UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srg-7C18F10.82.9999999999999996e-176chrIII 6,267,278C. elegans SRG-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
2ZK1240.6ZK1240.6n/achrII 2,322,661contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
3srh-55T09F5.5n/achrV 15,154,261C. elegans SRH-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4M163.6M163.6n/achrX 14,463,353contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7SZA3
5T14G8.2T14G8.2n/achrX 12,858,701This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
6F58D12.1F58D12.1n/achrV 14,052,371contains similarity to White spot syndrome virus Wsv359 (WSSV418).; TR:Q8VAP2
7Y45F10D.10Y45F10D.10n/achrIV 13,786,277contains similarity to Pseudotylosurus angusticeps Recombination-activating protein 2 (Fragment).; TR:Q9DD51
8B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
9H35N09.2H35N09.2n/achrX 8,604,813
10sre-33W05H5.6n/achrII 12,453,974C. elegans SRE-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
11Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
12Y102A5D.1Y102A5D.1n/achrV 17,143,014
13srg-9T12A2.107e-32chrIII 6,256,061C. elegans SRG-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
14ZC190.9ZC190.9n/achrV 8,692,862
15W09G12.8W09G12.8n/achrIV 1,226,925contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
16srz-58F31E9.5n/achrV 17,318,799C. elegans SRZ-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
17str-89F59A1.4n/achrV 17,670,073C. elegans STR-89 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18srx-95F41G3.11n/achrII 6,753,887C. elegans SRX-95 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003915 (Polycystic kidney disease type 2 protein)
19ZK795.1ZK795.1n/achrIV 12,551,089contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
20R13.2R13.2n/achrIV 10,826,996contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
21clec-179C42D4.11n/achrIV 7,183,961C. elegans CLEC-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
22sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23nhr-155C14C6.4n/achrV 540,344C. elegans NHR-155 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
24clec-12T27F6.2n/achrI 12,477,625C. elegans CLEC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25F21G4.4F21G4.4n/achrX 9,898,328contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
26ZK177.9ZK177.9n/achrII 5,517,477
27srx-119F49C5.1n/achrII 12,528,893C. elegans SRX-119 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28C43H6.6C43H6.6n/achrX 2,397,074contains similarity to Pfam domains PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29srx-79C01G10.2n/achrV 15,098,590C. elegans SRX-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
30fbxb-108F08D12.6n/achrII 2,766,099This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
31srz-53Y102A5C.23n/achrV 16,977,768C. elegans SRZ-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32B0348.1B0348.1n/achrV 49,270contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
33F58E6.6F58E6.6n/achrV 9,752,440contains similarity to Monosiga brevicollis MBCTL1 (Fragment).; TR:Q7YZI0
34srx-22F31F4.3n/achrV 680,688C. elegans SRX-22 protein ;
35F33C8.2F33C8.2n/achrX 14,722,337contains similarity to Interpro domain IPR003382 (Flavoprotein)
36F59H6.6F59H6.6n/achrII 2,011,980contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
37Y54C5A.1Y54C5A.1n/achrII 4,140,997
38ZK1240.4ZK1240.4n/achrII 2,315,354
39Y116A8C.1Y116A8C.1n/achrIV 16,901,344contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
40F26F2.2F26F2.2n/achrV 20,559,052contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W
41sre-56C50E10.8n/achrII 12,326,444C. elegans SRE-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR002090 (Na+/H+ exchanger, isoform 6 (NHE6)), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42H01M10.2H01M10.2n/achrX 2,585,134contains similarity to Interpro domain IPR006220 (Anthranilate synthase component II/delta crystallin)
43F48A9.2F48A9.2n/achrI 6,593,082
44T11F9.13T11F9.13n/achrV 11,482,664contains similarity to Thermotoga maritima ATP-dependent CLP protease, ATPase subunit.; TR:Q9WY41
45C30E1.8C30E1.8n/achrX 16,917,982contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
46D1053.2D1053.2n/achrX 11,728,445contains similarity to Pfam domain PF08123 Histone methylation protein DOT1 contains similarity to Interpro domain IPR013110 (Histone methylation DOT1)
47C24H10.1C24H10.1n/achrX 5,073,103C24H10.1 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; C24H10.1 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; C24H10.1 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
48srd-21W06G6.3n/achrV 16,630,499C. elegans SRD-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49rap-2C25D7.7n/achrV 15,062,961rap-2 encodes a Ras-related GTPase that is most similar to the RAP2 members of the Ras GTPase superfamily; by homology, RAP-2 is predicted to function as a membrane-localized GTPase that likely plays a role in signal transduction; as animals homozygous for a rap-2 deletion mutation show no obvious abnormalities, the precise role of RAP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
50Y65A5A.1Y65A5A.1n/achrIV 16,399,303contains similarity to Interpro domain IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerization domain bHLH)