UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C16D9.8C16D9.83e-37chrV 8,262,448
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3tni-4W03F8.1n/achrIV 5,205,854tni-4 encodes one of the four elegans troponin I proteins; tni-4 is required for the normal development of the pharynx during embryonic development; TNI-4 interacts only with the pharyngeal troponin C; tni-4 is expressed exclusively in the pharyngeal muscles.
4nhr-4F32B6.1n/achrIV 9,880,614nhr-4 is predicted to encode a nuclear hormone receptor (NHR); expression may peak during the late larval stages, based on mRNA expression analysis.
5F53F1.1F53F1.1n/achrV 13,405,004contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
6D2096.9D2096.9n/achrIV 8,382,356
7srh-62ZK6.9n/achrV 402,409C. elegans SRH-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8srh-23C02E7.5n/achrV 4,921,905C. elegans SRH-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9srd-12C39H7.6n/achrIV 5,629,500C. elegans SRD-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001073 (Complement C1q protein)
10sos-1T28F12.3n/achrV 4,533,472The sos-1 gene, also known as let-341, encodes an ortholog of Son of sevenless, a guanine nucleotide exchange factor that affects viability, sex myoblast migration, vulval induction, and oogenesis; it acts genetically downstream of let-23 and upstream of let-60 with respect to vulval development.
11ZK112.6ZK112.6n/achrIII 7,740,126contains similarity to Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar copenhageni Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1) (Acetate--CoA ligase) (Acyl-sactivating enzyme).; SW:Q72LY9
12fbxa-23T12B5.13n/achrIII 948,457C. elegans FBXA-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
13F16B12.1F16B12.1n/achrX 14,087,466contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
14arl-6C38D4.8n/achrIII 4,814,024arl-6 encodes an ADP-Ribosylation factor-Like member of the Ras superfamily of small GTP-binding proteins and is a predicted homolog of the human ARL6 gene, identified as the gene that underlies Bardet-Biedl syndrome type 3; GFP-tagged ARL-6 undergoes intraflagellar transport (IFT) in the ciliary axoneme, implicating ARL-6 in ciliary transport; arl-6 is expressed in amphid and phasmid ciliated sensory neurons.
15K10C3.4K10C3.4n/achrI 9,861,391contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 98.; SW:Q6INX1
16srx-34T01C4.4n/achrV 7,119,646C. elegans SRX-34 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
17rom-2C48B4.2n/achrIII 9,593,829C. elegans ROM-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF01694 (Rhomboid family) , PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002610 (Peptidase S54, rhomboid), IPR017213 (Peptidase S54, rhomboid, metazoan)
18srab-1C04F5.4n/achrV 5,101,092C. elegans SRAB-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
19F15G9.5F15G9.5n/achrX 9,735,456contains similarity to Homo sapiens Fibrillin 2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000262464
20sra-23T06G6.1n/achrI 12,704,070C. elegans SRA-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
21ZK892.6ZK892.6n/achrII 9,979,541contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Hypothetical protein.; TR:Q87PB2
22gst-25F37F2.3n/achrI 1,452,100C. elegans GST-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003082 (Glutathione S-transferase, Pi class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
23C08H9.6C08H9.6n/achrII 9,873,847contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
24ceh-1F16H11.4n/achrX 4,653,768ceh-1 encodes a protein that contains a homeobox domain.
25abf-3F54B8.5n/achrV 15,817,602abf-3 encodes a homolog of the antibacterial factor ASABF from Ascaris suum; ABF-3 may play a role in innate immunity, though at present the only evidence for its having an antimicrobial humoral function is its sequence similarity.
