UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C34B2.5C34B2.52e-105chrI 10,675,986contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
2eri-3W09B6.3n/achrII 1,125,668C. elegans ERI-3 protein ;
3ugt-19K08B4.3n/achrIV 6,078,341C. elegans UGT-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
4spd-3H34C03.1n/achrIV 6,763,933C. elegans SPD-3 protein ;
5Y106G6H.8Y106G6H.8n/achrI 10,452,513contains similarity to Pfam domain PF04241 Protein of unknown function (DUF423) contains similarity to Interpro domain IPR006696 (Protein of unknown function DUF423)
6F52H2.5F52H2.5n/achrX 2,558,768
7F55A3.2F55A3.2n/achrI 10,795,710contains similarity to Interpro domains IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
8W05G11.2W05G11.2n/achrIII 58,191contains similarity to Pfam domain PF00134 Cyclin, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal)
9D2007.4D2007.4n/achrIII 8,145,419contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is mRpL18-PA;; FLYBASE:CG12373
10F54B8.1F54B8.1n/achrV 15,811,031contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
11cir-1F55F8.4n/achrI 5,654,871C. elegans CIR-1 protein ; contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of CBF1-interacting corepressor; ENSEMBL:ENSP00000339723
12CD4.8CD4.8n/achrV 5,600,286contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
13F43G9.10F43G9.10n/achrI 8,639,367contains similarity to Pfam domain PF06991 Micro-fibrillar-associated protein 1 C-terminus contains similarity to Interpro domains IPR009730 (Micro-fibrillar-associated 1, C-terminal), IPR000533 (Tropomyosin)
14bath-21F59H6.8n/achrII 2,026,127C. elegans BATH-21 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
15C36E8.1C36E8.1n/achrIII 4,001,753contains similarity to Pfam domain PF05327 RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 contains similarity to Interpro domain IPR007991 (RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3)
16C24G6.3C24G6.3n/achrV 5,517,383contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
17tre-3W05E10.4n/achrV 11,712,817tre-3 encodes one of four putative trehalases in C. elegans of unknown function, as RNAi analysis has not produced an obvious phenotype; expressed throughout development.
18ula-1C26E6.8n/achrIII 4,919,320The ula-1 gene encodes a component of the enzyme that activates NED-8, which in turn is a ubiquitin-like protein whose conjugating enzyme is UBC-12.
19C23H3.5C23H3.5n/achrII 48,839
20F20H11.1F20H11.1n/achrIII 6,590,715contains similarity to Pfam domain PF00130 Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
21rabn-5F01F1.4n/achrIII 5,865,475C. elegans RABN-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF09311 (Rab5 binding) , PF01363 (FYVE zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000306 (Zinc finger, FYVE-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type), IPR015390 (Rabaptin, GTPase-Rab5 binding), IPR017455 (Zinc finger, FYVE-related), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
22F54C9.9F54C9.9n/achrII 8,579,712contains similarity to Pfam domain PF05178 Krr1 family contains similarity to Interpro domain IPR007851 (Kri1)
23srw-32K03D7.11n/achrV 17,509,470C. elegans SRW-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
24F56C11.3F56C11.3n/achrI 182,455contains similarity to Pfam domain PF04777 Erv1 / Alr family contains similarity to Interpro domain IPR006863 (Erv1/Alr)
25C01G10.7C01G10.7n/achrV 15,086,381contains similarity to Pfam domain PF03328 HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family contains similarity to Interpro domains IPR011206 (Citrate lyase, beta subunit), IPR005000 (HpcH/HpaI aldolase), IPR015813 (Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core)
26C08H9.12C08H9.12n/achrII 9,856,818contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
27R07E5.1R07E5.1n/achrIII 4,410,321contains similarity to Pfam domains PF07713 (Protein of unknown function (DUF1604)) , PF01585 (G-patch domain) contains similarity to Interpro domains IPR011666 (Protein of unknown function DUF1604), IPR000467 (D111/G-patch), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
28T12G3.5T12G3.5n/achrIV 12,031,705contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is mRpL51-PA;; FLYBASE:CG13098
29ucp-4K07B1.3n/achrV 9,335,690C. elegans UCP-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
30C25D7.10C25D7.10n/achrV 15,067,993contains similarity to Mus musculus Probable taste receptor type 2 member 23 (T2R23) (STC9-2).; SW:T2R2_MOUSE
