UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C30E1.6C30E1.61e-142chrX 16,916,238
2D1046.5D1046.5n/achrIV 8,960,986contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Integral membrane protein GPR175; ENSEMBL:ENSP00000347748
3F38A1.11F38A1.11n/achrIV 1,248,205contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
4F45E6.1F45E6.1n/achrX 12,476,473contains similarity to Interpro domain IPR005829 (Sugar transporter, conserved site)
5C54E10.2C54E10.2n/achrV 18,829,031contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
6C04A11.1C04A11.1n/achrX 13,661,662contains similarity to Sorghum bicolor Extensin precursor (Proline-rich glycoprotein).; SW:EXTN_SORBI
7C44F1.1C44F1.1n/achrIII 3,761,814contains similarity to Interpro domain IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding)
8skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
9C01H6.3C01H6.3n/achrI 7,208,985contains similarity to Pfam domain PF00096 (Zinc finger, C2H2 type)
10F13E9.8F13E9.8n/achrIV 10,893,972contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
11srx-67K07C6.10n/achrV 3,917,627C. elegans SRX-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
12F35C8.8F35C8.8n/achrX 5,373,263
13puf-9W06B11.2n/achrX 5,843,741The puf-9 gene encodes a predicted RNA binding protein orthologous to Drosophila PUMILIO and human PUMILIO 2 (OMIM:607205); PUF-9 is required for normal locomotion and fluid balance, and is expressed primarily in somatic tissues; PUF-9 contains a glutamine/asparagine-rich domain.
14F28E10.2F28E10.2n/achrIV 4,563,722contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
15F53F1.1F53F1.1n/achrV 13,405,004contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
16F28G4.3F28G4.3n/achrV 16,286,908contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
17ZK938.3ZK938.3n/achrII 9,832,928contains similarity to Pfam domain PF00612 IQ calmodulin-binding motif contains similarity to Interpro domain IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
18srsx-32F20A1.3n/achrV 7,018,087C. elegans SRSX-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
19kin-30M01B2.1n/achrV 15,246,214kin-30 encodes a predicted tyrosine kinase; kin-30 is expressed during larval stages, but has not been detected in adults; the expression of kin-30 was experimentally verified by RT-PCR.
20T20F7.5T20F7.5n/achrX 16,850,352contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
21egl-2F16B3.1n/achrV 1,294,353egl-2 encodes a voltage-gated potassium channel that affects egg laying, muscle activation, defecation, mechanosensation, and chemosensation; expressed in the intestinal muscle, AFD, ALN, AQR, ASE, AWC, BAG, IL2, PLN, PQR, and URX neurons as well as a subset of sensory neurons in the male tail.
22C07C7.1C07C7.1n/achrIV 9,184,575contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_0790.; TR:Q98RD0
23C39B10.5C39B10.5n/achrX 10,447,468contains similarity to Saccharomyces cerevisiae bZIP protein; transcription factor; SGD:YIR018W
24F02D10.2F02D10.2n/achrX 13,463,605contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I256
25T08G3.6T08G3.6n/achrV 16,446,543contains similarity to Interpro domain IPR008975 ()
26srt-9C50H11.5n/achrV 3,078,685C. elegans SRT-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
27nhr-96F44C8.11n/achrV 2,234,310nhr-96 encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain.
28clec-263F26F2.6n/achrV 20,571,518C. elegans CLEC-263 protein; contains similarity to Pfam domains PF08277 (PAN-like domain) (2), PF00024 (PAN domain) contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29F25E2.3F25E2.3n/achrX 812,150contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
30R03G8.3R03G8.3n/achrX 13,092,699contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
31R106.2R106.2n/achrX 17,484,993contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32nhr-195F59E11.10n/achrV 8,971,529C. elegans NHR-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
33ift-74C18H9.8n/achrII 6,681,205C. elegans IFT-74 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000694 (Proline-rich region)
34srbc-6C36C5.3n/achrV 3,170,772C. elegans SRBC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
35ZK892.6ZK892.6n/achrII 9,979,541contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Hypothetical protein.; TR:Q87PB2
36K07H8.5K07H8.5n/achrIV 8,272,091
37H10E21.4H10E21.4n/achrIII 18,471contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
38C25A1.12C25A1.12n/achrI 10,192,090contains similarity to Pfam domain PF00561 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase), IPR002410 (Peptidase S33, prolyl aminopeptidase)
39srh-252T19C9.3n/achrV 17,222,863C. elegans SRH-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
40C18A11.2C18A11.2n/achrX 8,067,797
41Y17D7C.2Y17D7C.2n/achrV 18,717,931contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
42srh-182ZK228.5n/achrV 18,472,715C. elegans SRH-182 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43gst-25F37F2.3n/achrI 1,452,100C. elegans GST-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003082 (Glutathione S-transferase, Pi class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
44mif-1Y56A3A.3n/achrIII 11,848,712C. elegans MIF-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01187 Macrophage migration inhibitory factor (MIF) contains similarity to Interpro domains IPR014347 (Tautomerase), IPR001398 (Macrophage migration inhibitory factor)
45M04C9.4M04C9.4n/achrI 9,356,115contains similarity to Bos taurus Osteopontin precursor (Bone sialoprotein 1).; SW:OSTP_BOVIN
46glb-8C26C6.7n/achrI 7,510,602glb-8 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays; glb-8 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background; glb-8 expression is downregulated in a daf-2(e1370) mutant background under normoxic conditions; glb-8 expression is lower in L3 larvae than in young adults or dauers.
47ceh-23ZK652.5n/achrIII 7,840,469The ceh-23 gene encodes a homeodomain protein required for a specific differentiated trait of the thermosensory interneuron AIY.
48sra-6AH6.10n/achrII 9,549,075sra-6 encodes a seven-transmembrane chemosensory receptor; an sra-6::GFP fusion reporter is expressed in the ASH (strongly) and ASI (weakly) amphid sensory neurons, the PVQ interneurons, and in the SPD and SPV male spicule neurons; sra-6 expression in the ASH neurons is positively regulated by KIN-29, a serine/threonine kinase, acting through the HDA-4 class II histone deacetylase and the MEF-2 MADS domain transcription factor; in addition, maintenance of sra-6::gfp expression in the ASH and ASI requires activity of the DAF-7/TGF-beta signaling pathway.
49F45C12.3F45C12.3n/achrII 1,731,227contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
50srw-24C41G6.7n/achrV 15,224,639C. elegans SRW-24 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)