UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C23F12.3C23F12.33e-89chrX 9,393,106
2Y75B8A.19Y75B8A.19n/achrIII 12,229,214contains similarity to Lactococcus lactis Signal peptidase I (EC 3.4.21.89).; TR:Q9CDG2
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4srx-63K07C6.6n/achrV 3,932,495C. elegans SRX-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
5srt-29C24B9.5n/achrV 2,718,264C. elegans SRT-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
6ZK430.5ZK430.5n/achrII 4,411,199contains similarity to Pfam domain PF03568 Peptidase family C50 contains similarity to Interpro domain IPR005314 (Peptidase C50, separase)
7lrp-2T21E3.3n/achrI 3,939,445C. elegans LRP-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF07974 (EGF-like domain) , PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) (14), PF00058 (Low-density lipoprotein receptor repeat class B) (7)contains similarity to Interpro domains IPR000033 (), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
8srx-101F40H7.4n/achrII 3,690,100C. elegans SRX-101 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
9T08H10.3T08H10.3n/achrV 4,472,476
10W02B3.3W02B3.3n/achrIII 668,260
11acy-2C10F3.3n/achrV 5,978,731acy-2 encodes an adenylyl cyclase; an intragenic deletion of acy-2 is lethal at the first larval stage of development; the terminal phenotype resembles that seen in loss-of-function gsa-1 mutants.
12F56A11.4F56A11.4n/achrIV 550,691contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13K09H11.4K09H11.4n/achrV 5,724,796contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
14Y16B4A.2Y16B4A.2n/achrX 14,766,829contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
15xbx-1F02D8.3n/achrV 14,981,466C. elegans XBX-1 protein ; contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1; ENSEMBL:ENSP00000260605
16C46H3.3C46H3.3n/achrX 1,228,487contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
17ocam-1T02B5.2n/achrV 14,167,452T02B5.2 encodes a protein with an OCAM domain, a nematode-specific motif conserved between T02B5.2 and two other nematode ONECUT homeobox proteins (CEH-21 and CEH-41); this gene is probably derived from a ONECUT gene that lost both tit cut domain and its homeodomain; T02B5.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
18str-16Y73C8A.1n/achrV 3,239,764C. elegans STR-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002091 (Aromatic amino acid permease)
19T02H6.3T02H6.3n/achrII 692,115
20ift-81F32A6.2n/achrX 5,302,501C. elegans IFT-81 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000533 (Tropomyosin)
21C14A6.3C14A6.3n/achrV 18,147,539contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
22srv-36F57G8.8n/achrV 16,324,110C. elegans SRV-36 protein ;
23C05D9.4C05D9.4n/achrX 1,108,239
24srt-16C50H11.11n/achrV 3,064,037C. elegans SRT-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25C17C3.13C17C3.13n/achrII 5,568,064
26clec-240F49H6.1n/achrV 17,011,082C. elegans CLEC-240 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27K03D10.3K03D10.3n/achrI 14,122,952The K03D10.3 gene encodes a MYST acetyltransferase orthologous to the Drosophila MALES-ABSENT-ON-THE-FIRST (MOF) and CG1894 proteins, the human MOF protein, and the S. cerevisiae SAS2 protein.
28C39D10.1C39D10.1n/achrX 7,906,986
29str-248C55A1.3n/achrV 15,628,858C. elegans STR-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30Y43F8C.6Y43F8C.6n/achrV 19,636,948contains similarity to Interpro domains IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR009057 (Homeodomain-like)
31F56C3.1F56C3.1n/achrX 1,387,200
32trxr-2ZK637.10n/achrIII 8,915,015C. elegans TRXR-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02852 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain) , PF07992 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF00070 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR012999 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I, active site), IPR004099 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation), IPR006338 (Thioredoxin and glutathione reductase selenoprotein), IPR016156 (FAD/NAD-linked reductase, dimerisation), IPR001327 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region), IPR000815 (Mercuric reductase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
33F53A3.1F53A3.1n/achrIII 1,941,574
34exc-9F20D12.5n/achrIV 7,940,302exc-9 encodes a LIM domain-containing protein; exc-9 activity is required for proper development and morphogenesis of the excretory cell canal.
35T04C10.3T04C10.3n/achrX 14,813,291contains similarity to Rattus norvegicus Myosin heavy chain, nonmuscle type A (Cellular myosin heavy chain,stype A) (Nonmuscle myosin heavy chain-A) (NMMHC-A).; SW:MYH9_RAT
36srw-39F19B2.3n/achrV 20,166,056C. elegans SRW-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domain IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
37fbxa-171C38D9.1n/achrV 17,564,573This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
38F59D12.1F59D12.1n/achrX 15,669,484contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39F56H6.9F56H6.9n/achrI 12,305,199contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
40srt-3F47D2.3n/achrV 4,259,059C. elegans SRT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41F53E10.3F53E10.3n/achrV 2,606,470
42C30E1.2C30E1.2n/achrX 16,927,410
43T16A1.5T16A1.5n/achrII 2,083,711
44srh-111F08E10.6n/achrV 17,484,578C. elegans SRH-111 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45C46G7.3C46G7.3n/achrIV 6,007,411contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
46srd-56E04F6.14n/achrII 7,202,553C. elegans SRD-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47W04B5.6W04B5.6n/achrIII 2,434,376
48clec-120F29A7.7n/achrII 2,756,519C. elegans CLEC-120 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
49viln-1C10H11.1n/achrI 4,753,615C. elegans VILN-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02209 Villin headpiece domain contains similarity to Interpro domains IPR007122 (Gelsolin), IPR003128 (Villin headpiece)
50pik-1K09B11.1n/achrIV 13,419,126The pik-1 gene encodes a pelle/IRAK kinase homolog that may be involved in apoptosis.