UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C34F6.6C34F6.62.0000000000000002e-76chrX 11,207,733contains similarity to Pisum sativum 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase (EC 2.5.1.55) (Phospho-2-sdehydro-3-deoxyoctonate aldolase) (3-deoxy-D-manno-octulosonic acid 8-sphosphate synthetase) (KDO-8-phosphate synthetase) (KDO 8-P synthase)s(KDOPS).; SW:KDSA_PEA
2T20G5.10T20G5.10n/achrIII 10,211,438contains similarity to Pfam domain PF06320 GCN5-like protein 1 (GCN5L1) contains similarity to Interpro domain IPR009395 (GCN5-like 1)
3his-69E03A3.3n/achrIII 4,058,523his-69 encodes a truncated H3 histone.
4lgc-45W10G11.16n/achrII 3,566,681C. elegans LGC-45 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
5srh-25C54D10.6n/achrV 12,433,068C. elegans SRH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6K09F6.7K09F6.7n/achrII 2,291,523contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
7T07G12.4T07G12.4n/achrIV 10,537,682contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
8T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
9C09G1.2C09G1.2n/achrX 15,980,318contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Formin, nucleates the formation of linear actin filaments, involved in cell processes such as budding and mitotic spindle orientation which require the formation of polarized actin cables, functionally redundant with BNR1; SGD:YNL271C
10C02G6.2C02G6.2n/achrV 5,873,482contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
11sup-12T22B2.4n/achrX 3,906,111sup-12 encodes an RNA-binding protein that contains a conserved RNA recognition motif (RRM); during development, SUP-12 functions to regulate muscle-specific splicing of alternative unc-60 and egl-15 pre-mRNAs; in vitro, SUP-12 can bind unc-60 and egl-15 pre-mRNAs; a sup-12::gfp promoter fusion is expressed in body wall muscle and in the pharynx; in body wall muscle, a SUP-12::GFP localizes to nuclei in a speckled pattern.
12srw-134T05B4.7n/achrV 4,111,591C. elegans SRW-134 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13srbc-62T19C9.1n/achrV 17,218,465C. elegans SRBC-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14pqn-15C24A8.3n/achrX 4,307,497The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
15F32H2.8F32H2.8n/achrI 8,992,131contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domains IPR004988 (Protein of unknown function DUF273), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
16acc-3F55D10.5n/achrX 4,725,216C. elegans ACC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR001390 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
17srz-42H12I19.1n/achrIV 14,130,194C. elegans SRZ-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18Y54G11A.9Y54G11A.9n/achrII 14,345,333contains similarity to Pfam domain PF01521 Iron-sulphur cluster biosynthesis contains similarity to Interpro domains IPR016092 (HesB/YadR/YfhF), IPR000361 (HesB/YadR/YfhF-like)
19his-48B0035.8n/achrIV 11,324,941his-48 encodes an H2B histone; by homology, HIS-48 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-48 is a replication-dependent histone locus that resides in a histone gene-rich region on chromosome IV.
20F26A1.9F26A1.9n/achrIII 4,825,812
21C05C9.2C05C9.2n/achrX 11,155,280contains similarity to White spot syndrome virus WSSV326.; TR:Q8QTD0
22R12E2.6R12E2.6n/achrI 4,151,478contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
23C15H9.3C15H9.3n/achrX 6,116,887contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24C17B7.5C17B7.5n/achrV 3,336,321contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
25mab-21F35G12.6n/achrIII 4,601,861mab-21 encodes a novel protein that is a member of a highly conserved family of proteins with Drosophila and vertebrate orthologs; MAB-21 is cell-autonomously required for specifying the identity of sensory ray 6 in the male tail, and also for backward locomotion, normal body morphology, fecundity, and embryonic morphogenesis; MAB-21 expression begins in embryonic hypodermal cells and continues in larval and adult animals in hypodermis, anterior and ventral cord neurons, some body wall muscles, and ray cells.
26srw-127C33G8.1n/achrV 7,013,646C. elegans SRW-127 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27srbc-75M01B2.3n/achrV 15,254,293C. elegans SRBC-75 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28D1081.3D1081.3n/achrI 8,466,325contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
29F58F6.6F58F6.6n/achrIV 1,342,037contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domain IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
30K10D11.4K10D11.4n/achrIV 12,993,278contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
31K09F6.5K09F6.5n/achrII 2,272,724contains similarity to Interpro domain IPR000358 (Ribonucleotide reductase)
32cyp-14A1K09A11.2n/achrX 13,266,131C. elegans CYP-14A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
33C25F6.1C25F6.1n/achrX 5,487,263
34M01G12.14M01G12.14n/achrI 12,107,675contains similarity to Rhizobium meliloti Putative transposase of insertion sequence ISRM19 protein (Putativestransposase for insertion sequence ISRM19).; TR:Q925Y0
35T07D10.2T07D10.2n/achrI 12,622,116T07D10.2 is orthologous to the human gene VASOPRESSIN RECEPTOR TYPE 2 (AVPR2; OMIM:304800), which when mutated leads to nephrogenic diabetes insipidus.
36K05C4.3K05C4.3n/achrI 14,750,791contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
37str-60T06C12.1n/achrV 15,898,679C. elegans STR-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38F22E5.2F22E5.2n/achrII 2,665,821
39C02D5.1C02D5.1n/achrIII 8,561,987contains similarity to Pfam domains PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
40K07E8.10K07E8.10n/achrII 666,102
41F30A10.6F30A10.6n/achrI 9,490,547contains similarity to Pfam domain PF02383 SacI homology domain contains similarity to Interpro domain IPR002013 (Synaptojanin, N-terminal)
42T05C12.4T05C12.4n/achrII 8,178,909contains similarity to Interpro domain IPR003566 (T-cell surface glycoprotein CD5)
43K09C4.2K09C4.2n/achrX 3,297,833
44fbxa-111Y102A5C.14n/achrV 16,949,135This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
45str-260T24A6.6n/achrV 3,528,795C. elegans STR-260 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46K02F6.7K02F6.7n/achrII 2,527,240
47F28B1.4F28B1.4n/achrV 17,056,226contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Ferredoxin (FDX-2).; TR:O30071
48C18B10.6C18B10.6n/achrV 7,480,150contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
49T01C8.2T01C8.2n/achrX 16,786,949
50T09A5.4T09A5.4n/achrII 7,847,007Weak similarity with the E. coli methionyl-tRNA formyltransferase (Swiss Prot. accession number P23882)