UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1dct-19C32H11.130chrIV 12,943,591C. elegans DCT-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
2K08D9.4K08D9.4n/achrV 3,199,601contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase)
3skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
4nhr-63C06C6.4n/achrV 16,003,610C. elegans NHR-63 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5F38B2.2F38B2.2n/achrX 11,278,957contains similarity to Pneumocystis carinii DNA-directed RNA polymerase III (EC 2.7.7.6) (Fragment).; TR:Q06358
6gst-40F56B3.10n/achrIV 761,476C. elegans GST-40 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
7ins-26ZC334.1n/achrI 14,037,463ins-26 encodes an insulin-like peptide.
8K08C7.4K08C7.4n/achrIV 10,679,875contains similarity to Bos taurus Cylicin-2 (Cylicin II) (Multiple-band polypeptide II).; SW:Q28092
9R13A5.9R13A5.9n/achrIII 7,577,267contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
10gst-33C02A12.1n/achrV 3,468,009C. elegans GST-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
11F13A2.4F13A2.4n/achrV 4,399,097
12F46B6.9F46B6.9n/achrV 9,797,511contains similarity to Candida albicans Probable ferric reductase transmembrane component (EC 1.16.1.7)s(Ferric-chelate reductase).; SW:FREL_CANAL
13C28C12.4C28C12.4n/achrIV 8,487,897contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
14nas-25F46C5.3n/achrII 8,827,065nas-25 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-25::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx and pharyngeal-intestinal valve.
15nhr-7F54D1.4n/achrIV 11,267,544C. elegans NHR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
16F37H8.3F37H8.3n/achrII 11,182,323contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR011945 (Predicted HAD-superfamily phosphatase, subfamily IA/Epoxide hydrolase, N-terminal), IPR006402 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
17nhr-120C25B8.6n/achrX 6,638,552C. elegans NHR-120 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18cho-1C48D1.3n/achrIV 13,212,115cho-1 encodes a high-affinity choline transporter orthologous to members of the sodium-dependent glucose transporter family; CHO-1 is expressed in cholinergic neurons.
19D1005.3D1005.3n/achrX 1,453,357contains similarity to Pfam domain PF07716 Basic region leucine zipper contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
20ptr-5C53C11.3n/achrX 17,322,508ptr-5 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-5 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; PTR-5 is also required for normal growth to full size and locomotion; PTR-5 is expressed in head and tail neurons, and in ventral nerve cord.
21T05H10.3T05H10.3n/achrII 8,049,736
22cpt-6W01A11.5n/achrV 6,491,977C. elegans CPT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00755 Choline/Carnitine o-acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR000542 (Acyltransferase ChoActase/COT/CPT)
23M79.2M79.2n/achrX 10,628,258contains similarity to Homo sapiens 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase theta; ENSEMBL:ENSP00000264409
24K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
25F34D10.6F34D10.6n/achrIII 3,756,086contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
26F35H12.1F35H12.1n/achrX 936,580contains similarity to Interpro domain IPR015649 (Schwannomin interacting protein 1)
27ztf-2F13G3.1n/achrI 7,292,255C. elegans ZTF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR013993 (Zinc finger, N-recognin, metazoa), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
28glb-3C06H2.5n/achrV 11,139,410glb-3 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
29M04G7.1M04G7.1n/achrIV 456,400contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000877 (Proteinase inhibitor I12, Bowman-Birk), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
30mec-18C52B9.9n/achrX 4,272,688mec-18 encodes a protein similar to firefly luciferase and plant protein 4-coumarate coA ligase; mec-18 is involved in sensory mechanotransduction; genetic interactions with other mec genes suggest that mec-18 may be involved in negative regulation of the degenerin channel in the touch receptor neurons; mec-18 is expressed exclusively in the touch cells.
31C31B8.7C31B8.7n/achrV 2,901,878contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
32F15A2.7F15A2.7n/achrX 13,489,900contains similarity to Xanthomonas campestris Exodeoxyribonuclease V beta chain.; TR:Q8P379
33ndx-1T26E3.2n/achrI 12,680,484The ndx-1 gene encodes a NUDIX hydrolase.
