UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C18A11.4C18A11.42.0000000000000002e-113chrX 8,046,427contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)
2C05D9.3C05D9.3n/achrX 1,114,346contains similarity to Pfam domain PF07974 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR002369 (Integrin beta subunit, N-terminal), IPR001169 (Integrin beta subunit, C-terminal), IPR015812 (Integrin beta subunit), IPR003659 (Plexin/semaphorin/integrin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4math-16C16C4.8n/achrII 1,878,171C. elegans MATH-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
5F19G12.3F19G12.3n/achrX 1,425,941contains similarity to Pfam domain PF02170 PAZ domain contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
6C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
7W06G6.12W06G6.12n/achrV 16,652,565contains similarity to Methanosarcina mazei Hypothetical protein MM2681.; TR:Q8PTN2
8clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
9K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
10srh-71T10D4.5n/achrII 3,124,197C. elegans SRH-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11F44F1.2F44F1.2n/achrI 13,253,455
12gcy-27C06A12.4n/achrIV 17,436,419C. elegans GCY-27 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
13B0432.1B0432.1n/achrII 298,462
14cnc-5R09B5.10n/achrV 1,445,607cnc-5 encodes one of six C. elegans caenacin peptides; CNC-5 is predicted to be a secreted protein that, based upon similarity to CNC-2, -4, and -6, may function as an antimicrobial peptide in the innate immune response.
15T23G5.3T23G5.3n/achrIII 9,230,130contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF00786 (P21-Rho-binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000095 (PAK-box/P21-Rho-binding), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
16R52.5R52.5n/achrII 2,109,416contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
17srh-48C06C3.6n/achrII 9,384,056C. elegans SRH-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18srz-96Y68A4A.6n/achrV 17,200,545C. elegans SRZ-96 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000418 (Ets)
19srbc-21C45H4.7n/achrV 2,156,083C. elegans SRBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001118 (Na+/H+ exchanger, isoform 3 (NHE3))
20srg-30W02F12.7n/achrV 6,717,559C. elegans SRG-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
21srw-26T05G11.3n/achrV 15,931,865C. elegans SRW-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
22K04H8.2K04H8.2n/achrI 14,254,220contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
23scl-21Y43F8B.5n/achrV 19,495,187C. elegans SCL-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
24F02E11.4F02E11.4n/achrII 3,276,774contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
25T26A5.4T26A5.4n/achrIII 6,461,112contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
26srh-272F37B4.4n/achrV 2,864,166C. elegans SRH-272 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27set-13K12H6.11n/achrII 2,818,048set-13 encodes a SET domain-containing protein; SET-13 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-6, SET-15, SET-19, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-13(n5012) nor set-13(RNAi) have any obvious phenotypes.
28F09F9.3F09F9.3n/achrX 4,120,310
29C18B2.2C18B2.2n/achrX 3,625,928contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
30srh-222F47C12.10n/achrIV 3,980,509C. elegans SRH-222 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31F02C12.4F02C12.4n/achrX 13,393,433contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
32sri-65F13A7.8n/achrV 16,387,488C. elegans SRI-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I)
33F21D9.8F21D9.8n/achrV 19,279,623contains similarity to Medicago truncatula Pectin methyl-esterase PER precursor (EC 3.1.1.11).; TR:Q9SC90
34Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
35F41E6.8F41E6.8n/achrV 8,600,475contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
36F36H12.17F36H12.17n/achrIV 5,277,187
37K07G5.3K07G5.3n/achrI 7,163,733contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
38srg-44F31E9.2n/achrV 17,329,671C. elegans SRG-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
39B0284.3B0284.3n/achrIII 4,380,175contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
40R155.4R155.4n/achrIII 1,978,876contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
41srh-233Y113G7A.1n/achrV 20,046,361C. elegans SRH-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42T19C3.6T19C3.6n/achrIII 629,578
43W06B3.1W06B3.1n/achrX 12,015,209contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR004821 (Cytidyltransferase-related), IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)
44srt-6R13D7.10n/achrV 7,408,161C. elegans SRT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
45srx-13C44B12.4n/achrIV 1,116,817C. elegans SRX-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46T06D4.2T06D4.2n/achrII 3,385,081
47B0034.5B0034.5n/achrII 5,973,873contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
48fip-5F41E7.4n/achrX 10,302,828C. elegans FIP-5 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000480 (Glutelin)
49R05A10.5R05A10.5n/achrIV 14,169,839contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
50C06C3.7C06C3.7n/achrII 9,385,835contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein that binds tRNA and methionyl- and glutamyl-tRNA synthetases (Mes1p and Ygl245wp), delivering tRNA to them, stimulating catalysis, and ensuring their localization to the cytoplasm; also binds quadruplex nucleic acids; SGD:YGL105W