UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1str-63C17B7.10chrV 3,352,167C. elegans STR-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2nhr-159C17E7.7n/achrV 3,876,286C. elegans NHR-159 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3srv-6C52B9.5n/achrX 4,258,053C. elegans SRV-6 protein ;
4clec-131W10G11.7n/achrII 3,575,385C. elegans CLEC-131 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5srx-19T05A12.1n/achrIV 6,874,033C. elegans SRX-19 protein ;
6str-207F26G5.44e-16chrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7C18E3.4C18E3.4n/achrI 4,202,730
8hyl-2K02G10.6n/achrX 4,698,095hyl-2 encodes a predicted transmembrane protein that is related to Saccharomyces cerevisiae LAG1 (longevity assurance gene), a protein preferentially expressed in young yeasts; by homology, HYL-2 is predicted to have several possible functions, including regulation of lipid, particularly ceramide, biosynthesis, regulation of lipid transport, and regulation of protein translocation in the endoplasmic reticulum ; however, as loss of hyl-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of hyl-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
9srw-113ZK1037.9n/achrV 15,333,837C. elegans SRW-113 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
10str-204F10D2.12e-16chrV 7,160,334C. elegans STR-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11Y75B8A.31Y75B8A.31n/achrIII 12,353,159contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of UPF0528 protein C5orf21 precursor; ENSEMBL:ENSP00000265139
12B0496.1B0496.1n/achrIV 7,446,888contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ), IPR000210 (BTB/POZ-like)
13srbc-11C18B10.1n/achrV 7,494,565C. elegans SRBC-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14F59D6.4F59D6.4n/achrV 3,030,897contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
15C01G5.8C01G5.8n/achrIV 6,550,691contains similarity to Pfam domain PF08774 VRR-NUC domain contains similarity to Interpro domain IPR014883 (VRR-NUC)
16hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
17tag-52C02F12.4n/achrX 3,676,290C. elegans TAG-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type)
18srx-117C14C11.5n/achrV 5,645,343C. elegans SRX-117 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19Y71A12C.2Y71A12C.2n/achrI 14,047,116contains similarity to Pfam domain PF09335 SNARE associated Golgi protein contains similarity to Interpro domain IPR015414 (SNARE associated Golgi protein)
20C17A2.2C17A2.2n/achrII 3,847,228contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
21srg-32T21C9.7n/achrV 10,587,952C. elegans SRG-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
22uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
23nhr-149C03G6.12n/achrV 7,349,121C. elegans NHR-149 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
24str-233C06C6.2n/achrV 16,008,971C. elegans STR-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25F46F5.5F46F5.5n/achrII 812,930contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
26srbc-23C45H4.9n/achrV 2,154,343C. elegans SRBC-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
27C23G10.5C23G10.5n/achrIII 6,191,540contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
28Y54G9A.1Y54G9A.1n/achrII 13,700,041contains similarity to Carabus linnei NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment).; TR:O79584
29K10F12.6K10F12.6n/achrIII 399,060
30srx-112T24E12.8n/achrII 3,764,010C. elegans SRX-112 protein ;
31K03H6.4K03H6.4n/achrIV 1,519,644
32scl-21Y43F8B.5n/achrV 19,495,187C. elegans SCL-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
33srbc-41F16B4.10n/achrV 1,613,815C. elegans SRBC-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
34srh-140Y6E2A.6n/achrV 15,723,067C. elegans SRH-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000484 (Photosynthetic reaction centre, L and M subunits)
35F44A2.2F44A2.2n/achrV 9,319,570contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
36ZK1037.1ZK1037.1n/achrV 15,311,784contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
37F55B12.2F55B12.2n/achrV 13,816,154contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
38C04A11.2C04A11.2n/achrX 13,667,311contains similarity to Homo sapiens Putative protein TPRXL; ENSEMBL:ENSP00000322097
39F40G12.4F40G12.4n/achrV 14,268,178contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
40R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)
41C18H9.2C18H9.2n/achrII 6,690,893contains similarity to Xenopus laevis PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2s(Trinucleotide repeat-containing gene 15 protein).; SW:Q5U236
42taf-13C14A4.10n/achrII 10,605,243taf-13 encodes a predicted member of the transcription initiation factor IID, 18kDa subunit family with similarity to Drosophila Taf13.
43F55D1.2F55D1.2n/achrX 5,488,910
44F16G10.14F16G10.14n/achrII 2,398,093contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
45lgc-20B0491.4n/achrII 11,341,749C. elegans LGC-20 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
46srh-296Y94A7B.4n/achrV 17,811,540C. elegans SRH-296 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47T11G6.5T11G6.5n/achrIV 10,839,263contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
48ZK384.3ZK384.3n/achrV 18,730,891contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR001461 (Peptidase A1)
49C18H7.1C18H7.1n/achrIV 618,237contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
50F59B2.11F59B2.11n/achrIII 9,014,893contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000025312