UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C37E2.3C37E2.37.999999999999999e-172chrX 14,180,268contains similarity to Pfam domain PF04750 FAR-17a/AIG1-like protein contains similarity to Interpro domains IPR006838 (FAR-17a/AIG1-like protein), IPR002208 (SecY protein)
2R11G11.3R11G11.3n/achrV 531,412contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
3B0041.3B0041.3n/achrI 4,645,153contains similarity to Pfam domain PF01476 LysM domain contains similarity to Interpro domain IPR002482 (Peptidoglycan-binding LysM)
4F13B12.3F13B12.3n/achrIV 10,441,433contains similarity to Tetraodon nigroviridis Chromosome 12 SCAF8721, whole genome shotgun sequence. (Fragment).; TR:Q4T6K3
5tbx-31C36C9.2n/achrX 1,672,652tbx-31 encodes a diverged member of the T-box transcription factor family; by homology, TBX-31 is predicted to function as a transcriptional regulator during development, but as loss of tbx-31 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of TBX-31 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
6srg-5T12A2.11n/achrIII 6,263,078C. elegans SRG-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
7trxr-2ZK637.10n/achrIII 8,915,015C. elegans TRXR-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02852 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain) , PF07992 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF00070 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR012999 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I, active site), IPR004099 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation), IPR006338 (Thioredoxin and glutathione reductase selenoprotein), IPR016156 (FAD/NAD-linked reductase, dimerisation), IPR001327 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region), IPR000815 (Mercuric reductase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
8C03A3.3C03A3.3n/achrX 11,268,134contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
9ZC53.4ZC53.4n/achrX 1,931,714contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227Y0
10fut-2EGAP9.2n/achrV 6,574,873fut-2 encodes a unique alpha 1,2-fucosyltransferase specifically expressed in intestinal cells of larval and adult animals; recombinant FUT-2 expressed in human 293T cells exhibits a novel acceptor specificity profile compared with mammalian alpha 1,2-fucosyltransferases and the predicted protein shares very low amino acid identity with human alpha 1,2-fucosyltransferases, but its predicted type 2 topology and domain structure are typical of other glucosyltransferases.
11str-225C07G3.6n/achrV 3,508,534C. elegans STR-225 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001307 (Thiosulphate sulphurtransferase, conserved site)
12W02B8.1W02B8.1n/achrII 13,900,226
13Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
14B0302.4B0302.4n/achrX 17,176,549
15C07A9.12C07A9.12n/achrIII 9,726,313contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
16gcy-4ZK970.5n/achrII 10,306,418gcy-4 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; by homology, GCY-4 may function as a chemosensory receptor; however, as loss of gcy-4 activity via mutation or large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, the precise role of gcy-4 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; the sole gcy-4 ::GFP reporter construct reported to date did not produce any specific GFP signals.
17str-178R11D1.5n/achrV 12,715,427C. elegans STR-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18srm-1T28H11.2n/achrIV 5,013,566C. elegans SRM-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
19srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20apc-11F35G12.9n/achrIII 4,594,070apc-11 encodes a predicted key catalytic subunit of the anaphase promoting complex that is required for embryonic development past the embryonic one- cell stage.
21smf-2K11G12.3n/achrX 6,717,366C. elegans SMF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01566 Natural resistance-associated macrophage protein contains similarity to Interpro domain IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein)
22R06B9.4R06B9.4n/achrII 13,754,197contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
23hlh-8C02B8.4n/achrX 8,118,315The hlh-8 gene encodes a helix-loop-helix protein required for normal muscle development, and hence for normal defecation and egg-laying.
24ceh-1F16H11.4n/achrX 4,653,768ceh-1 encodes a protein that contains a homeobox domain.
