UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C35C5.6C35C5.60chrX 11,566,764contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2478-PA;; FLYBASE:CG2478
2lin-49F42A9.2n/achrIV 8,623,398C. elegans LIN-49 protein; contains similarity to Pfam domains PF00628 (PHD-finger) , PF00439 (Bromodomain) contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR001487 (Bromodomain), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
3T26A5.8T26A5.8n/achrIII 6,462,478contains similarity to Pfam domain PF00808 Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
4srw-119K12D9.7n/achrV 2,999,188C. elegans SRW-119 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
5JC8.7JC8.7n/achrIV 13,248,845contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C4orf27; ENSEMBL:ENSP00000261511
6srj-21F28H7.11n/achrV 10,745,530C. elegans SRJ-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7his-32F17E9.10n/achrIV 8,334,513his-32 encodes an H3 histone; by homology, HIS-32 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-32 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS5 cluster on chromosome IV.
8prg-2C01G5.2n/achrIV 6,528,248C. elegans PRG-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02171 (Piwi domain) , PF02170 (PAZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
9srh-184D1054.12n/achrV 10,797,485C. elegans SRH-184 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10srt-63T28A11.15n/achrV 3,255,375C. elegans SRT-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
11F48G7.4F48G7.4n/achrV 620,860
12str-112F10D2.4n/achrV 7,137,353C. elegans STR-112 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13B0244.6B0244.6n/achrIII 5,741,364contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
14K12H4.2K12H4.2n/achrIII 8,047,973contains similarity to Pfam domain PF02410 Domain of unknown function DUF143 contains similarity to Interpro domain IPR004394 (Iojap-related protein)
15gck-4C04A11.3n/achrX 13,679,590C. elegans GCK-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
16T12A2.1T12A2.1n/achrIII 6,261,458contains similarity to Pfam domains PF01979 (Amidohydrolase family) , PF07969 (Amidohydrolase family) contains similarity to Interpro domains IPR011550 (Amidohydrolase-like), IPR013108 (Amidohydrolase 3), IPR006680 (Amidohydrolase 1), IPR005920 (Imidazolonepropionase)
17W03C9.5W03C9.5n/achrII 11,967,205contains similarity to Arabidopsis thaliana F25C20.11 protein.; TR:Q9SAA3
18bath-13F40B1.1n/achrII 2,521,505C. elegans BATH-13 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
19C27B7.2C27B7.2n/achrIV 8,893,280contains similarity to Arabidopsis thaliana F3O9.12 protein (At1g16320/F3O9_12).; TR:Q9SA31
20ceeh-1K02F3.6n/achrIII 830,425ceeh-1 encodes a soluble epoxide hydrolase (sEH) orthologous to human ABHD7 and ABHD9; recombinant CEEH-1 is biochemically active in vitro on epoxyeicosatrienoic acids and leukotoxins (EpOMEs); conversely, CEEH-1 is inhibited by urea-based antagonists of mammalian sEH that elevate EpOME levels when fed to C. elegans; perhaps because of genetic redundancy with its paralog CEEH-2, CEEH-1 has no obvious function in mass RNAi assays.
21F13G3.10F13G3.10n/achrI 7,313,972contains similarity to Interpro domain IPR010989 (t-SNARE)
22Y17G7B.3Y17G7B.3n/achrII 11,990,838Y17G7B.3 is orthologous to the human gene HYDROXYACYLGLUTATHIONE HYDROLASE (HAGH; OMIM:138760), which when mutated leads to disease.
