UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C25F9.8C25F9.80chrV 19,395,796contains similarity to Nicotiana glutinosa Ribonuclease NW.; TR:Q7XZV5
2clec-217F26D11.9n/achrV 7,958,038C. elegans CLEC-217 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
3F47C12.8F47C12.8n/achrIV 3,997,448contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
4Y39F10A.3Y39F10A.3n/achrII 782,448contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
5C46H11.6C46H11.6n/achrI 5,022,021contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
6C35E7.7C35E7.7n/achrI 10,814,340
7srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8T22B11.1T22B11.1n/achrIV 4,694,800
9F11F1.4F11F1.4n/achrIII 13,401,247contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
10C16C8.17C16C8.17n/achrII 3,441,631contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
11F58F9.6F58F9.6n/achrIV 6,236,744contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
12sfa-1Y116A8C.32n/achrIV 17,107,555Y116A8C.32 encodes an ortholog of splicing factor SF1, which enables 3' splice site recognition by binding U2AF65 and the intron branch site during splicing complex formation; Y116A8C.32 shares several domains with mammalian SF1 proteins (a U2AF65 binding domain, a hnRNP K homology domain, two RNA-binding zinc knuckles, and a proline-rich C-terminal domain), while also sharing a hydrophilic N-terminal domain (enriched for serine, arginine, lysine, and aspartate) with Drosophila but not mammalian SF1; Y116A8C.32's N-terminal domain resembles RS domains in other splicing proteins; Y116A8C.32 is required for embryonic viability, normally rapid growth, and proper body morphology.
13E02H9.9E02H9.9n/achrIII 2,467,742
14ubc-24F49E12.4n/achrII 8,406,159ubc-24 encodes a predicted conjugating enzyme (UBCs/E2s) of the ubiquitin-conjugation system.
15Y43F8C.15Y43F8C.15n/achrV 19,705,582
16nhr-225T27B7.2n/achrV 2,289,169C. elegans NHR-225 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17F32B6.4F32B6.4n/achrIV 9,891,311contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Mus musculus (Mouse). 13 days embryo male testis cDNA,sRIKEN full-length enriched library, clone:6030407P11 product:NIMAs(Never in mitosis gene a)-related expressed kinase 1, full insertssequence.; TR:Q86I06
18C05B5.1C05B5.1n/achrIII 9,987,900contains similarity to Clostridium acetobutylicum Membrane associated chemotaxis sensory transducer protein (MSPsdomain and HAMP domain).; TR:Q97JD4
19clec-135C16A11.8n/achrII 4,257,930C. elegans CLEC-135 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
20F32B6.10F32B6.10n/achrIV 9,888,531contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
21srh-166Y38H6C.12n/achrV 20,520,671C. elegans SRH-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22clec-130W10G11.14n/achrII 3,574,098C. elegans CLEC-130 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
23srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24clc-4T05A10.2n/achrX 10,783,378clc-4 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; CLC-4 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
25F59B2.12F59B2.12n/achrIII 9,019,194contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
26klp-17W02B12.7n/achrII 11,466,706klp-17 encodes a C-terminal kinesin motor protein orthologous to Drosophila NCD and Saccharomyces cerevisiae KAR3; by homology, KLP-17 is predicted to function as a minus-end directed motor; loss of klp-17 activity via RNAi results in embryonic lethality generally at the one- or two-cell stage with disorganized mitotic spindles and polyploid nuclei, suggesting that KLP-17 plays a role in chromosome segregation and germline development; in situ hybridization studies reveal that klp-17 mRNA is localized specifically to cell nuclei during early development, from the one-cell stage of embryogenesis until early larval stages; a klp-17::gfp transgene did not yield detectable GFP expression, but did result in a small percentage of morphologically abnormal males and intersexual animals that grew slowly and died upon reaching maturity, consistent with a role for klp-17 in chromosome dynamics.
27AC7.3AC7.3n/achrIV 5,112,248
28cwp-1C37H5.10n/achrV 4,840,930cwp-1 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
29F16G10.3F16G10.3n/achrII 2,373,286contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
30C07E3.4C07E3.4n/achrII 10,361,814contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
31str-162E03H12.1n/achrIV 4,993,123C. elegans STR-162 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32F25C8.1F25C8.1n/achrV 20,903,971contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
33clec-99ZK39.8n/achrI 11,157,780C. elegans CLEC-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34fbxa-99F36G9.14n/achrV 15,982,244This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
35ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
36M28.9M28.9n/achrII 10,641,581contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000024599
37F53C3.1F53C3.1n/achrII 3,912,702contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
39F20A1.8F20A1.8n/achrV 7,047,347
40T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
41H32C10.1H32C10.1n/achrIV 5,935,928contains similarity to Interpro domains IPR006353 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, CECR5), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA)
42F28A10.9F28A10.9n/achrII 834,544contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
43F44D12.8F44D12.8n/achrIV 10,024,253contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of MAP7 domain-containing protein 1; ENSEMBL:ENSP00000362244
44clec-108Y26D4A.6n/achrI 13,081,794C. elegans CLEC-108 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
45B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
46C24D10.1C24D10.1n/achrIV 5,167,373contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
47ace-1W09B12.1n/achrX 16,370,244ace-1 encodes a class A acetylcholinesterase that functions redundantly with ACE-2 with respect to total class A acetylcholinesterase activity, and that genetically interacts with ace-2 and ace-3; ace-1 is expressed in the body wall muscle, sphincter muscle, head neurons, a few pharyngeal muscle cells, and the diagonal and spicule muscles of the male.
48B0432.11B0432.11n/achrII 294,279contains similarity to Interpro domain IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding)
49W02B3.7W02B3.7n/achrIII 691,490contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
50C49C8.6C49C8.6n/achrIV 8,657,801contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)