25Y39A1A.7Y39A1A.7n/achrIII 10,619,501contains similarity to Sus scrofa Lymphocyte antigen 64-like protein.; TR:Q7YRL4
26C24A3.1C24A3.1n/achrX 9,003,584contains similarity to Aedes aegypti Condensin, SMC5-subunit, putative (Fragment).; TR:Q16IF0
27tsg-101C09G12.9n/achrIV 3,512,510C09G12.9 encodes the C. elegans ortholog of S. cerevisiae vacuolar protein sorting protein Vps23p and human TUMOR SUSCEPTIBILITY GENE 101 (TSG101; OMIM:601387), mutations in which are associated with several types of cancer and with varying responses to HIV infection; the product of C09G12.9 is predicted to be a component of C. elegans ESCRT-1 (Endosomal Sorting Complex Required for Transport), and RNAi experiments indicate that its activity is essential for embryonic and larval development.
28fbxb-59Y113G7B.8n/achrV 20,200,762This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
29Y75B8A.14Y75B8A.14n/achrIII 12,217,589contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
30his-45B0035.10n/achrIV 11,326,794his-45 encodes an H3 histone.
31srd-56E04F6.14n/achrII 7,202,553C. elegans SRD-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32gpa-13F18E2.5n/achrV 12,753,806gpa-13 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADF, ASH, AWC, PHA, and PHB.
33math-2C08F1.1n/achrII 1,799,617C. elegans MATH-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
34C11H1.2C11H1.2n/achrX 14,306,277contains similarity to Interpro domain IPR015672 (G-protein coupled receptor 89-related)
35sra-8AH6.12n/achrII 9,538,328C. elegans SRA-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
36F59D12.1F59D12.1n/achrX 15,669,484contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37F38B6.6F38B6.6n/achrX 6,687,229contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (4), PF08409 (Domain of unknown function (DUF1736)) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (5)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013618 (Region of unknown function DUF1736), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
38nlp-13E03D2.1n/achrV 4,237,211nlp-13 encodes a predicted neuropeptide of the MSFamide family; expressed primarily in neurons or in the endocrine/secretory cells, and expression includes pharyngeal neurons that modulate pharyngeal pumping of food.
39srsx-1F40D4.5n/achrV 17,177,360C. elegans SRSX-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
40K07D4.4K07D4.4n/achrII 4,032,008
41fbxa-112Y102A5C.13n/achrV 16,947,523C. elegans FBXA-112 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
42K02D3.2K02D3.2n/achrX 13,710,264contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
43R57.2R57.2n/achrX 298,212contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
44F22F1.3F22F1.3n/achrX 8,162,399contains similarity to Pfam domain PF02172 KIX domain contains similarity to Interpro domain IPR003101 (Coactivator CBP, KIX)
45srx-63K07C6.6n/achrV 3,932,495C. elegans SRX-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
46srj-45T03D3.6n/achrV 2,836,005C. elegans SRJ-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
47C33D12.2C33D12.2n/achrX 3,043,877C33D12.2 encodes a predicted transmembrane protein orthologous to human ACDP1-ACDP4 and S. cerevisiae MAM3, and paralogous to C01H6.6, C52D10.12, M02F4.3, R04E5.2, and R13G10.4; by orthology with MAM3, C33D12.2 may participate in metal homoeostasis; C33D12.2 is expressed in intestine, body wall muscle, nervous system (including ventral and dorsal nerve cords and head neurons), and adult vulval muscle and reproductive system; C33D12.2, MAM3, and ACDP1-ACDP4 belong to a family of proteins (sharing an ACD domain) from bacteria, yeast, plants, and metazoa; murine Acdp1 is a plasma membrane protein; bacterial proteins containing the ACD domain include CorC from Salmonella typhimurium, which is involved in magnesium and cobalt efflux; C33D12.2 has no obvious function in RNAi assays.
48C32B5.5C32B5.5n/achrII 974,906contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain
49F29D10.2F29D10.2n/achrI 8,842,038contains similarity to Interpro domains IPR000853 (Nematoda metallothionein, family 6), IPR000006 (Metallothionein, vertebrate), IPR002952 (Eggshell protein), IPR004035 (Endonuclease III, iron-sulphur binding, conserved site-1), IPR001396 (Echinodermata metallothionein, family 4), IPR001008 (Mollusc metallothionein, family 2)
50Y116A8C.15Y116A8C.15n/achrIV 16,996,337contains similarity to Homo sapiens similar to KIAA1357 protein; ENSEMBL:ENSP00000258005