UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C17H1.7C17H1.70chrI 13,137,541contains similarity to Plasmodium reichenowi Reticulocyte binding-like protein 2b.; TR:Q6YA79
2C48B4.8C48B4.8n/achrIII 9,560,470contains similarity to Bacillus subtilis Hypothetical protein ywcE precursor.; SW:YWCE_BACSU
3M18.3M18.3n/achrIV 12,107,094contains similarity to Pfam domain PF00733 Asparagine synthase contains similarity to Interpro domains IPR001962 (Asparagine synthase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold)
4C42C1.9C42C1.9n/achrIV 12,290,184contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
5R11G11.14R11G11.14n/achrV 522,961contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
6C49D10.4C49D10.4n/achrII 3,871,448contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
7nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
8nhr-231Y17D7B.1n/achrV 18,792,886C. elegans NHR-231 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9F19C7.3F19C7.3n/achrIV 4,598,308contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
10rab-10T23H2.5n/achrI 6,457,920rab-10 encodes a Rab-like GTPase that is a member of the Ras superfamily of small GTPases; rab-10 activity is required, upstream of rme-1, for basolateral endocytic recycling in the intestine, but not in oocytes or coelomocytes; a RAB-10::GFP fusion protein is widely expressed and in the intestine, localizes to endosomes and the Golgi.
11B0454.5B0454.5n/achrII 3,039,835contains similarity to Homo sapiens 21 kDa protein; VG:OTTHUMP00000165983
12C04G6.7C04G6.7n/achrII 5,101,080contains similarity to Interpro domains IPR006081 (Alpha defensin), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal), IPR001008 (Mollusc metallothionein, family 2)
13srx-65K07C6.8n/achrV 3,922,434C. elegans SRX-65 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
14math-30F52C6.5n/achrII 1,908,950C. elegans MATH-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
15ZK112.4ZK112.4n/achrIII 7,729,788
16F37B12.3F37B12.3n/achrII 9,040,539contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17F52H3.4F52H3.4n/achrII 10,041,733contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Protein gar2.; SW:P41891
18B0563.5B0563.5n/achrX 9,146,762
19Y54G9A.5Y54G9A.5n/achrII 13,723,894
20ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
21dhs-11Y39A1A.11n/achrIII 10,641,861dhs-11 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
22fbxa-193F59A1.9n/achrV 17,654,348C. elegans FBXA-193 protein; contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domains IPR001000 (Glycoside hydrolase, family 10), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
23F55G1.6F55G1.6n/achrIV 7,474,219contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
24C18E3.5C18E3.5n/achrI 4,198,275contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR001632 (G-protein, beta subunit), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
25puf-12ZK945.3n/achrII 10,101,606C. elegans PUF-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF08144 CPL (NUC119) domain contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR001313 (Pumilio RNA-binding region), IPR012959 (CPL), IPR016024 (Armadillo-type fold)
26E01G6.3E01G6.3n/achrX 12,243,099contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR002018 (Carboxylesterase, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
27C16C8.14C16C8.14n/achrII 3,450,118C16C8.14 encodes a Caenorhabditis-specific protein, with a central predicted coiled-coil and a C-terminal ubiqutin-like domain; C16C8.14 inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51; C16C8.14 is paralogous to C16C8.4, C16C8.11, C16C8.12, C16C8.13, C16C8.15, C16C8.16, and F54D10.7.
28C50F4.4C50F4.4n/achrV 9,537,163contains similarity to Streptomyces coelicolor Hypothetical protein SCO3733.; TR:Q9L0X1
29F15H10.7F15H10.7n/achrV 10,404,755contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
30K05C4.4K05C4.4n/achrI 14,736,077contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA1185; ENSEMBL:ENSP00000253061
31C49C3.7C49C3.7n/achrIV 17,333,023contains similarity to Homo sapiens Isoform Short of CAP-Gly domain-containing linker protein 1; ENSEMBL:ENSP00000355314
32F17A2.3F17A2.3n/achrX 12,308,161contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
33nth-1R10E4.5n/achrIII 4,292,462C. elegans NTH-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00633 (Helix-hairpin-helix motif) , PF00730 (HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein) contains similarity to Interpro domains IPR011257 (DNA glycosylase), IPR003651 (Iron-sulphur cluster loop), IPR000445 (Helix-hairpin-helix motif), IPR004035 (Endonuclease III, iron-sulphur binding, conserved site-1), IPR004036 (Endonuclease III, conserved site-2), IPR003265 (HhH-GPD)
34T27A3.6T27A3.6n/achrI 6,106,790T27A3.6 is orthologous to the human gene MOLYBDENUM COFACTOR BIOSYSTHESIS PROTEIN E (MOCS2; OMIM:603708), which when mutated leads to disease.
35ego-1F26A3.3n/achrI 7,653,372The ego-1 gene encodes a homolog of RNA-directed RNA polymerase that is essential for germ-line development.
36T08D2.4T08D2.4n/achrX 177,626contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
37str-228C07G3.5n/achrV 3,511,106C. elegans STR-228 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38F26F2.5F26F2.5n/achrV 20,569,246contains similarity to Homo sapiens zinc finger protein 318; ENSEMBL:ENSP00000302698
39srw-16T10H4.5n/achrV 15,274,096C. elegans SRW-16 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor)
40W05F2.6W05F2.6n/achrI 3,370,130contains similarity to Interpro domains IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1), IPR001620 (Dopamine D3 receptor)
41srd-19F53F1.11n/achrV 13,428,164C. elegans SRD-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42srw-127C33G8.1n/achrV 7,013,646C. elegans SRW-127 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
43ZK1127.3ZK1127.3n/achrII 7,055,637contains similarity to Pfam domain PF07904 CT20 family contains similarity to Interpro domain IPR012423 (CT20)
44srbc-70F30B5.6n/achrIV 4,227,430C. elegans SRBC-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45M01E5.1M01E5.1n/achrI 13,275,251contains similarity to Ichthyophthirius multifiliis Immobilization antigen isoform.; TR:Q9BMH3
46F28C6.1F28C6.1n/achrII 8,591,963F28C6.1 encodes an AP-2-like transcription factor that is ~60% identical to that of F28C6.2 which lies immediately adjacent to F28C6.1 on chromosome II; loss of F28C6.1 activity via large-scale RNAi experiments results in embryonic and larval lethality.
47srxa-4F18E3.1n/achrV 7,421,068C. elegans SRXA-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
48R10E8.2R10E8.2n/achrV 18,254,063contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
49C46A5.5C46A5.5n/achrIV 7,758,797
50K09E3.4K09E3.4n/achrX 17,119,682