UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-125C18B10.86e-178chrV 7,476,227C. elegans SRH-125 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F27C8.5F27C8.5n/achrIV 9,591,134contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
4T05A7.3T05A7.3n/achrII 4,676,002contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
5srg-37K04C1.1n/achrX 14,234,536C. elegans SRG-37 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
6C33D9.8C33D9.8n/achrIV 8,784,995contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin)
7agr-1F41G3.12n/achrII 6,767,868agr-1 encodes a large (1396-residue) putative agrin, orthologous to human AGRIN (OMIM:103320), EGFLAM, and Q9NQ15; AGR-1 is expressed in buccal epithelium and deposited in pharyngeal basal epithelium; AGR-1 is also expressed in IL1 neurons, distal tip cells, and intestine; an AGR-1 fragment can cluster vertebrate dystroglycan in cell culture; agr-1(eg1770) mutations show no obvious phenotype, including levimasole resistance, and do not enhance other mutations perturbing acetylcholine signalling, the dystrophin-glycoprotein-complex, muscle cell differentiation, or the extracellular matrix.
8C08A9.3C08A9.3n/achrX 17,089,713contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
9ttr-55F56F4.2n/achrI 6,146,261C. elegans TTR-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
10T03D8.7T03D8.7n/achrV 20,811,735contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein ENSP00000381489; ENSEMBL:ENSP00000335483
11Y37D8A.16Y37D8A.16n/achrIII 12,916,800contains similarity to Cyanidioschyzon merolae Cytochrome C-type biogenesis protein CCMF.; TR:Q9ZZP7
12C04B4.5C04B4.5n/achrX 12,287,929contains similarity to Plasmodium falciparum Ring-infected erythrocyte surface antigen precursor.; TR:Q8I0U6
13srt-72C36C5.9n/achrV 3,148,851C. elegans SRT-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
14F14H12.2F14H12.2n/achrX 4,351,596
15Y57G11C.21Y57G11C.21n/achrIV 14,846,701contains similarity to Interpro domain IPR000358 (Ribonucleotide reductase)
16R12H7.4R12H7.4n/achrX 13,217,956contains similarity to Homo sapiens similar to zinc-finger helicase; ENSEMBL:ENSP00000304137
17srh-217Y113G7B.21e-31chrV 20,189,742C. elegans SRH-217 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18C17D12.5C17D12.5n/achrI 11,586,755contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like)
19nhr-169C54C8.1n/achrI 12,443,002C. elegans NHR-169 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
20nhr-194F59E11.8n/achrV 8,969,321C. elegans NHR-194 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
21F15D3.4F15D3.4n/achrI 11,568,010contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
22srd-58E04F6.13n/achrII 7,204,421C. elegans SRD-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23ift-74C18H9.8n/achrII 6,681,205C. elegans IFT-74 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000694 (Proline-rich region)
24F47B7.1F47B7.1n/achrX 3,788,259contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
25sru-27C38C3.2n/achrV 1,500,054C. elegans SRU-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
26F54C8.6F54C8.6n/achrIII 9,445,388contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAL7
27T23F1.5T23F1.5n/achrV 15,461,926contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
28R06C1.2R06C1.2n/achrI 11,920,861contains similarity to Pfam domain PF00348 Polyprenyl synthetase contains similarity to Interpro domains IPR000092 (Polyprenyl synthetase), IPR008949 (Terpenoid synthase)
29srg-67ZC317.4n/achrV 5,462,245C. elegans SRG-67 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
30F53G2.1F53G2.1n/achrII 2,492,698contains similarity to Interpro domain IPR001611 (Leucine-rich repeat)
31F14H8.5F14H8.5n/achrV 15,021,516contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q812W2
32clec-263F26F2.6n/achrV 20,571,518C. elegans CLEC-263 protein; contains similarity to Pfam domains PF08277 (PAN-like domain) (2), PF00024 (PAN domain) contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33F59H6.2F59H6.2n/achrII 2,021,048
34F22D3.4F22D3.4n/achrII 6,925,039
35srh-50C10G11.23e-17chrI 6,303,370C. elegans SRH-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36Y51A2B.5Y51A2B.5n/achrV 18,390,243contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
37fbxa-141D1025.3n/achrX 14,512,622This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
38stdh-1C06B3.4n/achrV 13,907,215stdh-1 encodes a putative steroid dehydrogenase required for normally short lifespan; STDH-1 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767 and STDH-2/-4; STDH-1 is expressed in larval intestine, and in both larval and adult body wall muscle and neurons.
39W03A5.1W03A5.1n/achrIII 5,410,601contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001452 (Src homology-3), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
40T25B6.3T25B6.3n/achrX 9,027,882
41R03D7.8R03D7.8n/achrII 10,955,158contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
42srd-60C13B7.3n/achrV 2,420,332C. elegans SRD-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F02D8.1F02D8.1n/achrV 14,975,819contains similarity to Rattus norvegicus P27 KIP1.; TR:O08769
44srh-142T08G3.39e-28chrV 16,460,149C. elegans SRH-142 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45srd-71C13B7.4n/achrV 2,424,746C. elegans SRD-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001614 (Myelin proteolipid protein PLP), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
46nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
47fbxb-85R17.1n/achrIII 10,848,088This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
48F18A12.6F18A12.6n/achrII 3,401,335F18A12.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.6 has no clear orthologs in other organisms.
49str-64T28A11.1n/achrV 3,283,924C. elegans STR-64 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50C54C8.3C54C8.3n/achrI 12,447,783contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)