UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C17C3.5C17C3.51.0000000000000001e-60chrII 5,552,099contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
2F56F4.3F56F4.3n/achrI 6,142,912contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR002208 (SecY protein), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
3W01B6.5W01B6.5n/achrIV 10,077,459contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
4F49E11.7F49E11.7n/achrIV 13,054,029contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
5F19C7.5F19C7.5n/achrIV 4,596,309
6ZC477.2ZC477.2n/achrIV 7,109,050contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
7D2062.7D2062.7n/achrII 2,617,140
8twk-6F17C8.5n/achrIII 4,743,772twk-6 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-6 may, however, function redundantly with other TWK channels; TWK-6 is expressed in the hypodermis.
9F58G1.9F58G1.9n/achrII 12,924,971contains similarity to Homo sapiens Adapter-related protein complex 4 mu 1 subunit; SW:O00189
10C18H2.1C18H2.1n/achrIII 7,667,218contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) (2), PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
11ZC190.8ZC190.8n/achrV 8,687,699contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
12C26B2.2C26B2.2n/achrIV 8,021,582
13R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
14C09H10.9C09H10.9n/achrII 11,105,179
15W09C3.8W09C3.8n/achrI 4,716,751
16T28D9.9T28D9.9n/achrII 6,484,502
17K01D12.15K01D12.15n/achrV 12,386,487contains similarity to Interpro domains IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
18C02F5.2C02F5.2n/achrIII 8,249,732
19C25G4.7C25G4.7n/achrIV 12,457,730contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
20Y54E2A.5Y54E2A.5n/achrII 14,756,797
21F14E5.3F14E5.3n/achrII 8,436,197contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
22C04E6.5C04E6.5n/achrV 5,903,504contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
23F56F4.4F56F4.4n/achrI 6,138,476
24T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
25T27E4.6T27E4.6n/achrV 9,071,672contains similarity to Interpro domain IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
26T07E3.2T07E3.2n/achrIII 6,907,721
27W01B11.1W01B11.1n/achrI 3,300,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
28F43G9.8F43G9.8n/achrI 8,618,137contains similarity to Dugesia japonica DjFGFR1.; TR:Q8MY86
29srh-61T21B4.8n/achrII 12,515,614C. elegans SRH-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
30F23C8.1F23C8.1n/achrI 2,447,555
31C18H2.3C18H2.3n/achrIII 7,685,691contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (2), PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
32F46A9.2F46A9.2n/achrI 9,459,902contains similarity to Saccharomyces cerevisiae part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA); similar to microtubule binding proteins and to X90565_5.cds; SGD:YLR197W
33C50H2.7C50H2.7n/achrV 9,923,573contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
34F22D3.4F22D3.4n/achrII 6,925,039
35R155.2R155.2n/achrIII 1,967,000contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR013992 (Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
36F13E9.5F13E9.5n/achrIV 10,883,638contains similarity to Helicobacter pylori;Helicobacter pylori J99 Hypothetical protein HP0031/JHP0027.; SW:Y031_HELPY
37Y106G6E.1Y106G6E.1n/achrI 10,199,352contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38ZK1225.5ZK1225.5n/achrI 13,217,724
39T08H10.1T08H10.1n/achrV 4,484,972contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
40C32D5.4C32D5.4n/achrII 6,322,171
41F28H1.5F28H1.5n/achrI 3,979,010
42F36G9.15F36G9.15n/achrV 15,987,734contains similarity to Pfam domain PF06678 Protein of unknown function (DUF1179) contains similarity to Interpro domain IPR009564 (Protein of unknown function DUF1179)
43K02F6.3K02F6.3n/achrII 2,547,902contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
44F54D1.1F54D1.1n/achrIV 11,262,424contains similarity to Interpro domain IPR004087 (K Homology)
45F13H8.6F13H8.6n/achrII 6,285,852
46R07E5.6R07E5.6n/achrIII 4,399,849contains similarity to Interpro domains IPR005432 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha 2 subunit), IPR009149 (BR22)
47F26F2.1F26F2.1n/achrV 20,555,875contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
48M110.7M110.7n/achrII 8,235,210contains similarity to Pfam domain PF01237 Oxysterol-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR000648 (Oxysterol-binding protein)
49K09F6.4K09F6.4n/achrII 2,263,817contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
50tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)