UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C17A2.4C17A2.40chrII 3,840,560contains similarity to Cebus apella Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1 (EC 2.4.1.69) (GDP-L-sfucose:beta-D-galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1)s(Alpha(1,2)FT 1) (Fucosyltransferase 1).; SW:Q866E8
2srj-13R13D7.3n/achrV 7,403,263C. elegans SRJ-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
4D1086.5D1086.5n/achrV 14,089,587contains similarity to Bison bonasus MHC class II DR-beta chain (Fragment).; TR:O19256
5M01E10.3M01E10.3n/achrIII 2,054,148contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
6R03H10.5R03H10.5n/achrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
7F40E12.2F40E12.2n/achrII 3,612,874contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
8ugt-36F09G2.6n/achrV 7,168,088C. elegans UGT-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR008081 (Cytoplasmic FMR1-interacting), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
9H09F14.1H09F14.1n/achrV 10,614,197contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
10EGAP5.1EGAP5.1n/achrX 5,163,174
11ubc-22C06E2.7n/achrX 8,868,414ubc-22 encodes an E2 ubiquitin-conjugating enzyme orthologous to Saccharomyces cerevisiae UBC8 and human UBC1/HIP2 (Huntingtin interacting protein 2, OMIM:602846) which are involved in regulating fructose-1,6-bisphosphatase and huntingtin catabolism, respectively; by homology, UBC-22 is likely required for covalent attachment of ubiquitin to select target proteins to facilitate their degradation; however, as loss of UBC-22 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of UBC-22 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
12F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659
13D2062.1D2062.1n/achrII 2,632,264contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
14C32B5.11C32B5.11n/achrII 949,051
15Y44A6C.1Y44A6C.1n/achrV 20,710,785contains similarity to Plasmodium falciparum Normocyte binding protein 2b.; TR:Q7YWE8
16Y60C6A.1Y60C6A.1n/achrV 4,784,867contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
17C17C3.3C17C3.3n/achrII 5,562,616contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
18Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
19F18A12.1F18A12.1n/achrII 3,418,742F18A12.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.1 has no clear orthologs in other organisms.
20R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
21str-115F07B10.3n/achrV 11,269,735C. elegans STR-115 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22F53F10.1F53F10.1n/achrI 3,835,946contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 102A; ENSEMBL:ENSP00000258214
23F35B3.3F35B3.3n/achrX 17,013,662
24C55A1.6C55A1.6n/achrV 15,648,434contains similarity to Lactococcus lactis Protein maturation protein.; TR:Q9CEV9
25F53B1.3F53B1.3n/achrX 2,106,394
26nhr-282F54B8.2n/achrV 15,812,667C. elegans NHR-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
27Y45F3A.4Y45F3A.4n/achrIII 10,573,829contains similarity to Interpro domain IPR008967 ()
28T04C12.1T04C12.1n/achrV 11,058,930n/a
29T22B7.4T22B7.4n/achrX 5,639,932contains similarity to Pfam domain PF07039 Protein of unknown function (DUF1325) contains similarity to Interpro domain IPR010750 (Protein of unknown function DUF1325)
30C55A1.7C55A1.7n/achrV 15,647,283contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
31F44A2.7F44A2.7n/achrV 9,322,227
32F49H6.13F49H6.13n/achrV 17,008,999contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR001285 (Synaptophysin/synaptoporin)
33str-106K05D4.2n/achrV 16,181,228C. elegans STR-106 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
35srh-19F19G12.5n/achrX 1,414,840C. elegans SRH-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36T27E4.1T27E4.1n/achrV 9,093,497contains similarity to Interpro domain IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB)
37F11A5.13F11A5.13n/achrV 16,226,353contains similarity to Clostridium acetobutylicum MDR-type permease.; TR:Q97D15
38nhr-281F16B12.8n/achrX 14,112,277C. elegans NHR-281 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39F35B3.1F35B3.1n/achrX 17,016,472contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
40C39D10.5C39D10.5n/achrX 7,891,348
41F22F7.3F22F7.3n/achrV 2,113,100contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
42R102.3R102.3n/achrIV 10,691,049contains similarity to Broad bean wilt virus 2 210kDa protein.; TR:Q9E933
43F27C1.10F27C1.10n/achrI 5,435,347
44B0546.3B0546.3n/achrIV 3,380,351contains similarity to Pfam domain PF03226 Yippee putative zinc-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004910 (Yippee-like protein)
45C13A10.2C13A10.2n/achrII 1,357,598
46pqn-97ZK488.10n/achrV 609,465The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
47srg-40T19C4.4n/achrV 11,163,867C. elegans SRG-40 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
48F14D7.5F14D7.5n/achrV 14,299,389contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Hypothetical protein.; TR:Q8ABS0
49T21C12.3T21C12.3n/achrIII 10,538,504contains similarity to Leptospira interrogans Hypothetical protein.; TR:Q8EZD2
50xbx-3M04D8.6n/achrIII 10,036,315C. elegans XBX-3 protein ;