UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-247C31B8.130chrV 2,933,658C. elegans SRH-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2fbxa-157C06H5.2n/achrV 17,900,819This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
3unc-8R13A1.4n/achrIV 7,200,978unc-8 encodes an amiloride-sensitive DEG/ENaC cation-selective channel subunit orthologous to human ENaCB (OMIM:600760, associated with Liddle syndrome, an autosomal dominant form of hypertension); UNC-8 is predicted to function as part of a mechanically gated channel that responds to stretch, and is required for modulating the sinusoidal body wave that is characteristic of C. elegans locomotion; unc-8 interacts genetically with unc-1 and unc-24, which encode stomatin-like proteins, and with mec-6, which encodes a paraoxonase; UNC-8 is expressed in motor neurons, sensory neurons, and interneurons in the nerve ring; UNC-8 may form a channel with the degenerin DEL-1, with which it is coexpressed in ventral cord motor neurons.
4Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
5W04G3.7W04G3.7n/achrX 11,084,822contains similarity to Interpro domain IPR001211 (Phospholipase A2)
6tmbi-4B0563.4n/achrX 9,155,606C. elegans TMBI-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01027 Uncharacterised protein family UPF0005 contains similarity to Interpro domain IPR006214 (Protein of unknown function UPF0005)
7H20E11.2H20E11.2n/achrIV 6,828,617contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal), IPR003366 (CUB-like region)
8B0379.2B0379.2n/achrI 10,071,342contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Possible role for UBP3 in controlling the activity or assembly of the SIR protein complex.; SGD:YER151C
9str-205C02E7.9n/achrV 4,929,096C. elegans STR-205 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10Y40H7A.3Y40H7A.3n/achrIV 15,162,987contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
11C32A9.1C32A9.1n/achrX 10,259,366contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein, conserved.; TR:Q8IEA2
12F48G7.4F48G7.4n/achrV 620,860
13T16G12.4T16G12.4n/achrIII 10,058,154contains similarity to Treponema denticola FlhB.; TR:Q9APY7
14W03C9.1W03C9.1n/achrII 11,961,452contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
15srab-13F59A7.3n/achrV 2,026,295C. elegans SRAB-13 protein ;
16T08G5.9T08G5.9n/achrV 14,045,861contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
17C33H5.1C33H5.1n/achrIV 7,809,904contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
18F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
19M02G9.3M02G9.3n/achrII 10,319,023contains similarity to Pfam domain PF02363 Cysteine rich repeat contains similarity to Interpro domains IPR003341 (Cysteine rich repeat, tripleX), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
20srt-13ZC142.1n/achrV 4,249,044C. elegans SRT-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000539 (Frizzled protein)
21his-68T23D8.6n/achrI 9,989,347his-68 encodes an H2A histone.
22K09B11.3K09B11.3n/achrIV 13,430,380contains similarity to Homo sapiens DJ614O4.3; ENSEMBL:ENSP00000305301
23Y43F8B.13Y43F8B.13n/achrV 19,459,852contains similarity to Puumala virus Nucleocapsid protein (Fragment).; TR:Q8B3A4
24srb-18C54F6.7n/achrV 7,516,266C. elegans SRB-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
25srz-74K03D3.1n/achrIV 16,330,219C. elegans SRZ-74 protein ;
26srh-72ZC204.50.0000000000002chrII 1,639,907C. elegans SRH-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27npp-7T19B4.2n/achrI 5,694,480C. elegans NPP-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001876 (Zinc finger, RanBP2-type)
28nhr-178F16B4.9n/achrV 1,605,896C. elegans NHR-178 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
29ZK669.2ZK669.2n/achrII 7,937,580contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
30F38A1.13F38A1.13n/achrIV 1,265,538
31R07E5.15R07E5.15n/achrIII 4,401,952
32Y49G5B.1Y49G5B.1n/achrV 5,228,330contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
33srj-21F28H7.11n/achrV 10,745,530C. elegans SRJ-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34F53A2.9F53A2.9n/achrIII 13,357,930contains similarity to Pfam domain PF00646 (F-box domain)
35K01A12.3K01A12.3n/achrX 8,622,819contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36W04G5.5W04G5.5n/achrI 11,635,717contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
37D1065.1D1065.1n/achrV 4,075,636contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
38Y39A1A.17Y39A1A.17n/achrIII 10,688,996contains similarity to Interpro domain IPR001611 (Leucine-rich repeat)
39C29E6.4C29E6.4n/achrIV 11,881,077contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
40clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
41C14E2.5C14E2.5n/achrX 1,824,473
42unc-120D1081.2n/achrI 8,461,612unc-120 encodes a member of the MADS-box family of transcription factors that is most closely related to Drosophila blistered and the vertebrate serum response factors (SRFs); UNC-120 is required for locomotion and muscle development and for formation of the normal number of muscle A and I bands; UNC-120 is also required for maintaining wild-type expression levels of the muscle components actin and myosin; UNC-120 is first expressed in the early embryo in body wall muscle precursors and later is expressed in both body wall and vulval muscles.
43sru-16Y45F10B.4n/achrIV 13,581,181C. elegans SRU-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
44srh-40Y40D12A.35.999999999999999e-20chrIII 6,611,482C. elegans SRH-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45srh-82W03F9.63e-28chrV 146,062C. elegans SRH-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46srh-118K03D7.61e-18chrV 17,495,205C. elegans SRH-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47K09E3.1K09E3.1n/achrX 17,126,661
48C29F9.8C29F9.8n/achrIII 96,559
49srx-16T07H8.1n/achrV 6,976,849C. elegans SRX-16 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50C52D10.3C52D10.3n/achrIV 17,179,526contains similarity to Pelobacter propionicus DSM 2379 Hypothetical protein precursor.; TR:Q3FZT0