UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1C35A5.4C35A5.40chrV 10,498,176contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein)
2C34B2.3C34B2.3n/achrI 10,673,805contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase)
3F45E1.4F45E1.4n/achrX 7,986,049
4F27C1.10F27C1.10n/achrI 5,435,347
5W02D9.10W02D9.10n/achrI 12,551,930
6skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
7sru-23F36G9.6n/achrV 15,971,479C. elegans SRU-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
8C09G5.7C09G5.7n/achrII 10,715,547contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
9srr-5C13D9.2n/achrV 5,009,463C. elegans SRR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domains IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species), IPR000146 (Inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase)
10Y42A5A.3Y42A5A.3n/achrV 11,095,685contains similarity to Bacillus subtilis Hypothetical protein yhen.; TR:O07596
11F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
12nhr-282F54B8.2n/achrV 15,812,667C. elegans NHR-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13F46B3.14F46B3.14n/achrV 20,626,135contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
14F15E6.4F15E6.4n/achrIV 4,291,666
15Y45F3A.4Y45F3A.4n/achrIII 10,573,829contains similarity to Interpro domain IPR008967 ()
16str-3M7.13n/achrIV 11,099,437str-3 encodes a seven transmembrane chemosensory receptor; STR-3 is expressed in the ASI chemosensory neurons; STR-3 expression in ASI is repressed in the presence of dauer pheromone at concentrations lower than that which induces dauer formation.
17Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
18C49C8.2C49C8.2n/achrIV 8,651,405
19srw-72F20E11.6n/achrV 17,467,788C. elegans SRW-72 protein ;
20C10C6.3C10C6.3n/achrIV 11,464,370contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Putative glycosidase of the cell wall, may have a role in cell wall architecture; SGD:YGR189C
21F35B3.3F35B3.3n/achrX 17,013,662
22M01B2.6M01B2.6n/achrV 15,242,739contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
23duo-2F29C4.5n/achrIV 113,683C. elegans DUO-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF02338 (OTU-like cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003323 (Ovarian tumour, otubain), IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
24ZK1240.1ZK1240.1n/achrII 2,330,574contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
25C55H1.1C55H1.1n/achrV 6,851,202contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
26R05A10.1R05A10.1n/achrIV 14,187,493
27T24A6.2T24A6.2n/achrV 3,558,528
28ZC443.4ZC443.4n/achrV 12,818,211contains similarity to Homo sapiens Isoform 4 of AT-rich interactive domain-containing protein 4B; ENSEMBL:ENSP00000375729
29srj-13R13D7.3n/achrV 7,403,263C. elegans SRJ-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30C54A12.2C54A12.2n/achrII 5,254,604contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
31clec-216F26D11.5n/achrV 7,952,270C. elegans CLEC-216 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
32F22E5.7F22E5.7n/achrII 2,642,443
33ZK688.4ZK688.4n/achrIII 7,895,076
34F15H10.5F15H10.5n/achrV 10,418,359contains similarity to Borrelia burgdorferi Hypothetical protein BB0170.; TR:O51192
35str-261W09D6.2n/achrIII 11,075,857C. elegans STR-261 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR011256 (Regulatory factor, effector, bacterial), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36C07A4.2C07A4.2n/achrX 10,173,174contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
37F21D9.3F21D9.3n/achrV 19,257,632contains similarity to Hepatitis B virus Large S protein (Major surface antigen).; TR:Q8JXA0
38sma-1R31.1n/achrV 11,908,070sma-1 encodes a beta-H spectrin; during embryonic morphogenesis, SMA-1 activity is required for a normal rate of elongation and thus, for a wild-type body length upon hatching; in addition, SMA-1 is required for proper morphogenesis of the pharynx and the excretory cell; sma-1 mRNA transcripts are first detected in hypodermal cells at the beginning of embryonic morphogenesis with later expression visible in the developing pharynx, intestine, and excretory cell.
39F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659
40F59D6.7F59D6.7n/achrV 3,038,633contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
41B0261.5B0261.5n/achrI 5,250,115
42W03B1.8W03B1.8n/achrIV 4,344,287contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
43ZK218.7ZK218.7n/achrV 17,106,188contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR000480 (Glutelin), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
44djr-1.2C49G7.11n/achrV 4,054,635C. elegans DJR-1.2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01965 DJ-1/PfpI family contains similarity to Interpro domains IPR006287 (DJ-1), IPR002818 (ThiJ/PfpI)
45F44B9.9F44B9.9n/achrIII 8,030,412contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
46W03B1.9W03B1.9n/achrIV 4,354,761contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
47C17A2.4C17A2.4n/achrII 3,840,560contains similarity to Cebus apella Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1 (EC 2.4.1.69) (GDP-L-sfucose:beta-D-galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1)s(Alpha(1,2)FT 1) (Fucosyltransferase 1).; SW:Q866E8
48Y40B1A.3Y40B1A.3n/achrI 13,356,226contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region)
49glb-22R11H6.3n/achrV 14,605,162glb-22 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
50K09D9.11K09D9.11n/achrV 3,999,279contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)