UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C26B9.2C26B9.22e-156chrX 5,341,141
2C10G8.2C10G8.2n/achrV 5,314,980contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
3Y18D10A.3Y18D10A.3n/achrI 12,812,894contains similarity to Pfam domain PF03853 YjeF-related protein N-terminus contains similarity to Interpro domain IPR004443 (YjeF-related protein, N-terminal)
4skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
5K02D10.2K02D10.2n/achrIII 8,770,897
6kcc-1R13A1.2n/achrIV 7,215,841C. elegans KCC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR000076 (K-Cl co-transporter), IPR004841 (Amino acid permease-associated region), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
7cyp-33C6F41B5.7n/achrV 2,248,474C. elegans CYP-33C6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
8T20H4.2T20H4.2n/achrIII 7,242,074contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
9Y57G11C.23Y57G11C.23n/achrIV 14,858,495contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
10ceh-6K02B12.1n/achrI 8,500,257ceh-6 encodes a POU family homeodomain protein, homologous to human POU3F4 (OMIM:304400, mutated in conductive deafness 3) that affects embryonic viability, locomotion, and molting, and that regulates ectodermal and excretory function; CEH-6 is expressed dynamically during development and expression includes neurons, the excretory cell, and ectodermal cells.
11srz-45Y6G8.1n/achrV 17,593,282C. elegans SRZ-45 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
12ptr-9F54G8.5n/achrIII 9,159,358ptr-9 encodes an ortholog of Drosophila and human PTCHD3, which defines one of seven paralogous families of sterol sensing domain (SSD) proteins; PTR-9 is required for normal development in mass RNAi assays.
13glb-23R13A1.8n/achrIV 7,218,772glb-23 encodes a globin; glb-23 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-23 has no obvious function in mass RNAi assays.
14K07D4.6K07D4.6n/achrII 4,017,758contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG31439-PA;; FLYBASE:CG31439
15gcy-33F57F5.2n/achrV 11,998,799gcy-33 encodes a soluble guanylyl cyclase; a gcy-33::GFP reporter is expressed in the ciliated BAG head sensory neurons.
16T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
17ZK418.6ZK418.6n/achrIII 7,076,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18T23G4.4T23G4.4n/achrIV 13,675,781contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
19R12H7.4R12H7.4n/achrX 13,217,956contains similarity to Homo sapiens similar to zinc-finger helicase; ENSEMBL:ENSP00000304137
20F40F12.4F40F12.4n/achrIII 9,895,687contains similarity to Interpro domain IPR000998 (MAM)
21F46F5.13F46F5.13n/achrII 803,511contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
22F25E5.7F25E5.7n/achrV 7,440,782contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
23F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
24F54D12.7F54D12.7n/achrII 1,383,599contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
25fbxa-141D1025.3n/achrX 14,512,622This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
26F11D5.5F11D5.5n/achrX 3,302,988contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
27fbxa-30ZC47.4n/achrIII 1,275,041This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
28T02E9.3T02E9.3n/achrV 11,364,314T02E9.3 encodes a homolog of human melatonin type 1b receptors, and more generally of mammalian dopamine and serotonin (5-HT) receptors; T02E9.3 is partly required for male tail curling, with T02E9.3(RNAi) animals showing reduced curling in exogenous 5-HT; T02E9.3 is required for full sensitivity to 5-HT, normal brood sizes, and pharyngeal pumping; T02E9.3 is expressed in head and tail neurons.
29ins-37F08G2.6n/achrII 13,835,294ins-37 encodes an insulin-like peptide.
30try-6F48A9.3n/achrI 6,586,594C. elegans TRY-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
31C10A4.1C10A4.1n/achrX 7,417,182contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
32R03H10.4R03H10.4n/achrII 4,168,021contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
33nex-4C37H5.1n/achrV 4,856,278nex-4 encodes a predicted annexin.
34W01A8.3W01A8.3n/achrI 7,066,580contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
35F46B6.9F46B6.9n/achrV 9,797,511contains similarity to Candida albicans Probable ferric reductase transmembrane component (EC 1.16.1.7)s(Ferric-chelate reductase).; SW:FREL_CANAL
36fbxa-96H03G16.4n/achrX 15,059,361This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37C34D4.14C34D4.14n/achrIV 7,139,438contains similarity to Pfam domains PF06701 (Mib_herc2) , PF07738 (Sad1 / UNC-like C-terminal) , PF02985 (HEAT repeat) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2), PF00632 (HECT-domain (ubiquitin-transferase)) contains similarity to Interpro domains IPR012919 (Sad1/UNC-like, C-terminal), IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR000569 (HECT), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR002110 (Ankyrin), IPR010606 (Mib-herc2), IPR016024 (Armadillo-type fold)
38ttr-11F46B3.3n/achrV 20,599,260C. elegans TTR-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
39H12D21.5H12D21.5n/achrV 14,894,419contains similarity to Interpro domains IPR001307 (Thiosulfate sulfurtransferase), IPR000463 (Cytosolic fatty-acid binding protein), IPR001763 (Rhodanese-like)
40R01H2.2R01H2.2n/achrIII 7,057,468contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
41C45G9.8C45G9.8n/achrIII 5,052,953
42T02G6.2T02G6.2n/achrI 11,801,906contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9C9Y9
43ZC404.7ZC404.7n/achrV 6,779,108
44T28D9.7T28D9.7n/achrII 6,478,174contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
45T09B4.3T09B4.3n/achrI 6,177,087
46C34F11.1C34F11.1n/achrII 5,213,423contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
47F15D3.4F15D3.4n/achrI 11,568,010contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
48R09D1.13R09D1.13n/achrII 9,444,567contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
49F36D1.6F36D1.6n/achrI 11,270,696contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
50ZK892.4ZK892.4n/achrII 10,007,287ZK892.4 is orthologous to the human gene ALPHA-METHYLACYL-CoA RACEMASE (AMACR; OMIM:604489), which when mutated leads to AMACR deficiency.