UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C24D10.2C24D10.23e-35chrIV 5,163,991contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
2gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
3T27E7.1T27E7.1n/achrIV 14,520,345contains similarity to Bos taurus Annexin A7 (Annexin VII) (Synexin) (Fragment).; SW:ANX7_BOVIN
4ssp-31ZK1225.6n/achrI 13,219,303C. elegans SSP-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
5Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
6Y37D8A.5Y37D8A.5n/achrIII 12,854,726contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
7W06D4.2W06D4.2n/achrI 9,057,051contains similarity to Pyrobaculum aerophilum PaREP2b.; TR:Q8ZWN7
8T16A9.5T16A9.5n/achrV 14,214,256contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
9ZC317.6ZC317.6n/achrV 5,467,199
10T23B3.5T23B3.5n/achrI 6,705,973contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
11T22B3.3T22B3.3n/achrIV 11,703,476contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
12R02D5.7R02D5.7n/achrV 14,480,818contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
13F36D1.4F36D1.4n/achrI 11,272,019contains similarity to Homo sapiens Splice isoform C-alpha of O95644 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 1; SW:O95644
14C45G9.4C45G9.4n/achrIII 5,063,224contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
15F07A5.2F07A5.2n/achrI 7,353,071contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Serine/arginine repetitive matrix protein 2; ENSEMBL:ENSP00000371738
16Y43F8C.3Y43F8C.3n/achrV 19,618,472contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
17K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
18rmd-3B0491.3n/achrII 11,338,942C. elegans RMD-3 protein ; contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54XR4
19F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
20K08C9.2K08C9.2n/achrI 11,487,661
21ssq-4T28H11.1n/achrIV 5,017,101C. elegans SSQ-4 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR013286 (Annexin, type VII)
22C54G4.3C54G4.3n/achrI 8,005,688contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, skeletal muscle, fetal; ENSEMBL:ENSP00000255381
23C18G1.9C18G1.9n/achrV 4,768,777contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
24rmd-4F36H12.11n/achrIV 5,256,341C. elegans RMD-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
25K05F1.9K05F1.9n/achrII 5,800,592contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
26ZK512.8ZK512.8n/achrIII 9,146,610contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CDC5 is dispensable for premeiotic DNA synthesis and recombination, but required for tripartite synaptonemal complexes, haploidization, and spores; SGD:YMR001C
27T05F1.5T05F1.5n/achrI 9,634,552contains similarity to Cyanidium caldarium Phycobilisome linker polypeptide (Anchor polypeptide) (PBS-anchorsprotein).; SW:APCE_CYACA
28F36A2.10F36A2.10n/achrI 8,819,797contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR005819 (Histone H5)
29F36A4.3F36A4.3n/achrIV 4,269,952contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
30K01H12.4K01H12.4n/achrIV 9,714,029contains similarity to Simian T-lymphotropic virus 1 Rex p27 protein (Fragment).; TR:O12387
31F36D3.4F36D3.4n/achrV 16,517,063contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
32F41G4.4F41G4.4n/achrX 16,830,293
33W09D6.4W09D6.4n/achrIII 11,079,964contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein MW2515.; TR:Q8NUN4
34Y57G11A.2Y57G11A.2n/achrIV 14,518,253contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
35ZK637.15ZK637.15n/achrIII 8,920,543contains similarity to Ureaplasma parvum Hypothetical membrane lipoprotein.; TR:Q9PQR8
36T28H11.7T28H11.7n/achrIV 5,015,779contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
37F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
38R13H9.6R13H9.6n/achrIV 5,067,998contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
39pph-2C29E6.3n/achrIV 11,876,957C. elegans PPH-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
40K06A5.2K06A5.2n/achrI 6,468,758contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
41C01G10.14C01G10.14n/achrV 15,105,627contains similarity to Pfam domain PF03147 Ferredoxin-fold anticodon binding domain contains similarity to Interpro domain IPR005121 (Phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, ferrodoxin-fold anticodon-binding)
42ZK637.12ZK637.12n/achrIII 8,924,673contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YDR545W
43C25D7.1C25D7.1n/achrV 15,036,540contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
44F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
45F21H7.5F21H7.5n/achrV 16,238,153contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
46C03C11.1C03C11.1n/achrI 10,015,075contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR002952 (Eggshell protein)
47F53B6.4F53B6.4n/achrI 8,948,016contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
48ZC262.1ZC262.1n/achrIII 8,341,087
49F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
50rmd-6R13H9.1n/achrIV 5,069,350C. elegans RMD-6 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)