UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1str-229C17E7.110chrV 3,901,512C. elegans STR-229 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2K08E4.3K08E4.3n/achrIV 12,058,560contains similarity to Phytolacca americana Mitogen PL-B.; TR:Q9AVB0
3F13B9.6F13B9.6n/achrX 8,266,671contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
4C47F8.4C47F8.4n/achrI 12,317,914contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
5W06G6.9W06G6.9n/achrV 16,646,169contains similarity to Ralstonia solanacearum Hypothetical protein RSc2317.; TR:Q8XX01
6W08F4.1W08F4.1n/achrII 593,688
7F59D12.3F59D12.3n/achrX 15,649,663contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
8srh-204E03D2.3n/achrV 4,239,757C. elegans SRH-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9C15C6.3C15C6.3n/achrI 12,209,642contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region)
10fbxa-149Y38H6C.10n/achrV 20,512,556This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
11wee-1.1F35H8.7n/achrII 9,582,677C. elegans WEE-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
12T23G5.3T23G5.3n/achrIII 9,230,130contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF00786 (P21-Rho-binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000095 (PAK-box/P21-Rho-binding), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
13srh-165C41G6.9n/achrV 15,220,637C. elegans SRH-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14Y39A1A.2Y39A1A.2n/achrIII 10,602,626contains similarity to Oryza sativa Hypothetical protein.; TR:Q9LH25
15C02H6.1C02H6.1n/achrV 7,389,111contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
16Y116A8C.13Y116A8C.13n/achrIV 16,956,392contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000330 (SNF2-related), IPR001395 (Aldo/keto reductase), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
17nhr-262F09C6.8n/achrV 16,906,069C. elegans NHR-262 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18srbc-13K09C6.5n/achrV 847,788C. elegans SRBC-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19ZK666.4ZK666.4n/achrII 10,477,397contains similarity to Oryza sativa Putative retinoblastoma-related protein 1.; TR:Q84QM3
20sre-40T05A7.8n/achrII 4,682,734C. elegans SRE-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
21F09F9.3F09F9.3n/achrX 4,120,310
22D2092.5D2092.5n/achrI 6,603,752contains similarity to Interpro domains IPR002713 (FF), IPR000533 (Tropomyosin)
23srx-93F59B1.3n/achrV 3,620,070C. elegans SRX-93 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
24sre-8F40G12.1n/achrV 14,258,150C. elegans SRE-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
25Y17D7B.5Y17D7B.5n/achrV 18,775,675contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
26R09E10.5R09E10.5n/achrIV 10,299,194contains similarity to Pfam domains PF03782 (AMOP domain) , PF06119 (Nidogen-like) contains similarity to Interpro domains IPR005533 (AMOP), IPR003886 (Nidogen, extracellular region), IPR016060 (Complement control module)
27F55E10.4F55E10.4n/achrX 8,327,670
28F44E5.2F44E5.2n/achrII 11,770,321contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat
29srh-97F49H6.4n/achrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30B0379.2B0379.2n/achrI 10,071,342contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Possible role for UBP3 in controlling the activity or assembly of the SIR protein complex.; SGD:YER151C
31C46E10.9C46E10.9n/achrII 3,728,602contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
32T26A5.4T26A5.4n/achrIII 6,461,112contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
33srab-13F59A7.3n/achrV 2,026,295C. elegans SRAB-13 protein ;
34F02E11.4F02E11.4n/achrII 3,276,774contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
35unc-40T19B4.7n/achrI 5,685,676The unc-40 gene encodes a netrin receptor that is required to guide dorsal-ventral cell and axon migrations, and is required for correct polarization and migration of the neuroblasts QL and QR.
36F47B7.3F47B7.3n/achrX 3,763,711contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
37set-13K12H6.11n/achrII 2,818,048set-13 encodes a SET domain-containing protein; SET-13 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-6, SET-15, SET-19, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-13(n5012) nor set-13(RNAi) have any obvious phenotypes.
38B0207.6B0207.6n/achrI 5,936,242contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
39C10B5.1C10B5.1n/achrV 8,582,501contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
40B0432.1B0432.1n/achrII 298,462
41aqp-7M02F4.8n/achrX 3,026,113aqp-7 encodes an aquaglyceroporin whose expression in Xenopus oocytes increases either water or glycerol permeability five- to seven-fold; AQP-7 has no function in mass RNAi assays, perhaps reflecting genetic redundancy with its several paralogs; AQP-7 is expressed in muscle punctae (perhaps focal adhesions).
42srh-233Y113G7A.1n/achrV 20,046,361C. elegans SRH-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43ZC412.8ZC412.8n/achrV 14,879,632contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
44sri-65F13A7.8n/achrV 16,387,488C. elegans SRI-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I)
45knl-1C02F5.1n/achrIII 8,252,399knl-1 encodes a novel acidic protein with a coiled-coil region at its C-terminus; KNL-1 is an essential kinetochore component that is required for proper spindle elongation and chromosome separation, and in the kinetochore assembly pathway, plays a key role in linking the initiation of kinetochore formation with the construction of a functional microtubule-binding interface; in the assembly pathway, KNL-1 functions downstream of the DNA-proximal kinetochore components CeCENP-A/HCP-3 and CeCENP-B/HCP-4 and upstream of the outer kinetochore components HIM-10/Nuf2p, NDC-80/HEC1, CeBUB-1, HCP-1, and CeCLASP2/CLS-2; in expression studies in the one-cell embryo, KNL-1 localizes to kinetochores throughout mitosis.
46F19G12.3F19G12.3n/achrX 1,425,941contains similarity to Pfam domain PF02170 PAZ domain contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
47Y39E4B.7Y39E4B.7n/achrIII 13,113,204contains similarity to Pfam domain PF01529 (DHHC zinc finger domain)
48T02G6.6T02G6.6n/achrI 11,821,054contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
49gcy-9ZK455.2n/achrX 11,335,257gcy-9 encodes a membrane guanylyl cyclase; gcy-9 expression is reportedly weak and variable in non-neuronal tissues.
50str-246W09D6.35.0000000000000004e-29chrIII 11,078,457C. elegans STR-246 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)