UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fipr-22C37A5.27e-84chrI 14,155,893C. elegans FIPR-22 protein ; contains similarity to Homo sapiens Keratin-associated protein 20-2; ENSEMBL:ENSP00000330746
2F57H12.4F57H12.4n/achrIV 7,971,993contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001920 (Asp/Glu racemase), IPR009126 (Cholecystokinin receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
3B0228.8B0228.8n/achrII 7,760,555
4T21C9.11T21C9.11n/achrV 10,594,469contains similarity to Homo sapiens Popeye domain containing protein 3; ENSEMBL:ENSP00000254765
5W03G1.2W03G1.2n/achrIV 525,588contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
6Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
7nas-24F20G2.4n/achrV 13,770,454nas-24 encodes an astacin-like metalloprotease.
8fipr-23C37A5.41e-80chrI 14,153,722C. elegans FIPR-23 protein ; contains similarity to Homo sapiens Keratin-associated protein 20-2; ENSEMBL:ENSP00000330746
9R02F2.6R02F2.6n/achrIII 5,478,761
10W04A4.3W04A4.3n/achrI 13,680,877contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
11W02B3.5W02B3.5n/achrIII 686,655contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
12ZK353.4ZK353.4n/achrIII 8,388,992contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Uncharacterized serine/threonine-rich protein PB15E9.01c precursor.; SW:Q8TFG9
13F17E9.3F17E9.3n/achrIV 8,355,135
14far-4F15B9.2n/achrV 12,999,023far-4 encodes a fatty acid and retinol-binding protein, paralogous to FAR-3 and FAR-5 and distantly homologous to FAR proteins of parasitic nematodes; FAR-4 binds lipids in vitro; far-4 is transcribed at highest levels in the fourth larval stage, and is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi assays.
15numr-1F08F8.5n/achrIII 7,362,966C. elegans NUMR-1 protein ;
16aqp-3Y69E1A.7n/achrIV 10,962,555aqp-3 encodes an aquaglyceroporin whose expression in Xenopus oocytes increases water or glycerol permeability five- to seven-fold; loss of AQP-3 activity via mutation or RNAi results in no obvious defects; however, AQP-3, in conjunction with AQP-2, AQP-4, and AQP-8, is weakly required for recovery from hypotonic stress; AQP-3 is expressed in the intestine, excretory cell, seminal vesicle, and vas deferens.
17F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
18K03F8.1K03F8.1n/achrIII 6,511,465contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
19clec-124C17F4.1n/achrII 3,250,580C. elegans CLEC-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
20nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
21F14D7.8F14D7.8n/achrV 14,312,353contains similarity to Staphylococcus epidermidis Conserved hypothetical protein.; TR:Q8CSE5
22tag-329C50F4.3n/achrV 9,535,638C. elegans TAG-329 protein; contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
23zig-5Y48A6A.1n/achrIII 10,952,247zig-5 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-5::gfp reporter fusion is expressed in a number of neurons, including PVT, VD1-13, RID, AFD, ASK, RIV, RIB, PVQ, DVA, and RIS; zig-5::gfp is detected in the PVT neuron beginning at the three-fold stage of embryogenesis and continuing throughout larval development; loss of zig-5 activity in large-scale RNAi screens has been reported to result in low levels of embryonic lethality.
24F07G11.7F07G11.7n/achrV 7,303,485contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
25F41D3.8F41D3.8n/achrI 12,267,803contains similarity to Pfam domain PF01697 (Domain of unknown function)
26ZC196.3ZC196.3n/achrV 8,737,532contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
27F02C9.1F02C9.1n/achrV 3,138,918
28F27C1.10F27C1.10n/achrI 5,435,347
29F46B3.14F46B3.14n/achrV 20,626,135contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
30F41D3.7F41D3.7n/achrI 12,267,272contains similarity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus ORF 5 (Fragment).; TR:O71053
31F39G3.4F39G3.4n/achrV 4,725,680contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
32K12B6.4K12B6.4n/achrV 6,280,741
33flp-5C03G5.7n/achrX 8,529,581flp-5 encodes a predicted FMRFamide-like peptide neurotransmitter that increases action potential frequency in the pharyngeal muscle when applied to the pharynx of dissected worms; expressed in the sensory neurons ASE and PVM.
34H09F14.1H09F14.1n/achrV 10,614,197contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35ZC328.5ZC328.5n/achrI 6,406,411
36F42C5.3F42C5.3n/achrIV 7,286,758contains similarity to Homo sapiens Intersectin 1 short form transcript variant 8; ENSEMBL:ENSP00000370685
37F53F10.1F53F10.1n/achrI 3,835,946contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 102A; ENSEMBL:ENSP00000258214
38F23D12.3F23D12.3n/achrX 14,442,916
39F40E3.5F40E3.5n/achrI 2,646,674contains similarity to Interpro domain IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
40E02A10.3E02A10.3n/achrV 12,586,524contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
41F19G12.1F19G12.1n/achrX 1,431,242contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
42F19F10.1F19F10.1n/achrV 7,563,460contains similarity to Pfam domain PF00178 Ets-domain contains similarity to Interpro domains IPR000418 (Ets), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding)
43F35C5.4F35C5.4n/achrII 12,891,236contains similarity to Homo sapiens Mucin-2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000351956
44hlh-13F48D6.3n/achrX 4,250,020C. elegans HLH-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding), IPR002418 (Transcription regulator Myc)
45ZK354.9ZK354.9n/achrIV 5,307,602contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
46cwp-2C37H5.11n/achrV 4,842,261cwp-2 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
47W03F11.4W03F11.4n/achrI 2,238,497contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
48srj-13R13D7.3n/achrV 7,403,263C. elegans SRJ-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49clec-158R13F6.8n/achrIII 6,859,120C. elegans CLEC-158 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
50F25H5.2F25H5.2n/achrI 9,180,480