23Y75B8A.7Y75B8A.7n/achrIII 12,156,145contains similarity to Pfam domain PF04006 Mpp10 protein contains similarity to Interpro domains IPR012173 (U3 small nucleolar ribonucleoprotein complex, subunit Mpp10p), IPR007151 (Mpp10 protein)
24ZK863.1ZK863.1n/achrV 12,169,192contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
25F02C12.3F02C12.3n/achrX 13,397,291
26C04G6.4C04G6.4n/achrII 5,082,452contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
27F52D2.6F52D2.6n/achrX 1,977,920
28F25B4.7F25B4.7n/achrV 5,686,614contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
29C01B10.9C01B10.9n/achrIV 6,633,581contains similarity to Pfam domain PF01663 Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase contains similarity to Interpro domains IPR002591 (Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase/phosphate transferase), IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
30srt-7C50H11.4n/achrV 3,082,398C. elegans SRT-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000408 (Regulator of chromosome condensation, RCC1)
31C35D10.1C35D10.1n/achrIII 4,880,584contains similarity to Interpro domain IPR013784 (Carbohydrate-binding-like fold)
32T11F9.12T11F9.12n/achrV 11,494,950contains similarity to Interpro domain IPR011735 (Conserved hypothetical protein, HtrL)
33mdf-1C50F4.11n/achrV 9,542,977mdf-1 encodes a coiled-coil domain-containing protein that is orthologous to the Saccharomyces cerevisiae mitotic spindle checkpoint protein Mad1p; consistent with a role as a checkpoint protein, MDF-1 is required in C. elegans for mitotic genome stability and hence, long-term survival and fertility; in vitro, MDF-1 interacts with MDF-2, the C. elegans Mad2p ortholog.
34sra-27F18C5.1n/achrII 6,569,673C. elegans SRA-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35K10C9.4K10C9.4n/achrV 1,051,572contains similarity to Interpro domain IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
36Y45G12C.11Y45G12C.11n/achrV 2,551,494contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
37T20B6.2T20B6.2n/achrIII 2,895,298contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
38cyp-34A1T10H4.10n/achrV 15,286,741C. elegans CYP-34A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
39Y56A3A.28Y56A3A.28n/achrIII 11,966,536contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
40nhr-51K06B4.1n/achrV 15,677,024C. elegans NHR-51 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
41mop-25.3T27C10.3n/achrI 10,891,011mop-25.3 encodes a divergent ortholog of fission yeast Mo25p, budding yeast Hym1p, Aspergillus nidulans HymA, human CAB39, and human CAB39L; MOP-25.3 is paralogous to MOP-25.1 and MOP-25.2; MOP-25.3 is required for embryonic development in mass RNAi assays.
42srx-41F59B1.7n/achrV 3,635,917C. elegans SRX-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
44hum-1F29D10.4n/achrI 8,848,443hum-1 encodes a class I unconventional myosin heavy chain that, within this class, is most closely related to the amoeboid myosin I subclass; loss of hum-1 activity via RNAi results in a low frequency of aldicarb resistance, suggesting that hum-1 may play a role in regulating synapse structure and/or function; when expressed in the DA cholinergic motor neurons, a HUM-1 reporter fusion protein localizes solely to punctate structures.
45nhr-103F44C8.4n/achrV 2,226,236nhr-103 encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain.
46F28F8.7F28F8.7n/achrV 15,579,943contains similarity to Pfam domain PF01448 ELM2 domain contains similarity to Interpro domain IPR000949 (ELM2)
47M01G5.3M01G5.3n/achrIII 1,513,690contains similarity to Pfam domain PF07851 TMPIT-like protein contains similarity to Interpro domain IPR012926 (TMPIT-like)
48F09G2.2F09G2.2n/achrV 7,197,657contains similarity to Interpro domain IPR011028 (Cyclin-like)
49srv-17C06E7.7n/achrIV 5,868,915C. elegans SRV-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50B0250.5B0250.5n/achrV 20,491,021contains similarity to Pfam domain PF03446 NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR006115 (6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding), IPR013328 (Dehydrogenase, multihelical), IPR015815 (3-hydroxyacid dehydrogenase/reductase), IPR011548 (3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase), IPR006183 (6-phosphogluconate dehydrogenase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002204 (3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase-related, conserved site)