UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1C33F10.12C33F10.120chrII 4,837,006contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
2B0252.5B0252.5n/achrII 6,917,923
3F40F12.3F40F12.3n/achrIII 9,919,252
4F42G4.2F42G4.2n/achrII 13,049,257contains similarity to Homo sapiens Transcription initiation factor TFIID subunit 3; ENSEMBL:ENSP00000340271
5Y57G11C.6Y57G11C.6n/achrIV 14,759,618contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
6F59A6.2F59A6.2n/achrII 5,015,006contains similarity to Homo sapiens High mobility group protein 1-like 10; ENSEMBL:ENSP00000215935
7Y41C4A.7Y41C4A.7n/achrIII 11,699,359contains similarity to Interpro domain IPR008962 (PapD-like)
8B0207.9B0207.9n/achrI 5,957,923
9fbxa-196T05H4.2n/achrV 6,449,403This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
10K06H7.8K06H7.8n/achrIII 8,097,370contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
11ZK673.6ZK673.6n/achrII 10,463,519contains similarity to Hydra attenuata Myosin heavy chain, clone 203 (Fragment).; SW:MYS3_HYDAT
12ZK930.7ZK930.7n/achrII 11,914,880contains similarity to Homo sapiens Mucin; TR:Q14851
13C05C12.1C05C12.1n/achrIV 11,254,815contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14Y51B9A.3Y51B9A.3n/achrII 9,406,276contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
15C44B9.2C44B9.2n/achrIII 10,876,618contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16C08F8.4C08F8.4n/achrIV 11,158,277contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
17F36H1.3F36H1.3n/achrIV 11,050,996contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
18H12D21.2H12D21.2n/achrV 14,888,059contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
19F23C8.7F23C8.7n/achrI 2,423,740contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
20B0218.5B0218.5n/achrIV 8,155,831contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
21F42G8.8F42G8.8n/achrIV 8,120,646contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
22ZK930.4ZK930.4n/achrII 11,908,092contains similarity to Homo sapiens Similar to hypothetical protein FLJ20094; ENSEMBL:ENSP00000324274
23Y45F10B.8Y45F10B.8n/achrIV 13,577,771contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin)
24F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
25B0034.4B0034.4n/achrII 5,968,559contains similarity to Oryctolagus cuniculus Triadin.; SW:Q28820
26T28C6.5T28C6.5n/achrIV 8,822,105contains similarity to Interpro domains IPR000909 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific , X region), IPR000023 (Phosphofructokinase)
27K09C6.8K09C6.8n/achrV 841,718contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
28dlc-6Y106G6G.3n/achrI 10,323,861dlc-6 encodes a putative dynein light chain 1; DLC-6 is orthologous to human DYNLL1 (OMIM:601562) and DYNLL2 (OMIM:608942), but much more divergent from them than its paralog DLC-1; DLC-6's other paralogs are DLC-2/-5; DLC-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
29ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
30clec-134W10G11.11n/achrII 3,580,752C. elegans CLEC-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
31F59C6.2F59C6.2n/achrI 10,523,017contains similarity to Pfam domain PF01529 DHHC zinc finger domain contains similarity to Interpro domain IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type)
32Y45F10B.2Y45F10B.2n/achrIV 13,595,366contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_6700.; TR:Q98PP9
33ttr-9C33A12.15n/achrIV 9,505,947C. elegans TTR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
34C08F8.6C08F8.6n/achrIV 11,163,509contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
35dct-9W03F11.3n/achrI 2,234,343C. elegans DCT-9 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
36Y69E1A.8Y69E1A.8n/achrIV 10,967,320contains similarity to Sulfolobus tokodaii Hypothetical protein ST0457.; TR:Q975F4
37ZC581.2ZC581.2n/achrI 6,656,611contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38C10H11.7C10H11.7n/achrI 4,720,444contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
39T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
40K02B12.6K02B12.6n/achrI 8,519,194contains similarity to Schistosoma mansoni Putative eggshell protein (Fragment).; SW:P08016
41T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)
42R102.7R102.7n/achrIV 10,703,834
43R03D7.5R03D7.5n/achrII 10,948,319contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44T20F5.5T20F5.5n/achrI 3,918,806contains similarity to Homo sapiens Isoform E of Proteoglycan-4 precursor; ENSEMBL:ENSP00000356454
45C01G12.8C01G12.8n/achrII 14,595,473contains similarity to Pfam domains PF00689 (Cation transporting ATPase, C-terminus) , PF00122 (E1-E2 ATPase) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) , PF00690 (Cation transporter/ATPase, N-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR005775 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit, eukaryotic), IPR008250 (E1-E2 ATPase-associated region), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit), IPR004014 (ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR006068 (ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR000695 (H+ transporting ATPase, proton pump)
46Y38F1A.7Y38F1A.7n/achrII 12,997,333contains similarity to Pseudomonas aeruginosa Probable periplasmic spermidine/putrescine-binding protein.; TR:Q9I3T4
47B0334.10B0334.10n/achrII 11,518,945contains similarity to Vaccinia virus TB17L.; TR:Q9JF36
48C35D10.3C35D10.3n/achrIII 4,869,534
49Y116A8C.38Y116A8C.38n/achrIV 17,132,537contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
50C14A4.8C14A4.8n/achrII 10,597,545contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)