UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C36C9.4C36C9.40chrX 1,694,554contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domains IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258), IPR011332 (Ribosomal protein, zinc-binding)
2F40E12.1F40E12.1n/achrII 3,617,996
3sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
4T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
5srh-132T27C5.5n/achrV 17,410,948C. elegans SRH-132 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6W03F9.9W03F9.9n/achrV 139,558contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
7F41H8.1F41H8.1n/achrV 834,574contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
8dgn-3F07G6.1n/achrX 1,730,834C. elegans DGN-3 protein ;
9C15A11.4C15A11.4n/achrI 7,399,849contains similarity to Interpro domains IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
10C13A2.9C13A2.9n/achrV 7,263,287contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
11srg-69F09E5.4n/achrII 5,356,499C. elegans SRG-69 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
12cids-1C02F5.4n/achrIII 8,245,008C. elegans CIDS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04818 Protein of unknown function, DUF618 contains similarity to Interpro domains IPR006569 (Regulation of nuclear pre-mRNA protein), IPR006903 (Protein of unknown function DUF618), IPR008942 (ENTH/VHS)
13gcy-17W03F11.2n/achrI 2,228,250gcy-17 encodes a predicted guanylate cyclase.
14clec-127W10G11.5n/achrII 3,568,702C. elegans CLEC-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
15ZK1320.7ZK1320.7n/achrII 9,672,350contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) , PF01585 (G-patch domain) contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR002110 (Ankyrin), IPR000467 (D111/G-patch)
16C46F4.1C46F4.1n/achrX 5,933,527contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17srw-132T05B4.5n/achrV 4,107,240C. elegans SRW-132 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
18T23H2.4T23H2.4n/achrI 6,455,456
19F10B5.2F10B5.2n/achrII 8,145,954contains similarity to Pfam domain PF05282 AAR2 protein contains similarity to Interpro domain IPR007946 (AAR2)
20srg-68ZC317.5n/achrV 5,464,597C. elegans SRG-68 protein ;
21age-1B0334.8n/achrII 11,523,196age-1 encodes the C. elegans ortholog of the phosphoinositide 3-kinase (PI3K) p110 catalytic subunit; AGE-1, supplied maternally and embryonically, is a central component of the C. elegans insulin-like signaling pathway, lying downstream of the DAF-2/insulin receptor and upstream of both the PDK-1 and AKT-1/AKT-2 kinases and the DAF-16 forkhead type transcription factor, whose negative regulation is the key output of the insulin signaling pathway; in accordance with its role in insulin signaling, AGE-1 activity is required for regulation of metabolism, life span, dauer formation, stress resistance, salt chemotaxis learning, fertility, and embryonic development; although the age-1 expression pattern has not yet been reported, ectopic expression studies indicate that pan-neuronal age-1 expression is sufficient to rescue life-span defects, while neuronal, intestinal, or muscle expression can partially rescue dauer formation, and neuronal or muscle expression can rescue metabolic defects.
22lam-3T22A3.8n/achrI 10,614,936lam-3 is orthologous to human LAMININ ALPHA-2 (LAMA2; OMIM:156225), which when mutated leads to merosin-deficient congenital muscular dystrophy.
23srh-52R08H2.7n/achrV 15,375,587C. elegans SRH-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24C13A2.5C13A2.5n/achrV 7,277,113contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
25str-231C06C6.3n/achrV 16,006,927C. elegans STR-231 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26B0563.8B0563.8n/achrX 9,174,023
27F40G12.4F40G12.4n/achrV 14,268,178contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
28H37N21.1H37N21.1n/achrI 7,143,753contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001397 (5-Hydroxytryptamine 5A receptor), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
29mes-6C09G4.5n/achrIV 8,512,584mes-6 encodes a WD repeat-containing protein that is orthologous to Drosophila Extra sex combs (Esc); as a member of a Polycomb-like chromatin repressive complex with MES-2 and MES-3, MES-6 is required maternally for normal germline development and during larval development, for anteroposterior patterning; during germline development, the MES-2/MES-3/MES-6 complex is believed to be essential for maintaining repression of the X chromosome, and in transgenic animals, the complex is necessary for germline repression of repetitive transgenes; in axial patterning, the MES-2/MES-3/MES-6 complex is required in somatic tissues for maintaining homeotic gene repression, acting upstream of the Hox genes lin-39, mab-5, and egl-5, as well as the egl-5 target gene lin-32; MES-6 expression is detected in the nuclei of all cells during early embryogenesis, in the germline precursors Z2 and Z3 and faintly in some somatic cells during late embryogenesis and the L1 larval stage, widely in later larvae, and in germline and oocyte nuclei in adults; normal MES-6 distribution is dependent upon wild-type activity of MES-2 and MES-3, and likewise, distribution of MES-3 is dependent upon wild-type activity of MES-2 and MES-6
30W04B5.2W04B5.2n/achrIII 2,425,901contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR005386 (EDG-8 sphingosine 1-phosphate receptor)
31C44C10.4C44C10.4n/achrX 11,694,526contains similarity to Pfam domain PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR003395 (RecF/RecN/SMC protein, N-terminal)
32F10A3.7F10A3.7n/achrV 16,156,140contains similarity to Pfam domain PF01461 (7TM chemoreceptor)
33srbc-7C18B10.4n/achrV 7,486,852C. elegans SRBC-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
34C47C12.2C47C12.2n/achrX 7,754,107
35F57G8.7F57G8.7n/achrV 16,329,811contains similarity to Antarctic bacterium str 643 Metalloproteinase precursor.; TR:Q9KH34
36F36F12.8F36F12.8n/achrV 2,091,148contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
37F10D11.2F10D11.2n/achrI 8,437,292contains similarity to Bacillus thuringiensis Pesticidial crystal protein cry8Ca (Insecticidal delta-endotoxinsCryVIIIC(a)) (Crystaline entomocidal protoxin) (130 kDa crystalsprotein).; SW:C8CA_BACTP
38T14E8.2T14E8.2n/achrX 6,542,867contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
39M01E11.3M01E11.3n/achrI 5,574,995contains similarity to Pfam domain PF08585 Domain of unknown function (DUF1767) contains similarity to Interpro domain IPR013894 (Region of unknown function DUF1767)
40T11G6.5T11G6.5n/achrIV 10,839,263contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
41C54E10.3C54E10.3n/achrV 18,812,207contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
42nhr-192F57A8.5n/achrV 10,069,976C. elegans NHR-192 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43lgc-9C04C3.2n/achrIV 3,417,455C. elegans LGC-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
44npp-12T23H2.1n/achrI 6,450,639npp-12 encodes Gp210, an evolutionarily conserved membrane protein of the nuclear pore complex (NPC); NPP-12 is required for embryonic viability and normal nuclear membrane structures.
45pqn-11C09G1.1n/achrX 15,969,125PQN-11 encodes an unfamiliar protein with a glutamine/asparagine-rich domain that is dispensable for viability and gross morphology.
46ZC404.10ZC404.10n/achrV 6,801,320contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47sru-48T03G11.2n/achrX 5,180,802C. elegans SRU-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
48D1044.4D1044.4n/achrIII 5,521,831
49F12F6.7F12F6.7n/achrIV 11,560,335contains similarity to Pfam domain PF04042 DNA polymerase alpha/epsilon subunit B contains similarity to Interpro domain IPR007185 (DNA polymerase alpha/epsilon, subunit B)
50pqn-62T03G11.1n/achrX 5,200,980The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).