UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ins-11C17C3.41.0000000000000001e-39chrII 5,556,897ins-11 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-11 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and is expressed in the labial sensory neurons, the nerve ring, and other neurons; although the precise role of INS-11 in C. elegans development is not yet clear, loss of INS-11 function via RNA-mediated interference can result in animals that are smaller than wild type (Sma).
2dhs-26ZK816.5n/achrX 3,361,621dhs-26 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4T28A11.5T28A11.5n/achrV 3,270,895contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
5dhs-31T04B2.6n/achrIV 10,040,250C. elegans DHS-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
6srw-120K12D9.5n/achrV 2,995,551C. elegans SRW-120 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
7F47B8.4F47B8.4n/achrV 14,324,002contains similarity to Pfam domain PF00462 Glutaredoxin contains similarity to Interpro domains IPR002109 (Glutaredoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
8ZC443.2ZC443.2n/achrV 12,810,803contains similarity to Listeria innocua Hypothetical protein lin2372.; TR:Q929A5
9F53F4.7F53F4.7n/achrV 13,613,185contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
10C14A6.2C14A6.2n/achrV 18,151,568contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
11C17B7.4C17B7.4n/achrV 3,339,687contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
12nlp-7F18E9.2n/achrX 8,593,444C. elegans NLP-7 protein ;
13C32H11.3C32H11.3n/achrIV 12,919,384contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
14tyr-3F21C3.2n/achrI 7,276,425C. elegans TYR-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF00264 (Common central domain of tyrosinase) , PF01549 (ShK domain-like) (4)contains similarity to Interpro domains IPR008922 (Di-copper centre-containing), IPR002227 (Tyrosinase), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
15F18G5.6F18G5.6n/achrX 9,263,128
16K01A2.10K01A2.10n/achrII 322,278contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 92; ENSEMBL:ENSP00000238156
17C32F10.4C32F10.4n/achrI 5,809,249
18tag-38B0222.4n/achrV 9,145,742C. elegans TAG-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF00282 (Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain) , PF00266 (Aminotransferase class-V) contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
19T19D12.3T19D12.3n/achrII 6,660,581
20tag-243T04A8.4n/achrIII 4,686,618C. elegans TAG-243 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding)
21gst-41R13D7.7n/achrV 7,398,864C. elegans GST-41 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
22nlp-5F35C11.1n/achrII 8,243,059C. elegans NLP-5 protein ;
23srbc-20C45H4.11n/achrV 2,147,858C. elegans SRBC-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
24fbxa-164C08E3.7n/achrII 1,613,450This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
25flp-14Y37D8A.15n/achrIII 12,912,600flp-14 encodes four copies of a single FMRFamide-related short peptide neurotransmitter; FLP-14 can increase pharyngeal action potential frequency, although its exact role in C. elegans neurotransmission is not yet clear.
26F07C3.9F07C3.9n/achrV 9,254,456
27C03G6.17C03G6.17n/achrV 7,380,393contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
28B0554.1B0554.1n/achrV 438,570
29W08A12.4W08A12.4n/achrV 3,675,610contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_94, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EFX6
30F26D11.2F26D11.2n/achrV 7,960,124
31C36C5.12C36C5.12n/achrV 3,158,933contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
32F48C1.8F48C1.8n/achrI 5,335,938contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002395 (HMW kininogen), IPR000817 (Prion protein), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein)
33spp-20K04A8.8n/achrV 6,557,433C. elegans SPP-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF05184 Saposin-like type B, region 1 contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR007856 (Saposin-like type B, 1), IPR008139 (Saposin B)
34C07A9.8C07A9.8n/achrIII 9,688,522contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
35nlp-31B0213.6n/achrV 3,980,323nlp-31 encodes five predicted neuropeptide-like proteins; in C. elegans, nlp-31 is part of the YGGWamide neuropeptide family that also contains nlp-24, nlp-25, and nlp-27-32; nlp-31 is expressed in the hypodermis, suggesting that the peptides it encodes may have a non-neuronal function; nlp-31 expression is also detected in precomma-stage embryos; as loss of nlp-31 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of the nlp-31-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
36fbxa-24F54D10.2n/achrII 3,817,370C. elegans FBXA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
37ttr-1K03H1.6n/achrIII 9,929,635ttr-1 encodes a protein containing a predicted signal sequence followed by a transthyretin-like domain; although TTR-1 belongs to a family of apparently nematode-specific proteins whose function is not yet known, loss of ttr-1 function via RNAi can result in enhanced dauer formation and daf-16-dependent lifespan extension.
38Y38H6C.19Y38H6C.19n/achrV 20,548,064contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
39K01D12.10K01D12.10n/achrV 12,406,600contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR003982 (Leukotriene B4 type 2 receptor)
40F36G9.7F36G9.7n/achrV 15,968,760contains similarity to Methanosarcina mazei Hypothetical protein MM0083.; TR:Q8Q0Q3
41srw-33T26H5.5n/achrV 15,450,551C. elegans SRW-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42T10G3.1T10G3.1n/achrV 13,471,322contains similarity to Saccharomyces cerevisiae interacts with Sin1p; SGD:YER047C
43F47E1.2F47E1.2n/achrX 9,059,694contains similarity to Pfam domain PF03137 Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family contains similarity to Interpro domains IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44C17G10.7C17G10.7n/achrII 5,607,281
45T07D1.3T07D1.3n/achrX 2,443,181contains similarity to Interpro domain IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
46F12A10.2F12A10.2n/achrII 5,495,367
47T28A11.16T28A11.16n/achrV 3,258,866contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
48flp-24C24A1.1n/achrIII 725,550C. elegans FLP-24 protein ;
49zig-3C14F5.2n/achrX 7,931,218zig-3 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-3::gfp reporter fusion is expressed in the PVT, AIM, and ASI neurons, as well as in the vulva and weakly in the body wall muscle.
50F11C1.4F11C1.4n/achrX 12,979,059contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG9186-PA;; FLYBASE:CG9186