31F45E4.11F45E4.11n/achrIV 7,652,864contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
32F19F10.8F19F10.8n/achrV 7,570,024
33T02C12.3T02C12.3n/achrIII 4,023,867contains similarity to Aedes aegypti Putative uncharacterized protein.; TR:Q16W48
34T08A11.1T08A11.1n/achrIII 4,255,571contains similarity to Interpro domains IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000591 (Pleckstrin/ G-protein, interacting region)
35prpf-4F22D6.5n/achrI 7,092,922C. elegans PRPF-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
36smp-2D1037.2n/achrI 3,669,414C. elegans SMP-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01403 Sema domain contains similarity to Interpro domains IPR001627 (Semaphorin/CD100 antigen), IPR003659 (Plexin/semaphorin/integrin), IPR016201 (Plexin-like fold), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
37F57G4.1F57G4.1n/achrV 17,625,531contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
38C50E3.5C50E3.5n/achrV 7,591,348contains similarity to Interpro domain IPR008108 (Type III secretion system outer membrane, B protein)
39M01G5.1M01G5.1n/achrIII 1,503,267contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000024537
40ttll-5C55A6.2n/achrV 11,510,749ttll-5 encodes a putative tubulin polyglutamylase orthologous to human TTLL5; TTLL-5 is required for embryonic development and fertility; by orthology, TTLL-5 is expected to initiate glutamyl chains rather than elongating them, to prefer alpha-tubulin over beta-tubulin as a substrate, and to have non-tubulin substrates.
41F52H2.3F52H2.3n/achrX 2,540,613
42nhr-177F16B4.1n/achrV 1,611,519C. elegans NHR-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43C30H6.7C30H6.7n/achrIV 17,381,384contains similarity to Pfam domains PF00198 (2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain)) , PF02817 (e3 binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR004167 (E3 binding), IPR001078 (Catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes)
44acl-3ZK809.2n/achrIV 11,651,359acl-3 encodes a phosphate acyltransferase that is orthologous to human tafazzin (TAZ; OMIM:300394, mutated in Barth syndrome); by homology, ACL-3 is predicted to be a mitochondrial protein that plays a role in phospholipid metabolism, although loss of acl-3 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious defects.
45D2085.6D2085.6n/achrII 8,660,679D2085.6 is orthologous to the human gene CLASS A GLCNAC-INOSITOL PHOSPHOLIPID ASSEMBLY PROTEIN (PIGA; OMIM:311770), which when mutated leads to paroxysmal nocturnal hemoglobinuria.
46fbxa-60T12B5.10n/achrIII 945,562This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
47lpd-2C48E7.3n/achrI 6,254,291C. elegans LPD-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
48cyn-7Y75B12B.2n/achrV 15,186,997cyn-7 encodes a cyclophilin A isoform; while not tested for peptidyl-prolyl isomerase activity in vitro, it is very similar to CYN-3 and closely resembles the prototypical CypA, and is therefore likely to be a member of the cytosolic CsA-binding cyclophilin subfamily; CYN-7 was required for embryonic viability in one set of mass RNAi assays.
49C29F7.7C29F7.7n/achrX 13,442,218contains similarity to Peromyscus maniculatus Alcohol dehydrogenase 2 (EC 1.1.1.1).; SW:ADH2_PERMA
50lip-1C05B10.1n/achrIV 6,843,879lip-1 encodes a mitogen-activated protein (MAP) kinase phosphatase homologous to the vertebrate dual specificity phosphatase MKP-3; during development, LIP-1 negatively regulates MAP kinase activity to control the extent of germline proliferation and oocyte meiotic cell cycle progression; lip-1 activity is also required redundantly with dep-1 to negatively regulate MAPK signaling during vulval induction; in addition, lip-1 is required for normal embryonic development; lip-1 expression begins during embryogenesis and continues through adulthood; expression is seen in most somatic cells and in germ cells of the pachytene region, transition zone and proximal-most region of the mitotic zone; in the pachytene region, LIP-1 is associated with the plasma membrane; in early L3 larvae, LIP-1 expression increases in secondary vulval precursor cells in a lin-12/Notch-dependent manner, suggesting that lip-1 may be a direct downstream target of lin-12-mediated signaling; interaction with the Notch pathway is further demonstrated by chromatin immunoprecipitation experiments showing that, in the germline, the lip-1 promoter region coprecipitates with LAG-3; germline lip-1 mRNA accumulation is negatively regulated by the FBF proteins (FBF-1 and FBF-2) that bind to the lip-1 3'UTR.