UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1snb-5C30A5.52e-53chrIII 8,204,022snb-5 encodes a predicted synaptobrevin.
2C47E12.10C47E12.10n/achrIV 9,973,388contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR004296 (Protein of unknown function DUF236)
3Y69E1A.3Y69E1A.3n/achrIV 10,953,548contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
4T01B6.4T01B6.4n/achrX 2,337,975
5F23C8.7F23C8.7n/achrI 2,423,740contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
6clec-134W10G11.11n/achrII 3,580,752C. elegans CLEC-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
7T08H10.4T08H10.4n/achrV 4,480,975contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
8Y38F1A.7Y38F1A.7n/achrII 12,997,333contains similarity to Pseudomonas aeruginosa Probable periplasmic spermidine/putrescine-binding protein.; TR:Q9I3T4
9Y116A8C.37Y116A8C.37n/achrIV 17,130,526contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
10F57H12.5F57H12.5n/achrIV 7,968,487contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
11dct-9W03F11.3n/achrI 2,234,343C. elegans DCT-9 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
12F46A8.4F46A8.4n/achrI 11,241,589contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
13B0228.8B0228.8n/achrII 7,760,555
14Y66A7A.4Y66A7A.4n/achrIII 11,614,038
15F59A6.2F59A6.2n/achrII 5,015,006contains similarity to Homo sapiens High mobility group protein 1-like 10; ENSEMBL:ENSP00000215935
16fbxa-196T05H4.2n/achrV 6,449,403This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
17T20F5.5T20F5.5n/achrI 3,918,806contains similarity to Homo sapiens Isoform E of Proteoglycan-4 precursor; ENSEMBL:ENSP00000356454
18ZK849.5ZK849.5n/achrI 14,202,318contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
19cdc-25.4R05H5.2n/achrII 10,189,551a homolog of dual specificity phosphatase Cdc25.
20cyp-25A3C36A4.3n/achrIII 3,838,517C. elegans CYP-25A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
21Y113G7C.1Y113G7C.1n/achrV 20,316,312contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000217 (Tubulin), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
22clec-108Y26D4A.6n/achrI 13,081,794C. elegans CLEC-108 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
23K12H6.9K12H6.9n/achrII 2,824,679
24clec-104Y18D10A.10n/achrI 12,860,337C. elegans CLEC-104 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25F36H12.4F36H12.4n/achrIV 5,269,346
26F46F5.6F46F5.6n/achrII 814,673contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
27K04H8.3K04H8.3n/achrI 14,256,314contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Putative phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase/chorismatesmutase.; TR:Q8A0T7
28clec-233F21H7.4n/achrV 16,234,383C. elegans CLEC-233 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
30M162.7M162.7n/achrV 19,789,204contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
31tag-212T14D7.34e-46chrII 8,859,305C. elegans TAG-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domain IPR001388 (Synaptobrevin)
32F33D11.2F33D11.2n/achrI 5,848,329contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
33Y45F10B.3Y45F10B.3n/achrIV 13,593,732contains similarity to Saccharomyces cerevisiae N-terminal domain appears to be involved in cellular responsiveness to RAS.; SGD:YNL138W
34F20D6.1F20D6.1n/achrV 8,191,303contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
35spe-8F53G12.6n/achrI 119,489C. elegans SPE-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
36C44B9.2C44B9.2n/achrIII 10,876,618contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37Y69E1A.8Y69E1A.8n/achrIV 10,967,320contains similarity to Sulfolobus tokodaii Hypothetical protein ST0457.; TR:Q975F4
38F46F5.9F46F5.9n/achrII 822,679contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
39T22G5.1T22G5.1n/achrV 13,877,372contains similarity to Pfam domain PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family contains similarity to Interpro domain IPR004129 (Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)
40ZK930.4ZK930.4n/achrII 11,908,092contains similarity to Homo sapiens Similar to hypothetical protein FLJ20094; ENSEMBL:ENSP00000324274
41F44D12.8F44D12.8n/achrIV 10,024,253contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of MAP7 domain-containing protein 1; ENSEMBL:ENSP00000362244
42W02B3.7W02B3.7n/achrIII 691,490contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
43R09E10.2R09E10.2n/achrIV 10,317,896contains similarity to Pfam domain PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase)
44F36H12.14F36H12.14n/achrIV 5,263,576
45B0252.5B0252.5n/achrII 6,917,923
46R04B5.11R04B5.11n/achrV 10,090,998contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000248104
47F19H6.5F19H6.5n/achrX 12,364,231contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of O75143 Hypothetical protein KIAA0652; ENSEMBL:ENSP00000310321
48T09A12.1T09A12.1n/achrIV 8,245,495contains similarity to Xenopus laevis DNA topoisomerase 1 (EC 5.99.1.2) (DNA topoisomerase I).; SW:P41512
49R05A10.1R05A10.1n/achrIV 14,187,493
50srw-72F20E11.6n/achrV 17,467,788C. elegans SRW-72 protein ;