12F46B3.4n/achrV 20,603,550C. elegans TTR-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
21K07A1.4K07A1.4n/achrI 9,589,308contains similarity to Mycobacterium tuberculosis TcrZ protein (Fragment).; TR:Q50810
22acl-13F08G5.2n/achrIV 12,411,312C. elegans ACL-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01553 Acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
23F57G4.9F57G4.9n/achrV 17,644,291contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
24C50C3.2C50C3.2n/achrIII 8,185,577contains similarity to Pfam domains PF00435 (Spectrin repeat) (4), PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR002017 (Spectrin repeat), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
25ent-3K02E11.1n/achrV 14,234,164C. elegans ENT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domain IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
26F59C6.3F59C6.3n/achrI 10,524,961contains similarity to Rhizobium meliloti Hypothetical membrane protein SMb20625.; TR:Q92TI1
27F28E10.4F28E10.4n/achrIV 4,566,721contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
28W04A4.2W04A4.2n/achrI 13,683,368contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ90033; TR:Q8N2R3
29ZK1053.2ZK1053.2n/achrI 13,233,396contains similarity to Saccharomyces cerevisiae anchorage subunit of a-agglutinin; SGD:YNR044W
30Y65A5A.2Y65A5A.2n/achrIV 16,413,511contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for invasion and pseudohyphae formation in response to nitrogen starvation; SGD:YIR019C
31srg-56C24B9.10n/achrV 2,736,901C. elegans SRG-56 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
32F59A7.9F59A7.9n/achrV 2,005,893contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domains IPR005856 (Cysteine synthase K/M), IPR001216 (Cysteine synthase/cystathionine beta-synthase P-phosphate-binding site), IPR005859 (Cysteine synthase A), IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit), IPR016040 (NAD(P)-binding)
33W06D4.3W06D4.3n/achrI 9,059,663contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
34H05L14.1H05L14.1n/achrI 7,974,757contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
35F49F1.8F49F1.8n/achrIV 4,132,560contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR013084 (Zinc finger, CCHC retroviral-type), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
36F47B7.4F47B7.4n/achrX 3,765,997contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
37ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
38C34C12.4C34C12.4n/achrIII 3,468,832contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C4orf34; ENSEMBL:ENSP00000295958
39rmd-5T23B3.3n/achrI 6,711,598C. elegans RMD-5 protein ; contains similarity to Xenopus laevis Protein FAM82C.; SW:Q5EAU9
40Y106G6D.4Y106G6D.4n/achrI 10,115,663contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
41C56A3.3C56A3.3n/achrV 13,533,300C56A3.3 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C56A3.3 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
42R02D5.3R02D5.3n/achrV 14,483,717contains similarity to Arabidopsis thaliana Putative RNA-binding protein.; TR:Q9SHZ5
43F26D2.10F26D2.10n/achrV 16,427,124contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
44D2062.6D2062.6n/achrII 2,619,582contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
45srab-22T20D4.2n/achrV 3,427,052C. elegans SRAB-22 protein ;
46C36H8.1C36H8.1n/achrIV 12,743,886contains similarity to Pfam domains PF03134 (TB2/DP1, HVA22 family) , PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein), IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
47ugtp-1ZK370.7n/achrIII 8,747,369C. elegans UGTP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF03151 (Triose-phosphate Transporter family) , PF04142 (Nucleotide-sugar transporter) contains similarity to Interpro domains IPR004853 (Protein of unknown function DUF250), IPR004689 (UDP-galactose transporter), IPR007271 (Nucleotide-sugar transporter)
48F41H10.2F41H10.2n/achrIV 5,381,978
49C28C12.1C28C12.1n/achrIV 8,502,192contains similarity to Interpro domain IPR002217 (Lipoprotein LPP20)
50W01B6.4W01B6.4n/achrIV 10,075,527contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)