UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-156C17E7.18e-119chrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
2str-248C55A1.3n/achrV 15,628,858C. elegans STR-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F52F10.4F52F10.4n/achrV 1,544,140contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
4srt-37F47D2.8n/achrV 4,280,809C. elegans SRT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
5srj-44T03D3.11n/achrV 2,845,216C. elegans SRJ-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
7srh-145F26D2.4n/achrV 16,411,251C. elegans SRH-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
8clec-140T05A7.2n/achrII 4,675,089C. elegans CLEC-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
9C30E1.2C30E1.2n/achrX 16,927,410
10Y16B4A.2Y16B4A.2n/achrX 14,766,829contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
11F49C5.4F49C5.4n/achrII 12,539,002contains similarity to Pfam domain PF00069 (Eukaryotic protein kinase domain)
12clec-2B0454.7n/achrII 3,021,991C. elegans CLEC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13srx-131F09F3.2n/achrV 13,846,060C. elegans SRX-131 protein ;
14sre-41Y57A10B.5n/achrII 12,388,981C. elegans SRE-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
15AH9.4AH9.4n/achrX 2,272,675contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
16T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
17nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18srbc-54F54B8.11n/achrV 15,833,053C. elegans SRBC-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19F56C4.1F56C4.1n/achrIV 10,638,106contains similarity to Brachydanio rerio D121 protein (Fragment).; TR:Q90ZG9
20fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
21srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22Y62H9A.9Y62H9A.9n/achrX 11,896,785contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I659
23T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
24srw-43F14F8.5n/achrV 16,686,204C. elegans SRW-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25F52D2.5F52D2.5n/achrX 1,974,154
26F54C1.6F54C1.6n/achrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)
27T06E8.2T06E8.2n/achrV 10,036,032
28srd-48F17A2.9n/achrX 12,336,853C. elegans SRD-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29srbc-15F15E11.10n/achrV 2,346,927C. elegans SRBC-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
30T15D6.9T15D6.9n/achrI 12,392,786contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
31srt-16C50H11.11n/achrV 3,064,037C. elegans SRT-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32srh-99C46E10.7n/achrII 3,715,771C. elegans SRH-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33C39H7.4C39H7.4n/achrIV 5,613,304
34sre-5B0212.2n/achrIV 3,566,503C. elegans SRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
35ceh-14F46C8.5n/achrX 7,530,621ceh-14 encodes a LIM homeodomain protein orthologous to Drosophila Lim3 and the vertebrate Lhx3 and Lhx4 proteins; ceh-14 is required for specification of the AFD thermosensory neurons and for normal thermotactic behavior; a ceh-14::GFP reporter fusion is expressed in head and tail neurons, including the AFD thermosensory neurons, during late embryonic, larval, and adult stages. Animals triply mutant for the LIM homeobox genes ceh-14, lin-11, and ttx-3 which are required for function of the AFD, AIZ, and AIY neurons, respectively, exhibit a basic cryophilic thermotaxis response suggesting that, in C. elegans, there is more than one pathway for integration of thermosensory input.
36ncx-5Y32F6B.2n/achrV 10,488,232ncx-5 encodes a putative 4Na[+]/1Ca[2+],1K[+] exchanger, orthologous to human SLC24A1-5 and paralogous to NCX-4; NCX-5 is predicted to export free cytoplasmic Ca[2+] with low affinity but high capacity, being complemented by low-capacity/high-affinity Ca[2+] ATPase pumps such as MCA-1/-3; NCX-5 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-5 has no obvious function in mass RNAi assays.
37R11D1.2R11D1.2n/achrV 12,709,668contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
38clec-44R07C3.12n/achrII 921,144C. elegans CLEC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
39sre-49C50E10.9n/achrII 12,319,870C. elegans SRE-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
40B0336.12B0336.12n/achrIII 5,710,236
41str-198ZK285.1n/achrV 16,048,450C. elegans STR-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42Y43F8C.6Y43F8C.6n/achrV 19,636,948contains similarity to Interpro domains IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR009057 (Homeodomain-like)
43F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
44sra-20F28C12.4n/achrI 12,697,375C. elegans SRA-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
45C01G5.7C01G5.7n/achrIV 6,518,588
46Y26G10.1Y26G10.1n/achrV 17,694,131contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR001774 (Delta/Serrate/lag-2 (DSL) protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR015919 (Cadherin-like), IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR006626 (Parallel beta-helix repeat), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR002126 (Cadherin), IPR013111 (EGF, extracellular)
47C05C12.6C05C12.6n/achrIV 11,232,367contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
48M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
49M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
50his-25ZK131.2n/achrII 13,824,963his-25 encodes an H3 histone.