26srv-7T22B7.5n/achrX 5,643,888C. elegans SRV-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
27Y18D10A.4Y18D10A.4n/achrI 12,816,155contains similarity to Thecacera pennigera Cytochrome oxidase subunit I (EC 1.9.3.1) (Cytochrome c oxidasespolypeptide I) (Fragment).; TR:Q9T6F2
28F14D7.3F14D7.3n/achrV 14,296,989contains similarity to Interpro domain IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
29srh-127F37B4.1n/achrV 2,894,429C. elegans SRH-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30tsg-101C09G12.9n/achrIV 3,512,510C09G12.9 encodes the C. elegans ortholog of S. cerevisiae vacuolar protein sorting protein Vps23p and human TUMOR SUSCEPTIBILITY GENE 101 (TSG101; OMIM:601387), mutations in which are associated with several types of cancer and with varying responses to HIV infection; the product of C09G12.9 is predicted to be a component of C. elegans ESCRT-1 (Endosomal Sorting Complex Required for Transport), and RNAi experiments indicate that its activity is essential for embryonic and larval development.
31clec-231C29F3.4n/achrV 15,350,031C. elegans CLEC-231 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
32W04D2.5W04D2.5n/achrV 12,493,975contains similarity to Pfam domain PF00411 Ribosomal protein S11 contains similarity to Interpro domain IPR001971 (Ribosomal protein S11)
33C11G10.2C11G10.2n/achrX 15,142,124contains similarity to Homo sapiens Thyroid hormone receptor-associated protein complex 240 kDa component; ENSEMBL:ENSP00000262436
34F30A10.9F30A10.9n/achrI 9,505,158contains similarity to Pfam domain PF04900 Fcf1 contains similarity to Interpro domains IPR006984 (Protein of unknown function DUF652), IPR006596 (Nucleotide binding protein, PINc)
35srw-122H27D07.5n/achrV 2,951,456C. elegans SRW-122 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36srg-33F21F8.1n/achrV 8,292,769C. elegans SRG-33 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
37F38A1.11F38A1.11n/achrIV 1,248,205contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
38sra-6AH6.10n/achrII 9,549,075sra-6 encodes a seven-transmembrane chemosensory receptor; an sra-6::GFP fusion reporter is expressed in the ASH (strongly) and ASI (weakly) amphid sensory neurons, the PVQ interneurons, and in the SPD and SPV male spicule neurons; sra-6 expression in the ASH neurons is positively regulated by KIN-29, a serine/threonine kinase, acting through the HDA-4 class II histone deacetylase and the MEF-2 MADS domain transcription factor; in addition, maintenance of sra-6::gfp expression in the ASH and ASI requires activity of the DAF-7/TGF-beta signaling pathway.
39lev-8C35C5.5n/achrX 11,562,231lev-8 encodes a novel nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) alpha subunit that is a member of the ACR-8 group of nAChR subunits; LEV-8 activity is required for normal rates of pharyngeal pumping and for fully wild-type responses (increased egg laying and body wall muscle contraction) to the nAChR agonist and antihelmintic levamisole; expression of a LEV-8::GFP reporter construct begins at the L1 larval stage and is detected in neurons, body wall and uterine muscle cells, and socket cells of the IL and OL mechanosensory neurons; expression in body wall muscles is strongest in the anterior, consistent with increased levamisole resistance of head, or anterior, muscles seen in lev-8 mutant animals.
40ins-32Y8A9A.6n/achrII 3,803,141ins-32 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-32 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and the precise role of INS-32 in C. elegans development is not yet clear as loss of INS-32 function does not result in a mutant phenotype.
41Y48A6C.1Y48A6C.1n/achrIII 11,104,510contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
42Y53C12B.2Y53C12B.2n/achrII 9,740,855contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
43R09D1.5R09D1.5n/achrII 9,448,892contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
44C44C10.7C44C10.7n/achrX 11,687,559contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
45nhr-195F59E11.10n/achrV 8,971,529C. elegans NHR-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
46srh-11R09F10.6n/achrX 8,318,283C. elegans SRH-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47daf-11B0240.3n/achrV 11,721,848The daf-11 gene encodes a guanylate cyclase that affects dauer formation, chemotaxis, and axon formation; it is genetically upstream of daf-12 with respect to dauer larvae formation and is expressed in a subset of amphid neurons.
48srh-219C06B8.6n/achrV 15,496,906C. elegans SRH-219 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49srx-73F41F3.7n/achrV 4,664,669C. elegans SRX-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50H02F09.2H02F09.2n/achrX 1,573,611