UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C33C12.7C33C12.79.999999999999999e-43chrII 2,174,952
2K09C4.4K09C4.4n/achrX 3,290,202contains similarity to Pfam domain PF00083 Sugar (and other) transporter contains similarity to Interpro domains IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
3K11E4.1K11E4.1n/achrX 13,715,160contains similarity to Pfam domain PF01764 (Lipase (class 3))
4nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5F59B10.6F59B10.6n/achrII 10,523,795contains similarity to Prochlorococcus marinus Possible paralytic/GBP/PSP peptide precursor.; TR:Q7TUU1
6Y81G3A.3Y81G3A.3n/achrII 13,087,735contains similarity to Pfam domains PF05773 (RWD domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7F25F8.1F25F8.1n/achrI 4,890,200contains similarity to Interpro domain IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like)
8srab-12C47A10.6n/achrV 17,782,010C. elegans SRAB-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
9C04E12.6C04E12.6n/achrV 3,355,089contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
10nhr-132R11G11.1n/achrV 535,310C. elegans NHR-132 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11R05C11.1R05C11.1n/achrIV 2,070,210contains similarity to Interpro domain IPR014756 (Immunoglobulin E-set)
12Y32B12A.1Y32B12A.1n/achrV 16,488,780contains similarity to Pfam domain PF00569 Zinc finger, ZZ type contains similarity to Interpro domain IPR000433 (Zinc finger, ZZ-type)
13str-15T08G3.1n/achrV 16,458,013C. elegans STR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14ocr-2T09A12.3n/achrIV 8,216,912ocr-2 encodes a TRPV (transient receptor potential channel, vanilloid subfamily) ion channel; OCR-2 activity is required for several types of sensory transduction including olfaction, osmosensation, mechanosensation, and chemosensation; an OCR-2 fusion protein is expressed in sensory cilia and requires the OSM-9 TRPV channel protein for proper localization; likewise, OSM-9 requires OCR-2 for its cilial localization.
15F54D12.8F54D12.8n/achrII 1,396,527contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR003609 (Apple-like)
16R05A10.8R05A10.8n/achrIV 14,156,627contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
17srab-10C36C5.7n/achrV 3,143,828C. elegans SRAB-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18tag-120F40F9.2n/achrV 9,708,653tag-120 encodes a predicted transmembrane protein; as loss of tag-120 activity via RNAi does not result in any abnormalities, the precise role of TAG-120 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; however, TAG-120 is homologous to a Drosophila NMDA receptor-associated protein and mammalian transmembrane proteins that function in Fas-mediated cell death, so TAG-120 may play a role in neuronal functions and/or apoptosis; a tag-120 reporter fusion is expressed in the nervous system, pharyngeal muscles, and to a lesser extent in the excretory system.
19srg-17F15A4.7n/achrII 12,474,385C. elegans SRG-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
20F37C4.2F37C4.2n/achrIV 3,887,244contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
21ptr-8F44F4.4n/achrII 10,891,194ptr-8 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-8 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; PTR-8 is also required for normal growth to full size and locomotion; PTR-8 is expressed in hypodermis.
22src-2F49B2.5n/achrI 14,325,568C. elegans SRC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
23W04H10.1W04H10.1n/achrII 609,207
24F35C11.6F35C11.6n/achrII 8,258,607contains similarity to Homo sapiens Oxysterol binding protein-related protein 11; ENSEMBL:ENSP00000296220
25cyp-34A3C41G6.1n/achrV 15,229,059C. elegans CYP-34A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
26K04A8.5K04A8.5n/achrV 6,550,991contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1)
27srt-67B0238.5n/achrV 5,256,766C. elegans SRT-67 protein; contains similarity to Pfam domains PF01461 (7TM chemoreceptor) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28twk-35F31D4.7n/achrV 20,859,750C. elegans TWK-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
29F33D11.6F33D11.6n/achrI 5,845,654
30acr-15F25G6.4n/achrV 8,554,009A homolog of an alpha type nicotinic acetylcholine receptor subunit involved in the mediation of fast synaptic transmission at neuromuscular junctions.
