UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C17F3.3C17F3.32e-25chrI 6,682,871contains similarity to Interpro domains IPR000956 (Stathmin), IPR005819 (Histone H5), IPR000533 (Tropomyosin), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
2C08H9.10C08H9.10n/achrII 9,854,672contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
3Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
4F02E9.3F02E9.3n/achrI 8,405,244contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein required for the decapping of mRNAs, functions to allow the production of active Dcp1p, contains a pyrophosphatase MutT motif and several alpha-helical leucine-rich motifs; SGD:YNL118C
5W03D8.5W03D8.5n/achrI 2,817,203contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
6F42C5.5F42C5.5n/achrIV 7,293,350contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
7ZK1225.4ZK1225.4n/achrI 13,215,147contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8EL91
8C15A11.2C15A11.2n/achrI 7,388,033contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CF92
9ZK1307.3ZK1307.3n/achrII 9,652,584contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
10C47E8.1C47E8.1n/achrV 14,666,582
11C25A8.2C25A8.2n/achrIV 7,010,276contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
12T05A7.6T05A7.6n/achrII 4,670,226contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
13F52F12.5F52F12.5n/achrI 9,921,559contains similarity to Homo sapiens Triadin; ENSEMBL:ENSP00000329278
14cyn-2ZK520.5n/achrIII 13,693,091cyn-2 is a predicted member of the cytosolic Cyclosporin A-binding cyclophilin family that is functional when expressed in E. coli.
15C38C3.8C38C3.8n/achrV 1,505,005contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
16K03H1.12K03H1.12n/achrIII 9,941,867contains similarity to Gallus gallus BDNF/NT-3 growth factors receptor precursor (EC 2.7.1.112) (TrkBstyrosine kinase) (Trk-B).; SW:TRKB_CHICK
17C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
18C38C3.3C38C3.3n/achrV 1,497,058
19F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
20C56C10.6C56C10.6n/achrII 6,580,455contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
21C47A4.3C47A4.3n/achrIV 13,741,621contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
22Y43F8A.2Y43F8A.2n/achrV 19,373,855contains similarity to Homo sapiens Cytokine receptor common beta chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000262825
23T08B6.4T08B6.4n/achrIV 4,907,072contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
24Y18D10A.21Y18D10A.21n/achrI 12,930,221contains similarity to Watermelon silver mottle virus L protein.; TR:Q9DSQ1
25ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
26R02F2.5R02F2.5n/achrIII 5,479,799contains similarity to Interpro domains IPR003267 (Small proline-rich), IPR000694 (Proline-rich region)
27fbxa-178F17A9.1n/achrV 6,116,834F17A9.1 encodes a divergent ONECUT class CUT homeobox protein with a single N-terminal cut domain; F17A9.1 has an atypical tyrosine residue at position 48 of its homeodomain rather than a phenylalanine or tryptophan residue; the cut domain may be a compact DNA-binding domain composed of alpha helices; phylogenetically, F17A9.1 is (somewhat distantly) affiliated with C17H12.9, Drosophila ONECUT, and mammalian HNF6 proteins; F17A9.1 has no obvious function in mass RNAi assays.
28clec-123Y25C1A.1n/achrII 3,115,497C. elegans CLEC-123 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
30T20F5.5T20F5.5n/achrI 3,918,806contains similarity to Homo sapiens Isoform E of Proteoglycan-4 precursor; ENSEMBL:ENSP00000356454
31F47B3.1F47B3.1n/achrI 3,972,934contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
32Y43F8C.3Y43F8C.3n/achrV 19,618,472contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
33C50D2.3C50D2.3n/achrII 106,848contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
34spe-11F48C1.7n/achrI 5,331,412spe-11 encodes a novel protein that is required for early embryonic development and for regulating the dynamic morphology of sperm pseudopods; although the precise biological role of SPE-11 is not yet known, SPE-11 is one of the few paternally provided proteins known to be essential for embryogenesis, and may constitute a sperm-associated factor required for oocyte activation; SPE-11 is first detected in the nuclei of primary spermatocytes and then remains tightly associated with sperm chromatin until fertilization at which point it appears to be degraded.
35ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
36T04A8.13T04A8.13n/achrIII 4,709,804contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
37C27D8.2C27D8.2n/achrIV 12,713,741contains similarity to Pfam domain PF07707 BTB And C-terminal Kelch contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR011705 (BTB/Kelch-associated), IPR013089 (Kelch related)
38F36H12.4F36H12.4n/achrIV 5,269,346
39F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
40Y81G3A.1Y81G3A.1n/achrII 13,082,998Y81G3A.1 encodes a nematode-specific sperm protein; Y81G3A.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and T08G11.2); Y81G3A.1(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; Y81G3A.1 expression is enriched in spermatogenesis.
41T21E12.5T21E12.5n/achrI 4,412,759
42K08C9.1K08C9.1n/achrI 11,485,648
43C34F11.2C34F11.2n/achrII 5,212,509
44ZC412.5ZC412.5n/achrV 14,874,791
45K09G1.2K09G1.2n/achrV 9,590,914contains similarity to Carnobacterium piscicola Putative ABC transporter PisT.; TR:Q93QC9
46T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)
47F32B4.2F32B4.2n/achrI 11,513,362contains similarity to Interpro domain IPR002056 (Protein import receptor MAS20)
48C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
49ZK930.4ZK930.4n/achrII 11,908,092contains similarity to Homo sapiens Similar to hypothetical protein FLJ20094; ENSEMBL:ENSP00000324274
50C50E10.2C50E10.2n/achrII 12,306,600contains similarity to Pfam domain PF06887 (Protein of unknown function (DUF1265))