UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1C16C8.7C16C8.75e-101chrII 3,459,961
2K12H6.4K12H6.4n/achrII 2,823,987
3T26A8.3T26A8.3n/achrIV 8,425,562
4nas-19K03B8.5n/achrV 11,402,129nas-19 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-19::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx, intestine, vulva, and reproductive system.
5clec-106Y18D10A.12n/achrI 12,866,497C. elegans CLEC-106 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7F59A1.6F59A1.6n/achrV 17,685,618contains similarity to Brachydanio rerio SI:dZ186F8.4 (Novel immune-type receptor) (Fragment).; TR:Q8UVA1
8F41B4.3F41B4.3n/achrX 6,835,782
9T02D1.7T02D1.7n/achrIV 17,406,968contains similarity to Rhizobium meliloti Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenasescomplex (EC 2.3.1.12) (E2).; SW:ODP2_RHIME
10C16C8.9C16C8.9n/achrII 3,462,897
11F48G7.9F48G7.9n/achrV 628,338contains similarity to Pfam domain PF00130 Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
12ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
13clec-94ZK39.3n/achrI 11,147,370C. elegans CLEC-94 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
14R53.8R53.8n/achrII 9,977,190contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
15T26E3.6T26E3.6n/achrI 12,661,501contains similarity to Homo sapiens Low-density lipoprotein receptor-related protein 2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000263816
16srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17F49F1.11F49F1.11n/achrIV 4,140,539contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
18grd-5F41E6.2n/achrV 8,619,427grd-5 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground domain; GRD-5 is expressed in adult anterior and posterior seam cells, overlapping GRD-3 expression; the Ground domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; GRD-5 is weakly required for normal molting; GRD-5 is also required for normal adult alae formation, growth to full size, and locomotion; all of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
19K12H6.8K12H6.8n/achrII 2,828,347
20clec-232F36G9.11n/achrV 15,976,833C. elegans CLEC-232 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21scl-9F49E11.4n/achrIV 13,047,679C. elegans SCL-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
22try-5K07B1.1n/achrV 9,347,867C. elegans TRY-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00089 Trypsin contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
23fipr-16C06E1.6n/achrIII 8,590,815C. elegans FIPR-16 protein ;
24Y43F8C.17Y43F8C.17n/achrV 19,712,303contains similarity to Rhodosporidium toruloides Rhodotorucine A precursor 2.; SW:RHT2_RHOTO
25F19H6.5F19H6.5n/achrX 12,364,231contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of O75143 Hypothetical protein KIAA0652; ENSEMBL:ENSP00000310321
26C09G12.5C09G12.5n/achrIV 3,479,529
27clec-207F36F12.5n/achrV 2,096,664C. elegans CLEC-207 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
28clec-136F35D11.7n/achrII 4,616,077C. elegans CLEC-136 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
29nas-17K03B8.2n/achrV 11,399,699nas-17 encodes an astacin-like metalloprotease.
30nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
31D2096.5D2096.5n/achrIV 8,359,422
32clec-95ZK39.2n/achrI 11,149,626C. elegans CLEC-95 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
34T21D12.7T21D12.7n/achrIV 290,077contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR013090 (Phospholipase A2, active site), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
35Y26D4A.2Y26D4A.2n/achrI 13,067,990contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
36W02B3.7W02B3.7n/achrIII 691,490contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
37F19H6.6F19H6.6n/achrX 12,362,704contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Cytoplasmic protein of unknown function, potential Cdc28p substrate; SGD:YAL031C
38T10D4.7T10D4.7n/achrII 3,118,051contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
39R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
40Y43F8C.16Y43F8C.16n/achrV 19,710,255contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG31439-PA;; FLYBASE:CG31439
41F49F1.3F49F1.3n/achrIV 4,115,363contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
42clec-221F17C11.5n/achrV 10,953,943C. elegans CLEC-221 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43M7.10M7.10n/achrIV 11,102,300contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR001703 (Alpha-fetoprotein), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
44C16C8.10C16C8.10n/achrII 3,464,412
45clec-126W09G10.5n/achrII 3,519,952C. elegans CLEC-126 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
46F46A8.5F46A8.5n/achrI 11,240,086contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
47F46A8.4F46A8.4n/achrI 11,241,589contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
48K09C8.2K09C8.2n/achrX 10,960,143contains similarity to Homo sapiens Splice isoform Long of P30411 B2 bradykinin receptor; ENSEMBL:ENSP00000307713
49F20A1.2F20A1.2n/achrV 7,047,678contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50K12H6.5K12H6.5n/achrII 2,826,180