UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C28H8.8C28H8.82.0000000000000003e-175chrIII 5,887,890contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
2T27A1.1T27A1.1n/achrII 504,620
3ZC239.14ZC239.14n/achrII 3,221,697contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
4T04G9.1T04G9.1n/achrX 792,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region)
5ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
6T24D5.5T24D5.5n/achrX 12,599,103contains similarity to Plasmodium falciparum PfEMP1-like protein.; TR:Q8IC59
7fbxb-1T26H2.1n/achrV 19,240,953This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
8Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
9F28H7.4F28H7.4n/achrV 10,746,917contains similarity to Interpro domain IPR011893 (SelT/selW/selH selenoprotein)
10srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;
11srz-19F56D6.4n/achrIV 3,920,703C. elegans SRZ-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
124R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
13F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
14R05G6.1R05G6.1n/achrIV 7,539,920
15C06C6.7C06C6.7n/achrV 15,993,879contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
16cyp-29A4B0331.1n/achrV 9,656,299C. elegans CYP-29A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
17B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918
18F55A4.7F55A4.7n/achrX 1,037,733contains similarity to Pfam domain PF00402 Calponin family repeat contains similarity to Interpro domain IPR000557 (Calponin repeat)
19C49D10.7C49D10.7n/achrII 3,856,247contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
20srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21F46F5.1F46F5.1n/achrII 790,983
22T05A10.6T05A10.6n/achrX 10,793,737contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
23T19D7.7T19D7.7n/achrX 678,427contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
24str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25K06A9.2K06A9.2n/achrX 1,538,348This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
26F57A8.6F57A8.6n/achrV 10,072,890contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
27Y62H9A.13Y62H9A.13n/achrX 11,918,504contains similarity to Homo sapiens Hu-Claspin; ENSEMBL:ENSP00000251195
28fbxa-129F59A1.8n/achrV 17,656,084C. elegans FBXA-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
29clec-264F31D4.4n/achrV 20,844,595C. elegans CLEC-264 protein; contains similarity to Pfam domains PF01466 (Skp1 family, dimerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
30C23H4.6C23H4.6n/achrX 12,238,124contains similarity to Pfam domain PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR003395 (RecF/RecN/SMC protein, N-terminal)
31srz-103F14F8.4n/achrV 16,678,452C. elegans SRZ-103 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein)
32F35F10.12F35F10.12n/achrV 3,314,352contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
33set-11F34D6.4n/achrII 2,692,391set-11 encodes a putative histone H3 lysine-9 methyltransferase orthologous to human EHMT1 (OMIM:607001, mutated in 9q subtelomeric deletion syndrome) and EHMT2 (OMIM:604599); neither set-11(n4488) nor set-11(RNAi) have any obvious phenotypes.
34T20B6.1T20B6.1n/achrIII 2,898,031contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
35Y57G11C.23Y57G11C.23n/achrIV 14,858,495contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
36Y6E2A.7Y6E2A.7n/achrV 15,720,542contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ31980; ENSEMBL:ENSP00000285871
37srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38C07B5.3C07B5.3n/achrX 9,522,844
39srg-51Y40H7A.8n/achrIV 15,139,977C. elegans SRG-51 protein ;
40C17H12.6C17H12.6n/achrIV 6,821,899contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
41F22B3.7F22B3.7n/achrIV 11,418,098contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
42srj-50T03D3.2n/achrV 2,833,942C. elegans SRJ-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43srh-61T21B4.8n/achrII 12,515,614C. elegans SRH-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
44unc-4F26C11.2n/achrII 9,898,980The unc-4 gene encodes a paired-class homeodomain protein with homologs in Drosophila and vertebrates; UNC-4 is required for establishing the identity of the A class motor neurons DA and VA, and is thus required for movement, axon guidance, and synapse formation; UNC-4 is negatively regulated by VAB-7, and UNC-4 activity requires UNC-37; unc-4 is expressed in the A-type motor neurons, DA and VA, the six VC motor neurons that innervate the vulval muscles, and the three SAB motor neurons; unc-4 is also expressed in the pharyngeal I5 motor neuron and the AVF neurons in the retrovesicular ganglion.
45str-143C09H5.4n/achrV 8,068,920C. elegans STR-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46ZK177.3ZK177.3n/achrII 5,516,470contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
47C17C3.6C17C3.6n/achrII 5,550,261This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
48srbc-10C18B10.2n/achrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
49W01B6.5W01B6.5n/achrIV 10,077,459contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
50lgc-37ZC482.5n/achrIII 12,789,021ZC482.5 is orthologous to the human gene GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID A RECEPTOR GAMMA 2 (GABRG2; OMIM:137164), which when mutated leads to disease.