UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C25E10.11C25E10.114.0000000000000004e-60chrV 9,057,966
2T11F9.14T11F9.14n/achrV 11,480,742contains similarity to Oryctolagus cuniculus Troponin I, fast skeletal muscle (Troponin I, fast-twitch isoform).; SW:TRIF_RABIT
3F14H8.4F14H8.4n/achrV 15,024,402contains similarity to Clostridium acetobutylicum Protein containing a domain related to multimeric flavodoxin WrbAsfamily.; TR:Q97H25
4K02F6.8K02F6.8n/achrII 2,533,862contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
5C50E3.9C50E3.9n/achrV 7,599,821contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
6F41H8.2F41H8.2n/achrV 827,588contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7F15A8.1F15A8.1n/achrX 4,441,526
8F35C5.11F35C5.11n/achrII 12,909,598contains similarity to Mus musculus Lymphocyte antigen Ly-6D precursor (Thymocyte B cell antigen) (ThB).; SW:LY6D_MOUSE
9T17A3.10T17A3.10n/achrIII 155,573contains similarity to Interpro domain IPR007110 (Immunoglobulin-like)
10Y62H9A.14Y62H9A.14n/achrX 11,922,107contains similarity to Interpro domain IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
11ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
12nhr-220T19H12.8n/achrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13srw-91K04F1.4n/achrV 1,680,088C. elegans SRW-91 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
14B0310.3B0310.3n/achrX 512,692
15R04E5.7R04E5.7n/achrX 8,797,318
16C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
17npr-3C10C6.2n/achrIV 11,461,555C10C6.2 encodes a G-protein-coupled receptor for the FMRFamide-related peptides (FaRPs) encoded by flp-15; C10C6.2 is primarily coupled to Gi/Go proteins, since C10C6.2 signalling is blocked by pertussis toxin; because of its link to Gi/Go proteins, C10C6.2 is expected to be inhibitory
18C46C2.3C46C2.3n/achrIV 9,226,726contains similarity to Tropheryma whipplei DNA repair protein RecN.; TR:Q83NU4
19F35E2.1F35E2.1n/achrI 11,739,734contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
20Y38H6C.17Y38H6C.17n/achrV 20,537,681Y38H6C.17 encodes a putative amino acid transporter that inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51; Y38H6C.17 has 11 predicted transmembrane alpha-helices; Y38H6C.17 has multiple C. elegans paralogs and non-nematode orthologs, including budding yeast AVT3 and AVT4 and human SLC36A1 (OMIM:606561).
21F45E6.3F45E6.3n/achrX 12,488,021contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
22T21B6.4T21B6.4n/achrX 10,934,829contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
23F32B4.5F32B4.5n/achrI 11,519,244contains similarity to Homo sapiens BTB/POZ domain-containing protein KCTD16; ENSEMBL:ENSP00000329906
24ZK353.5ZK353.5n/achrIII 8,394,543
25srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
26C08F11.2C08F11.2n/achrIV 13,622,516contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Hypothetical protein MTH421.; SW:Y421_METTH
27R160.4R160.4n/achrX 4,367,984
28C03D6.1C03D6.1n/achrI 9,669,662contains similarity to Canine parvovirus Coat protein VP1 [Contains: Coat protein VP2].; SW:COAT_PAVC7
29T05B9.2T05B9.2n/achrII 11,257,607contains similarity to Rattus norvegicus Fibrillin-2.; TR:Q9WUH9
30F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
31F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
32srt-14ZC142.2n/achrV 4,255,024C. elegans SRT-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
33srx-136F09F3.12n/achrV 13,858,174C. elegans SRX-136 protein ;
34srb-16F58A6.6n/achrII 5,149,697C. elegans SRB-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
35F20E11.5F20E11.5n/achrV 17,461,590contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
36F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
37nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38srsx-39M01B2.9n/achrV 15,255,926C. elegans SRSX-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39F45F2.1F45F2.1n/achrV 8,538,519contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
40F16G10.6F16G10.6n/achrII 2,377,526contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
41F53F1.6F53F1.6n/achrV 13,416,842contains similarity to Aeropyrum pernix Elongation factor 1-beta (EF-1-beta) (aEF-1beta).; SW:EF1B_AERPE
42Y38H6C.9Y38H6C.9n/achrV 20,516,299contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
43F10A3.11F10A3.11n/achrV 16,163,213contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
44clec-198C49C3.13n/achrIV 17,349,079C. elegans CLEC-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
45C06B3.1C06B3.1n/achrV 13,903,319contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46F42A9.9F42A9.9n/achrIV 8,638,434
47clec-143ZK673.9n/achrII 10,469,224C. elegans CLEC-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
48C03E10.1C03E10.1n/achrV 11,291,855contains similarity to Anopheles quadrimaculatus NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_ANOQU
49M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
50R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689