31gcy-29C04H5.3n/achrII 14,544,746C. elegans GCY-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF01094 (Receptor family ligand binding region) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor)
32srx-32R13D11.9n/achrV 820,140C. elegans SRX-32 protein ;
33F35C12.1F35C12.1n/achrI 9,805,249contains similarity to Ralstonia solanacearum PopB.; TR:Q84IE7
34twk-14K01D12.4n/achrV 12,388,845C. elegans TWK-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR005410 (Potassium channel, two pore-domain, THIK), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
35C28H8.2C28H8.2n/achrIII 5,923,760
36frm-3H05G16.1n/achrX 11,578,915frm-3 encodes a protein containing a FERM domain (Band 4.1 family); expressed in a few cells in the head.
37egl-23Y37A1B.11n/achrIV 14,007,827egl-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; egl-23 was originally defined by gain-of-function mutations that result in defects in locomotion, egg-laying, and enteric muscle activation; loss of egl-23 function via reversion or RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities suggesting that EGL-23 may function redundantly with other TWK channels; egl-23 does not, however, interact genetically with the UNC-93 group of TWKs encoded by unc-93, sup-9, and sup-10; the EGL-23 expression pattern is not yet known.
38Y37A1B.6Y37A1B.6n/achrIV 14,038,988contains similarity to Bacillus amyloliquefaciens Beta-glucanase (BglA) (Fragment).; TR:Q44651
39ptr-19Y39A1B.2n/achrIII 10,786,410ptr-19 encodes an ortholog of Drosophila and human PTCHD3, which defines one of seven paralogous families of sterol sensing domain (SSD) proteins; PTR-19 is required for normal development in mass RNAi assays; PTR-19 is expressed in pharynx, hypodermis, nervous system (including head neurons), and other cells.
40C50F7.9C50F7.9n/achrIV 7,731,347
41sri-28B0454.3n/achrII 3,049,551C. elegans SRI-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42srab-16R13D11.6n/achrV 783,761C. elegans SRAB-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
43nhr-176F14H3.11n/achrV 16,072,040C. elegans NHR-176 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44clpp-1ZK970.2n/achrII 10,301,745clpp-1 encodes a mitochondrial protein, homologous to bacterial ClpP, required to initiate the stress response to unfolded mitochondrial proteins; as with its bacterial ortholog, CLPP-1 is predicted to be a proteolytic subunit of a Clp-like protease, with an N-terminal region required for mitochondrial localization, and a C-terminal region of ClpP similarity; in response to a mutation stressing mitochondria, clpp-1(RNAi) animals show reduced HSP-60 levels, inhibited nuclear translocation and hsp-60 activation by DVE-1, and aberrant mitochondrial morphology; CLPP-1 is biochemically inhibited by the ClpP inhibitor Z-LY-CMK and the peptide aldehyde MG132, and may also be blocked by them when injected in vivo; CLPP-1 is expressed in the intestine.
45R03G8.1R03G8.1n/achrX 13,086,031contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
46F42C5.10F42C5.10n/achrIV 7,323,684contains similarity to Interpro domains IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region)
47C34E11.2C34E11.2n/achrX 11,808,336contains similarity to Pfam domain PF03166 MH2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001132 (SMAD domain, Dwarfin-type), IPR017855 (SMAD domain-like)
48des-2T26H10.1n/achrV 11,417,794des-2 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating the fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; DES-2 is coexpressed with and genetically interacts with DEG-3, which which it probably forms heteromultimers, and DES-2 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, probably unique to nematodes, which includes DEG-3, ACR-5, ACR-17, ACR-18 ACR-20, and ACR-23.
49F13H8.5F13H8.5n/achrII 6,254,376F13H8.5 encodes a protein with a domain of unknown function (DB; IPR002602) that is found in several worm proteins, and a glutamine/asparagine-rich domain.
50F15D4.3F15D4.3n/achrII 13,237,564contains similarity to Homo sapiens Protein MGR2 homolog; ENSEMBL:ENSP00000338293