UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srbc-10C18B10.28e-164chrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
2tkr-1C38C10.1n/achrIII 9,386,535tkr-1 encodes a G protein-coupled receptor that is the C. elegans tachykinin-like neuropeptide receptor homolog; by homology, TKR-1 is predicted to function in modulation of excitatory neurotransmission; as loss of tkr-1 activity via RNAi results in moderate reduction of fat content, TKR-1 may play a specific role in regulating lipid metabolism; a tkr-1 reporter gene fusion is reportedly expressed in the socket cells of the deirid and post-deirid sensilla from the L2 larval stage through adulthood.
3T20B6.1T20B6.1n/achrIII 2,898,031contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
4str-143C09H5.4n/achrV 8,068,920C. elegans STR-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5srg-51Y40H7A.8n/achrIV 15,139,977C. elegans SRG-51 protein ;
6srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7str-250C06B3.10n/achrV 13,919,315C. elegans STR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F42A6.2F42A6.2n/achrIV 3,341,612
9sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10C35E7.6C35E7.6n/achrI 10,818,223
11F28B1.2F28B1.2n/achrV 17,047,282contains similarity to Arabidopsis thaliana T12C22.10 protein.; TR:Q9LPE8
12srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;
13C16D6.1C16D6.1n/achrX 12,525,704contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
14srg-14F26B1.6n/achrI 6,313,673C. elegans SRG-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
15srz-103F14F8.4n/achrV 16,678,452C. elegans SRZ-103 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein)
16C43F9.5C43F9.5n/achrIV 10,590,044contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
17nhr-39F44A2.4n/achrV 9,303,947C. elegans NHR-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18F09C6.3F09C6.3n/achrV 16,879,465contains similarity to Saccharomyces cerevisiae DNA damage-responsive protein, expression is increased in response to heat-shock stress or treatments that produce DNA lesions; SGD:YMR173W
19tbx-33Y66A7A.8n/achrIII 11,635,769C. elegans TBX-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
20T16H12.9T16H12.9n/achrIII 10,110,649contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RNA polymerase I subunit A34.5; SGD:YJL148W
21clec-146Y48E1B.9n/achrII 13,592,126C. elegans CLEC-146 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
22C03C10.2C03C10.2n/achrIII 4,092,033contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
23C50D2.6C50D2.6n/achrII 86,096
24F55A4.7F55A4.7n/achrX 1,037,733contains similarity to Pfam domain PF00402 Calponin family repeat contains similarity to Interpro domain IPR000557 (Calponin repeat)
25cwp-5F48C11.2n/achrX 13,184,746C. elegans CWP-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26sro-1D1022.6n/achrII 7,461,799C. elegans SRO-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
27srj-50T03D3.2n/achrV 2,833,942C. elegans SRJ-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28lgc-31F21A3.7n/achrV 15,516,308C. elegans LGC-31 protein
29T04G9.1T04G9.1n/achrX 792,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region)
30fbxa-129F59A1.8n/achrV 17,656,084C. elegans FBXA-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
31T21E8.4T21E8.4n/achrX 10,882,602contains similarity to Rattus norvegicus Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase (EC 1.1.1.49) (G6PD).; SW:G6PD_RAT
324R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
33C18D1.2C18D1.2n/achrII 10,057,912contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
34ZK177.3ZK177.3n/achrII 5,516,470contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
35C17H12.6C17H12.6n/achrIV 6,821,899contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
36F53F4.2F53F4.2n/achrV 13,589,230contains similarity to Hordeum vulgare Glycine-rich cell wall structural protein precursor.; SW:P17816
37B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918
38C16D9.3C16D9.3n/achrV 8,239,232
39F55E10.2F55E10.2n/achrX 8,340,780
40ZC155.2ZC155.2n/achrIII 5,219,635contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR009072 (Histone-fold)
41str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42C45G9.11C45G9.11n/achrIII 5,066,320
43exp-1H35N03.1n/achrII 6,159,051exp-1 encodes an excitatory, cation-selective GABA receptor; EXP-1 activity is essential for the enteric muscle contractions that are the third in a series of three independent muscle contractions controlling defecation, and when expressed in Xenopus oocytes, EXP-1 is capable of forming a cation-selective GABA receptor; a rescuing EXP-1::GFP reporter fusion is expressed in the intestinal and anal depressor muscles, where it localizes to regions consistent with the positions of neuromuscular junctions; expression is also observed in neurons, including PDA, RID, ADE, and SABD.
44F07C3.2F07C3.2n/achrV 9,226,731
45Y18D10A.2Y18D10A.2n/achrI 12,808,033contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
46C14A6.7C14A6.7n/achrV 18,167,965contains similarity to Gallus gallus Stathmin 3 (SCG10-like protein) (Neuroplasticin-2).; SW:STN3_CHICK
47F08G12.5F08G12.5n/achrX 11,309,490contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
48T07D10.1T07D10.1n/achrI 12,604,999contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Katanin p80 subunit.; TR:O61585
49srb-17F01D4.7n/achrIV 10,455,510C. elegans SRB-17 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
50F35D2.4F35D2.4n/achrII 7,581,981contains similarity to Interpro domain IPR009030 (Growth factor, receptor)