UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ceh-30C33D12.71.0000000000000001e-96chrX 3,064,554ceh-30 encodes a homeodomain protein most similar to Drosophila and mammalian BarH1 (OMIM:605211) which function in neuronal cell fate determination; the precise biological role of CEH-30 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
2srw-57F36G9.1n/achrV 15,954,286C. elegans SRW-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
3T05A6.5T05A6.5n/achrII 7,824,034contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
4C17G1.1C17G1.1n/achrX 9,919,758contains similarity to Trypanosoma rangeli Kinetoplastid membrane protein 11.; TR:Q7YZC6
5srg-32T21C9.7n/achrV 10,587,952C. elegans SRG-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
6srg-41T19C4.3n/achrV 11,161,148C. elegans SRG-41 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
7T09F5.2T09F5.2n/achrV 15,151,275contains similarity to Saccharomyces cerevisiae cell wall mannoprotein; SGD:YOR009W
8F45F2.1F45F2.1n/achrV 8,538,519contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
9clec-131W10G11.7n/achrII 3,575,385C. elegans CLEC-131 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
10M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
11srh-49C10G11.4n/achrI 6,298,750C. elegans SRH-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12rap-2C25D7.7n/achrV 15,062,961rap-2 encodes a Ras-related GTPase that is most similar to the RAP2 members of the Ras GTPase superfamily; by homology, RAP-2 is predicted to function as a membrane-localized GTPase that likely plays a role in signal transduction; as animals homozygous for a rap-2 deletion mutation show no obvious abnormalities, the precise role of RAP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
13srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
14srj-27T01G5.3n/achrV 15,126,838C. elegans SRJ-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
16C35C5.2C35C5.2n/achrX 11,539,654contains similarity to Pfam domains PF04389 (Peptidase family M28) , PF02225 (PA domain) , PF04253 (Transferrin receptor-like dimerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR007365 (Transferrin receptor-like, dimerisation), IPR007484 (Peptidase M28), IPR003137 (Protease-associated PA)
17T22D1.6T22D1.6n/achrIV 6,899,771
18nhr-111F44G3.9n/achrV 16,123,891nhr-111 encodes a member of the nuclear receptor superfamily; by homology, NHR-111 is predicted to function as a ligand-dependent transcriptional regulator, but as loss of nhr-111 activity via large-scale RNAi screens does not result in any abnormalities, the precise role of NHR-111 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; an nhr-111 reporter construct is expressed in embryos and early larvae in a pair of neurons in the ventral ganglion of the head and in two cells that may be the somatic gonad precursors.
19srh-122R08H2.5n/achrV 15,377,228C. elegans SRH-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20Y75B8A.31Y75B8A.31n/achrIII 12,353,159contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of UPF0528 protein C5orf21 precursor; ENSEMBL:ENSP00000265139
21ttx-3C40H5.50.00004chrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
22srx-112T24E12.8n/achrII 3,764,010C. elegans SRX-112 protein ;
23R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)
24Y62H9A.14Y62H9A.14n/achrX 11,922,107contains similarity to Interpro domain IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
25gpa-9F56H9.4n/achrV 12,648,055gpa-9 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ASJ, PHB, PVQ, pharyngeal muscle, and the spermatheca.
26clec-179C42D4.11n/achrIV 7,183,961C. elegans CLEC-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27F16G10.14F16G10.14n/achrII 2,398,093contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
28srh-228C35D6.1n/achrIV 16,340,479C. elegans SRH-228 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29F42G2.6F42G2.60.003chrII 2,428,176contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
30T26E4.1T26E4.1n/achrV 15,780,361contains similarity to Pfam domain PF01030 (Receptor L domain)
31nhr-126F44C8.10n/achrV 2,230,032nhr-126 encodes a member of the nuclear hormone receptor family.
32T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
33F46F5.5F46F5.5n/achrII 812,930contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
34unc-3Y16B4A.1n/achrX 14,778,472The unc-3 gene encodes a protein with homology to immunoglobulin (Ig) domain-containing transcription factors such as OLF-1 or SU(H).
35str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36str-131C09H5.6n/achrV 8,081,002C. elegans STR-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37Y70C5C.3Y70C5C.3n/achrV 16,714,293contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
38Y54G9A.1Y54G9A.1n/achrII 13,700,041contains similarity to Carabus linnei NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment).; TR:O79584
39hot-7Y48B6A.9n/achrII 14,212,173hot-7 encodes a predicted membrane-associated protein that is a member of the Ly-6 superfamily of glycosylphosphatidylinositol (GPI)-linked signaling proteins and is homologous to ODR-2, a neuronally expressed protein required for olfaction; as loss of hot-7 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of HOT-7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
40R11D1.4R11D1.4n/achrV 12,713,623contains similarity to Xenopus laevis Similar to kinesin-like 1.; TR:Q8AVK8
41K06A1.1K06A1.1n/achrII 6,455,658K06A1.1 encodes an AP-2-like transcription factor.
42str-204F10D2.1n/achrV 7,160,334C. elegans STR-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43C04A11.2C04A11.2n/achrX 13,667,311contains similarity to Homo sapiens Putative protein TPRXL; ENSEMBL:ENSP00000322097
44F21D9.8F21D9.8n/achrV 19,279,623contains similarity to Medicago truncatula Pectin methyl-esterase PER precursor (EC 3.1.1.11).; TR:Q9SC90
45F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
46srz-48F20E11.1n/achrV 17,459,315C. elegans SRZ-48 protein ;
47T24H10.4T24H10.4n/achrII 9,110,325contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
48nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
49srz-53Y102A5C.23n/achrV 16,977,768C. elegans SRZ-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50srx-19T05A12.1n/achrIV 6,874,033C. elegans SRX-19 protein ;