UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C33E10.1C33E10.13e-37chrX 17,305,742This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3ZK418.3ZK418.3n/achrIII 7,070,514contains similarity to Homo sapiens Transmembrane protein 17; ENSEMBL:ENSP00000335094
4C31H5.6C31H5.6n/achrI 9,045,096contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
5bath-10Y49F6C.4n/achrII 3,375,923C. elegans BATH-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
6F31D4.5F31D4.5n/achrV 20,851,509contains similarity to Pfam domain PF00169 PH domain contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR010997 (HRDC-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type)
7ttr-20F36A4.8n/achrIV 4,246,321C. elegans TTR-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
8skr-21K08H2.1n/achrX 13,226,159The skr-21 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-21(RNAi) animals are at least superficially normal.
9fbxb-32M151.6n/achrII 3,646,198C. elegans FBXB-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
10T10C6.2T10C6.2n/achrV 16,013,354contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11F55C9.11F55C9.110.0004chrV 19,307,376This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
12W05B10.4W05B10.4n/achrV 12,668,893contains similarity to Pfam domain PF00788 Ras association (RalGDS/AF-6) domain contains similarity to Interpro domain IPR000159 (Ras-association)
13K02E7.7K02E7.7n/achrII 1,055,525
14R11.4R11.4n/achrX 16,210,394contains similarity to Leishmania major Hypothetical protein.; TR:Q9GRL1
15C55A1.4C55A1.4n/achrV 15,642,939contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
16ceh-43C28A5.4n/achrIII 4,448,260A homeobox protein of the Distal-less (Dll) class that is required for development of the anterior hypdermis during embryonic morphogenesis for cell adhesion; also affects embryonic and larval viability; it is predominantly expressed in the head hypdodermis, neuronal support cells and CAN neurons.
17Y57A10C.1Y57A10C.1n/achrII 12,411,984contains similarity to Macaca mulatta Thyrotropin receptor (Fragment).; TR:Q8HY53
18srh-39C06A8.7n/achrII 7,764,656C. elegans SRH-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19F58G1.7F58G1.7n/achrII 12,945,904contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
20fbxb-18F58E1.8n/achrII 1,686,936This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains leucine-rich repeats.
21Y116A8B.1Y116A8B.1n/achrIV 17,216,790contains similarity to Oryza sativa P0660F12.13 protein (P0614D08.10 protein).; TR:Q94CR6
22F20C5.6F20C5.6n/achrIV 8,772,362contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DLG0
23T02G5.2T02G5.2n/achrII 7,095,853contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001023 (Heat shock protein Hsp70)
24T20D4.19T20D4.19n/achrV 3,431,055contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
25dylt-2D1009.5n/achrX 8,939,705dylt-2 encodes a small putative dynein light chain subunit orthologous to human CTEX1D1, LOC343521, and TCTE3; unlike its distant paralog DYLT-1, DYLT-2 does not obviously inhibit DHC-1 in vivo; DYTL-2 has no obvious function in mass RNAi assays.
26unc-42F58E6.10n/achrV 9,766,975unc-42 encodes a paired-like homeodomain protein of the Q50 class; UNC-42 is required to specify the fate of ASH sensory neurons, AVA, AVD, and AVE interneurons, and a subset of motor neurons; unc-42 mutants fail to express cell-surface receptors required for differentiated neuronal function (sra-6, srb-6, glr-1, glr-5, and glr-6); UNC-42 is also required for AVKR and HSNL growth cones to follow the PVPR and PVQL pioneer axons, for axonal outgrowth in the backward command interneurons AVA, AVD, and AVE, and for inhibition of ectopic FMRFamide-positive and GABAergic axons; unc-42 mutants are defective in mechanosensation, backward motion, and regulation of egg-laying.
27F23D12.5F23D12.5n/achrX 14,450,814F23D12.5 encodes a putative histone H3 di/trimethyllysine-27 (H3K27me2/me3) demethylase; F23D12.5 contains a C-terminal JmjC domain, and is homologous to human JMJD3, UTX (OMIM:300128), and UTY (OMIM:400009); F23D12.5 is expected to antagonize transcriptional repression by polycomb repressor complexes, which mark stem cells (and presumably germline) by H3K27me3-mediated repression of somatic genes; however, F23D12.5 has no obvious function in mass RNAi assays.
28nhr-148C03G6.10n/achrV 7,342,974C. elegans NHR-148 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
29F13H10.1F13H10.1n/achrIV 11,004,784contains similarity to Oryza sativa Putative pM5 collagenase.; TR:Q93W04
30T23B3.2T23B3.2n/achrI 6,716,467contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
31R07C3.6R07C3.6n/achrII 924,524
32EEED8.2EEED8.2n/achrII 5,417,509contains similarity to Interpro domains IPR012674 (Calycin), IPR011038 (Calycin-like), IPR000463 (Cytosolic fatty-acid binding)
33ced-8F08F1.5n/achrX 8,415,405The ced-8 gene encodes a homolog of the human putative membrane transporter XK; ced-8 is required for apoptosis to occur with normal speed during embryonic development.
34F40G9.6F40G9.6n/achrIII 179,840
35bath-9Y49F6C.3n/achrII 3,377,880C. elegans BATH-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR010916 (TonB box, conserved site), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
36fbxb-54K05F6.7n/achrII 1,555,788C. elegans FBXB-54 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001404 (Heat shock protein Hsp90), IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
37C29A12.6C29A12.6n/achrV 10,849,822contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
38col-97ZK1010.7n/achrIII 12,993,066col-97 encodes a cuticular collagen; loss of col-97 activity via large-scale RNAi screens results in defects in body morphology and locomotion.
39cut-6M142.2n/achrIII 10,913,915C. elegans CUT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00100 (Zona pellucida-like domain) , PF00092 (von Willebrand factor type A domain) contains similarity to Interpro domains IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
40fbxb-25F58E1.2n/achrII 1,684,456This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
41fbxb-66Y40B1B.3n/achrI 13,424,575C. elegans FBXB-66 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
42hot-6C13G3.2n/achrV 11,021,972C. elegans HOT-6 protein ;
43C09G9.5C09G9.5n/achrIV 8,887,547contains similarity to Interpro domain IPR008992 ()
44lgc-13T01H10.1n/achrX 12,110,105C. elegans LGC-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
45C35E7.3C35E7.3n/achrI 10,837,920
46F34D6.1F34D6.1n/achrII 2,680,190This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
47F53C3.4F53C3.4n/achrII 3,902,067contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
48F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
49R03A10.1R03A10.1n/achrX 15,430,484contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in transcription-coupled repair nucleotide exicision repair of UV-induced DNA lesions; homolog of human CSB protein; SGD:YJR035W
50K12H6.7K12H6.7n/achrII 2,835,833