34daf-14F01G10.8n/achrIV 10,254,701daf-14 encodes a Smad-related protein that is unusual in that while its C-terminus is well-conserved with Smad proteins, it lacks the N-terminal DNA binding domain found in all other known Smads; DAF-14 is predicted to function as a transducer of the DAF-7/TGF-beta-mediated signal that promotes reproductive growth and negatively regulates dauer formation; as reduction of daf-14 function enhances the dauer constitutive phenotype of daf-8 mutants, and overexpression of daf-14 can rescue daf-8 mutant animals, it is likely that the DAF-14 and DAF-8 Smad proteins function in parallel to control dauer formation; further genetic analyses suggest that DAF-14 and DAF-8 function to antagonize the activities of the DAF-3 Smad and DAF-5 Sno/Ski oncoprotein, which are required for dauer formation; a DAF-14::GFP reporter is expressed in a dynamic pattern in tissues, such as the hypodermis, intestine, and pharynx, that are remodeled during dauer development.
35Y38H6C.20Y38H6C.20n/achrV 20,544,616contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
36dod-6T20G5.7n/achrIII 10,197,925C. elegans DOD-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
37unc-41C27H6.1n/achrV 9,971,233unc-41 encodes an ortholog of Drosophila STONED A (STNA) required for normal locomotion; a beta-strand in the mu-adaptin-like domain of UNC-41 binds the C2A domain of SNT-1, and this binding is required for SNT-1 endocytosis, punctate localization of UNC-41 in neurons, and transgenic rescue of unc-41(e268) animals; UNC-41 is also required for normal secretion of EGL-17 from P6.p cells, and for embryonic viability; UNC-41 is expressed in the larval and adult nervous system; UNC-41, like other stonins, is an adaptin, and by orthology with stonins is predicted to be a protein adaptor that helps sort SNT-1 endocytotically.
38F35B12.4F35B12.4n/achrV 11,609,661contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
39K08E7.6K08E7.6n/achrIV 12,580,060contains similarity to Aquifex aeolicus Probable DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:RA50_AQUAE
40inx-12ZK770.3n/achrI 3,757,299inx-12 (innexin=invertebrate connexin analogue) encodes a protein of the innexin family; innexins are gap junction proteins similar in function, though dissimilar in sequence to the vertebrate connexins; innexins are the only known gap junction proteins in invertebrates; inx-12 and inx-13 appear to be a tandom duplication; RNA interference of inx-12 results in an arrest at the L1 larval stage with fluid filled dead rods; this phenotype and sequence homology to Drosophila innexins suggest that INX-12 may be required to form gap junctions between the excretory canal and hypodermis, thus playing an essential role in osmoregulation; an INX-12::GFP fusion protein is expressed in the excretory canal.
41C01G10.5C01G10.5n/achrV 15,089,276contains similarity to Homo sapiens Glycine/tyrosine-rich protein; ENSEMBL:ENSP00000335001
42K03B8.6K03B8.6n/achrV 11,408,332contains similarity to Interpro domain IPR000585 (Hemopexin)
43F38B6.1F38B6.1n/achrX 6,700,523
44T03F1.11T03F1.11n/achrI 3,854,039contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
45F28A12.3F28A12.3n/achrV 8,641,003
46DC2.5DC2.5n/achrV 211,433contains similarity to Pfam domain PF00439 Bromodomain contains similarity to Interpro domain IPR001487 (Bromodomain)
47R08F11.4R08F11.4n/achrV 3,804,678contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
48B0205.4B0205.4n/achrI 10,742,929The B0205.4 gene encodes a homolog of the human gene FUT1, which when mutated leads to leukocyte adhesion deficiency, type II (OMIM:266265).
49Y106G6G.2Y106G6G.2n/achrI 10,325,764contains similarity to Interpro domain IPR000904 (SEC7-like)
50ceh-6K02B12.1n/achrI 8,500,257ceh-6 encodes a POU family homeodomain protein, homologous to human POU3F4 (OMIM:304400, mutated in conductive deafness 3) that affects embryonic viability, locomotion, and molting, and that regulates ectodermal and excretory function; CEH-6 is expressed dynamically during development and expression includes neurons, the excretory cell, and ectodermal cells.