UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C17C3.3C17C3.30chrII 5,562,616contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
2gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
3R03H10.5R03H10.5n/achrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
4K03F8.1K03F8.1n/achrIII 6,511,465contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
5Y43F8A.1Y43F8A.1n/achrV 19,370,930contains similarity to Rhizobium sp Probable conjugal transfer protein trbD.; SW:TRBD_RHISN
6F44A2.7F44A2.7n/achrV 9,322,227
7H09F14.1H09F14.1n/achrV 10,614,197contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8F53B1.3F53B1.3n/achrX 2,106,394
9srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10F36H5.8F36H5.8n/achrII 1,749,990This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
11M01E10.3M01E10.3n/achrIII 2,054,148contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
12F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659
13T22B7.4T22B7.4n/achrX 5,639,932contains similarity to Pfam domain PF07039 Protein of unknown function (DUF1325) contains similarity to Interpro domain IPR010750 (Protein of unknown function DUF1325)
14Y45F3A.4Y45F3A.4n/achrIII 10,573,829contains similarity to Interpro domain IPR008967 ()
15srbc-10C18B10.2n/achrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16clec-116K04H8.1n/achrI 14,251,698C. elegans CLEC-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
17ugt-36F09G2.6n/achrV 7,168,088C. elegans UGT-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR008081 (Cytoplasmic FMR1-interacting), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
18Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
19ZC239.14ZC239.14n/achrII 3,221,697contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
20srj-50T03D3.2n/achrV 2,833,942C. elegans SRJ-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21ZC196.3ZC196.3n/achrV 8,737,532contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
22cyp-29A4B0331.1n/achrV 9,656,299C. elegans CYP-29A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
23str-115F07B10.3n/achrV 11,269,735C. elegans STR-115 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24nhr-281F16B12.8n/achrX 14,112,277C. elegans NHR-281 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
25sri-13M01G12.13n/achrI 12,141,648C. elegans SRI-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26srg-14F26B1.6n/achrI 6,313,673C. elegans SRG-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
27srt-48Y41E3.15n/achrIV 15,067,356C. elegans SRT-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28T04G9.1T04G9.1n/achrX 792,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region)
29D2062.1D2062.1n/achrII 2,632,264contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
30T25B6.4T25B6.4n/achrX 9,016,157
31C55A1.7C55A1.7n/achrV 15,647,283contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
32F10G2.7F10G2.7n/achrV 7,335,453contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
33srd-58E04F6.13n/achrII 7,204,421C. elegans SRD-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34srg-40T19C4.4n/achrV 11,163,867C. elegans SRG-40 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
35C28H8.8C28H8.8n/achrIII 5,887,890contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
36T21C9.11T21C9.11n/achrV 10,594,469contains similarity to Homo sapiens Popeye domain containing protein 3; ENSEMBL:ENSP00000254765
37C50E3.8C50E3.8n/achrV 7,598,180
38str-106K05D4.2n/achrV 16,181,228C. elegans STR-106 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39T20B6.1T20B6.1n/achrIII 2,898,031contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
40F49H6.13F49H6.13n/achrV 17,008,999contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR001285 (Synaptophysin/synaptoporin)
41F35F10.12F35F10.12n/achrV 3,314,352contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
42F28B1.2F28B1.2n/achrV 17,047,282contains similarity to Arabidopsis thaliana T12C22.10 protein.; TR:Q9LPE8
43ZC373.2ZC373.2n/achrX 10,058,054contains similarity to Synechococcus elongatus Tll2335 protein.; TR:Q8DGI2
44B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918
45tbx-33Y66A7A.8n/achrIII 11,635,769C. elegans TBX-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
46R07C3.14R07C3.14n/achrII 929,840
47sro-1D1022.6n/achrII 7,461,799C. elegans SRO-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
48srh-258T06E6.7n/achrV 15,405,935C. elegans SRH-258 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50K06B4.4K06B4.4n/achrV 15,669,604contains similarity to Interpro domain IPR006025 (Neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding region)